MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7004	NC_022221	TCC	2	6	1735373	1735378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_022221	GGA	2	6	1735388	1735393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_022221	TATT	2	8	1735394	1735401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7008	NC_022221	TAA	2	6	1735434	1735439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_022221	GAA	2	6	1735460	1735465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_022221	AAT	2	6	1735468	1735473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_022221	GAA	2	6	1735514	1735519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_022221	TAGG	2	8	1735521	1735528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_022221	CGGG	2	8	1736179	1736186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7014	NC_022221	AAC	2	6	1736192	1736197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7019	NC_022221	GGT	2	6	1736511	1736516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7065	NC_022221	A	6	6	1745315	1745320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_022221	GCA	2	6	1752436	1752441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7103	NC_022221	CTGT	2	8	1752451	1752458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7104	NC_022221	GCG	2	6	1752466	1752471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_022221	CATGG	2	10	1752595	1752604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7107	NC_022221	GGC	2	6	1752905	1752910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7109	NC_022221	GAT	2	6	1752981	1752986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7111	NC_022221	CAC	2	6	1753128	1753133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_022221	AAAT	2	8	1754282	1754289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_022221	AATTT	2	10	1754294	1754303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_022221	GA	3	6	1754454	1754459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_022221	GAC	2	6	1754520	1754525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7117	NC_022221	A	6	6	1754559	1754564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_022221	A	7	7	1754592	1754598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_022221	T	6	6	1754627	1754632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_022221	CAA	2	6	1756312	1756317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_022221	A	6	6	1756387	1756392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_022221	TA	3	6	1756638	1756643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7128	NC_022221	T	6	6	1760209	1760214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_022221	TA	3	6	1760234	1760239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_022221	GCG	2	6	1760256	1760261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7132	NC_022221	ATCC	2	8	1760349	1760356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7133	NC_022221	ATG	2	6	1760380	1760385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_022221	AAT	2	6	1761098	1761103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7137	NC_022221	TA	3	6	1761976	1761981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7138	NC_022221	GC	3	6	1761984	1761989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7242	NC_022221	AAAG	2	8	1793476	1793483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7250	NC_022221	TCG	2	6	1796219	1796224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7251	NC_022221	T	6	6	1796251	1796256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7263	NC_022221	CCA	2	6	1796784	1796789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7264	NC_022221	CAG	2	6	1796797	1796802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7265	NC_022221	CTT	2	6	1796835	1796840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7266	NC_022221	GTC	3	9	1796884	1796892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7268	NC_022221	GCA	2	6	1796908	1796913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7271	NC_022221	CCGG	2	8	1797044	1797051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7276	NC_022221	GC	3	6	1800109	1800114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7277	NC_022221	T	6	6	1800148	1800153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7292	NC_022221	TTTTA	2	10	1808016	1808025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7304	NC_022221	CTG	2	6	1811179	1811184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7313	NC_022221	A	7	7	1812491	1812497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7394	NC_022221	CGC	2	6	1838436	1838441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7395	NC_022221	TTA	2	6	1838490	1838495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7396	NC_022221	GTA	2	6	1838521	1838526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7397	NC_022221	CTT	2	6	1838533	1838538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7398	NC_022221	CGG	2	6	1840031	1840036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7399	NC_022221	GTC	2	6	1840095	1840100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7400	NC_022221	TAT	2	6	1840122	1840127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7401	NC_022221	TTTG	2	8	1840148	1840155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7402	NC_022221	ATT	3	9	1840200	1840208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7403	NC_022221	CAT	2	6	1840260	1840265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7404	NC_022221	GC	3	6	1840659	1840664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7405	NC_022221	A	6	6	1840670	1840675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7406	NC_022221	GCGTC	2	10	1840708	1840717	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7407	NC_022221	TGT	2	6	1840762	1840767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7408	NC_022221	GAT	2	6	1841105	1841110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7409	NC_022221	T	6	6	1841110	1841115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7410	NC_022221	GCA	2	6	1841118	1841123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7411	NC_022221	CAACC	2	10	1841331	1841340	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7412	NC_022221	CG	3	6	1841369	1841374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7413	NC_022221	AGG	2	6	1846056	1846061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7414	NC_022221	CGA	2	6	1846063	1846068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7415	NC_022221	GGACA	2	10	1847775	1847784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7416	NC_022221	CGC	2	6	1849768	1849773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7417	NC_022221	A	6	6	1851958	1851963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7418	NC_022221	AT	3	6	1851975	1851980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7419	NC_022221	TCAC	2	8	1852006	1852013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7420	NC_022221	ACTTT	2	10	1852028	1852037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7421	NC_022221	GAT	2	6	1852040	1852045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7422	NC_022221	TGAG	2	8	1852181	1852188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7423	NC_022221	TCC	2	6	1853059	1853064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7424	NC_022221	A	6	6	1853419	1853424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7425	NC_022221	AAG	2	6	1853462	1853467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7426	NC_022221	T	7	7	1853523	1853529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7427	NC_022221	T	6	6	1853546	1853551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7428	NC_022221	ATGA	2	8	1853554	1853561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7429	NC_022221	GC	3	6	1853566	1853571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7430	NC_022221	TGC	2	6	1853606	1853611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7431	NC_022221	CTT	2	6	1853648	1853653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7432	NC_022221	CCG	2	6	1853689	1853694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7433	NC_022221	TCA	2	6	1856282	1856287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7434	NC_022221	AGC	2	6	1856320	1856325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7435	NC_022221	CGA	2	6	1856337	1856342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7436	NC_022221	CCT	2	6	1856580	1856585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7437	NC_022221	TCT	2	6	1857582	1857587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7438	NC_022221	CGG	2	6	1857627	1857632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7439	NC_022221	ATA	2	6	1857684	1857689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7440	NC_022221	GTGA	2	8	1857728	1857735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7441	NC_022221	AAT	2	6	1860546	1860551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7442	NC_022221	CT	3	6	1861303	1861308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7443	NC_022221	TTA	2	6	1861325	1861330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7444	NC_022221	CCA	2	6	1861369	1861374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7445	NC_022221	TCC	2	6	1861672	1861677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7446	NC_022221	ATTA	2	8	1861724	1861731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7447	NC_022221	AAC	2	6	1861907	1861912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7448	NC_022221	TTTTA	2	10	1861937	1861946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7449	NC_022221	A	6	6	1862130	1862135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7450	NC_022221	TA	3	6	1862150	1862155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7451	NC_022221	TA	3	6	1862168	1862173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7452	NC_022221	TAT	2	6	1862179	1862184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7453	NC_022221	A	6	6	1862185	1862190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7454	NC_022221	T	6	6	1862239	1862244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7455	NC_022221	TTG	2	6	1862285	1862290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7456	NC_022221	ATT	2	6	1862313	1862318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7457	NC_022221	TTA	2	6	1863575	1863580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7458	NC_022221	T	6	6	1863660	1863665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7459	NC_022221	GAT	2	6	1863719	1863724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7464	NC_022221	A	6	6	1863872	1863877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7465	NC_022221	TTA	2	6	1863970	1863975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7469	NC_022221	ATG	2	6	1864297	1864302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7472	NC_022221	T	6	6	1864413	1864418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7473	NC_022221	TAT	2	6	1864421	1864426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7474	NC_022221	GGT	2	6	1864609	1864614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7475	NC_022221	GT	3	6	1864629	1864634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7479	NC_022221	GA	3	6	1865074	1865079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7480	NC_022221	TCC	2	6	1865401	1865406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7482	NC_022221	ATC	2	6	1865434	1865439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7483	NC_022221	TTA	2	6	1865445	1865450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7484	NC_022221	AAT	2	6	1865513	1865518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7485	NC_022221	CATTT	2	10	1865539	1865548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7486	NC_022221	ATA	2	6	1865596	1865601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7487	NC_022221	AC	3	6	1865643	1865648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7488	NC_022221	GTTCAA	2	12	1867831	1867842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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7491	NC_022221	ATT	2	6	1868415	1868420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7492	NC_022221	CAG	2	6	1868426	1868431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7493	NC_022221	AAGC	2	8	1868707	1868714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7494	NC_022221	CTC	2	6	1868833	1868838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7495	NC_022221	CAT	2	6	1868864	1868869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7496	NC_022221	TTC	2	6	1868880	1868885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7497	NC_022221	CTG	2	6	1869266	1869271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7500	NC_022221	TCC	2	6	1869330	1869335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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