MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022221	ACA	2	6	1626245	1626250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_022221	TAA	2	6	1626339	1626344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_022221	ATT	2	6	1626357	1626362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_022221	CAGA	2	8	1626402	1626409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6505	NC_022221	A	6	6	1626447	1626452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_022221	ATA	2	6	1627074	1627079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_022221	ATT	2	6	1627126	1627131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_022221	TGT	2	6	1628255	1628260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_022221	TTTCA	2	10	1628329	1628338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6510	NC_022221	ACA	2	6	1628382	1628387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_022221	TTC	2	6	1628388	1628393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_022221	TAAG	2	8	1628405	1628412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_022221	TAA	2	6	1628426	1628431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_022221	TGT	2	6	1628495	1628500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_022221	C	6	6	1628625	1628630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6516	NC_022221	CAC	2	6	1628637	1628642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_022221	TTAAT	2	10	1628730	1628739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_022221	AATG	2	8	1628746	1628753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_022221	A	6	6	1628757	1628762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_022221	T	7	7	1628830	1628836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_022221	TTTTA	2	10	1628887	1628896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_022221	CAT	2	6	1628923	1628928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_022221	CATT	2	8	1628943	1628950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6524	NC_022221	AAT	2	6	1628951	1628956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_022221	GAT	2	6	1628996	1629001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_022221	TTTA	2	8	1629014	1629021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_022221	ATATC	2	10	1629180	1629189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6528	NC_022221	ATCG	2	8	1629200	1629207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_022221	T	6	6	1629248	1629253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_022221	CAT	2	6	1629304	1629309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_022221	TGC	2	6	1629325	1629330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022221	AT	4	8	1629354	1629361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_022221	ATA	2	6	1629378	1629383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_022221	TTTA	2	8	1629406	1629413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_022221	TGA	2	6	1629430	1629435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_022221	A	6	6	1629435	1629440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_022221	AGA	2	6	1629469	1629474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_022221	A	6	6	1629508	1629513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_022221	A	8	8	1629566	1629573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_022221	ATA	2	6	1629605	1629610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_022221	CCA	2	6	1630194	1630199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_022221	GC	3	6	1630234	1630239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_022221	GTA	2	6	1630258	1630263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_022221	GCC	2	6	1630297	1630302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_022221	GCG	2	6	1630307	1630312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_022221	AGC	2	6	1630419	1630424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_022221	GAG	2	6	1630529	1630534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_022221	CAC	2	6	1630573	1630578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_022221	GAA	2	6	1630579	1630584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_022221	ACA	2	6	1630595	1630600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_022221	CGC	2	6	1630759	1630764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_022221	CA	3	6	1630821	1630826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_022221	T	7	7	1630861	1630867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_022221	ATT	2	6	1630870	1630875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_022221	CG	3	6	1630924	1630929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_022221	CT	3	6	1636570	1636575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_022221	CTG	2	6	1639331	1639336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_022221	CAA	2	6	1639382	1639387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_022221	CCG	2	6	1639465	1639470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_022221	GAC	2	6	1639475	1639480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_022221	AATT	2	8	1639578	1639585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_022221	AT	3	6	1639598	1639603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_022221	CTGC	2	8	1639661	1639668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_022221	A	6	6	1639694	1639699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_022221	CTA	2	6	1639729	1639734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_022221	TTGGCT	2	12	1641240	1641251	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6567	NC_022221	TAG	2	6	1642996	1643001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_022221	ATTT	2	8	1643394	1643401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_022221	TTCT	2	8	1643414	1643421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_022221	AT	3	6	1644950	1644955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_022221	TTA	2	6	1645957	1645962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_022221	TGTTAA	2	12	1645963	1645974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_022221	ATA	2	6	1645975	1645980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_022221	GC	3	6	1648900	1648905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_022221	G	6	6	1648920	1648925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_022221	TCG	2	6	1648964	1648969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_022221	AAC	2	6	1649009	1649014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_022221	CTA	2	6	1649094	1649099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_022221	CCG	2	6	1649162	1649167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_022221	CG	3	6	1649166	1649171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6581	NC_022221	CGCGG	2	10	1649205	1649214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6582	NC_022221	C	6	6	1649255	1649260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6583	NC_022221	TCA	2	6	1649306	1649311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_022221	TCG	2	6	1649316	1649321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_022221	GC	3	6	1649328	1649333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6586	NC_022221	CGA	2	6	1649343	1649348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_022221	CAA	2	6	1649394	1649399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_022221	CGCC	2	8	1649544	1649551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6589	NC_022221	GC	3	6	1649563	1649568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_022221	TCA	2	6	1649603	1649608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_022221	CCG	2	6	1649624	1649629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6592	NC_022221	C	6	6	1649783	1649788	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6593	NC_022221	GGC	2	6	1649790	1649795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_022221	GCA	2	6	1649910	1649915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_022221	GCG	2	6	1649967	1649972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_022221	GCC	2	6	1650020	1650025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_022221	CGC	2	6	1650064	1650069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_022221	GCCGG	2	10	1650083	1650092	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6599	NC_022221	CGAT	2	8	1650098	1650105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6600	NC_022221	CAT	2	6	1650114	1650119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_022221	TCT	2	6	1650218	1650223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_022221	ATT	2	6	1650253	1650258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_022221	T	6	6	1650270	1650275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_022221	ATG	2	6	1650364	1650369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_022221	T	6	6	1650381	1650386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_022221	GGA	2	6	1650399	1650404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_022221	T	6	6	1650437	1650442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_022221	AGG	2	6	1650465	1650470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_022221	AG	3	6	1650481	1650486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_022221	CAA	2	6	1650493	1650498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_022221	TGC	2	6	1652051	1652056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_022221	TCA	2	6	1652848	1652853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_022221	GAA	2	6	1652890	1652895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_022221	CTTG	2	8	1652947	1652954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6615	NC_022221	TCG	2	6	1652958	1652963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_022221	CGCT	2	8	1652964	1652971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_022221	CT	3	6	1652973	1652978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6618	NC_022221	ATT	2	6	1654636	1654641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_022221	GAATT	2	10	1654664	1654673	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_022221	ATT	2	6	1654710	1654715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_022221	AC	3	6	1655248	1655253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6622	NC_022221	T	8	8	1655269	1655276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_022221	GTT	2	6	1655286	1655291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_022221	CAC	2	6	1655333	1655338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_022221	CAC	2	6	1655712	1655717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_022221	GCG	2	6	1655721	1655726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_022221	TCC	2	6	1655947	1655952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6628	NC_022221	A	6	6	1656078	1656083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_022221	GGTT	2	8	1656111	1656118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_022221	TTA	2	6	1656292	1656297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6632	NC_022221	T	6	6	1656336	1656341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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