MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 17980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022221	GCG	2	6	1403162	1403167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_022221	GTT	2	6	1403286	1403291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_022221	CCG	2	6	1403378	1403383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_022221	CCACGC	2	12	1403418	1403429	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_022221	CAG	2	6	1403521	1403526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_022221	GAG	2	6	1403527	1403532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_022221	ACT	2	6	1403565	1403570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_022221	CAA	2	6	1403571	1403576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_022221	GTT	2	6	1403637	1403642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_022221	CTT	2	6	1403654	1403659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_022221	GCT	2	6	1403678	1403683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_022221	CGT	2	6	1403783	1403788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_022221	ATCC	2	8	1403858	1403865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_022221	CAT	2	6	1403927	1403932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_022221	CAC	2	6	1404021	1404026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_022221	CAT	2	6	1404099	1404104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_022221	TCA	2	6	1404203	1404208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_022221	GAA	2	6	1404216	1404221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022221	AGT	2	6	1404239	1404244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022221	TGG	2	6	1404344	1404349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_022221	CCG	2	6	1404409	1404414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_022221	AGC	2	6	1404436	1404441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_022221	ATC	2	6	1404448	1404453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_022221	CCAGC	2	10	1404495	1404504	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5525	NC_022221	GGT	2	6	1404516	1404521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_022221	GC	3	6	1404533	1404538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_022221	CA	3	6	1404557	1404562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_022221	ACG	2	6	1404604	1404609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_022221	TGC	2	6	1404631	1404636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_022221	CAG	2	6	1404639	1404644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_022221	CA	4	8	1404649	1404656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_022221	TCA	2	6	1404676	1404681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_022221	AGG	2	6	1404719	1404724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_022221	TCA	2	6	1404772	1404777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_022221	ATC	2	6	1404786	1404791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_022221	CAG	2	6	1404798	1404803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_022221	TTA	2	6	1404979	1404984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_022221	GCC	2	6	1405038	1405043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_022221	CATCAC	2	12	1405044	1405055	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_022221	TGGT	2	8	1405084	1405091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_022221	CG	3	6	1405148	1405153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_022221	GA	3	6	1405179	1405184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_022221	GCC	2	6	1405225	1405230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_022221	AG	3	6	1405251	1405256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_022221	GC	3	6	1405385	1405390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_022221	GC	3	6	1405460	1405465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_022221	GAT	2	6	1405478	1405483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_022221	CTT	2	6	1405511	1405516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_022221	T	6	6	1405522	1405527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_022221	GC	3	6	1405605	1405610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_022221	GTT	2	6	1405674	1405679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_022221	CCGC	2	8	1405689	1405696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5553	NC_022221	A	6	6	1405706	1405711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_022221	T	6	6	1405743	1405748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_022221	A	6	6	1405923	1405928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_022221	TTG	2	6	1406041	1406046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_022221	CGGG	2	8	1406896	1406903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_022221	GATATT	2	12	1406906	1406917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_022221	CTC	2	6	1407010	1407015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_022221	AT	3	6	1407102	1407107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_022221	TTA	2	6	1407130	1407135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_022221	ATA	2	6	1407142	1407147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_022221	AGT	2	6	1407151	1407156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_022221	TAC	2	6	1407157	1407162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_022221	AT	3	6	1407205	1407210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_022221	TTA	2	6	1407212	1407217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_022221	CA	3	6	1407269	1407274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_022221	AAT	2	6	1407281	1407286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_022221	TTA	2	6	1407304	1407309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_022221	ATT	2	6	1407406	1407411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_022221	TGT	2	6	1408507	1408512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022221	GGCT	2	8	1408541	1408548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_022221	GC	3	6	1410630	1410635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_022221	T	6	6	1411405	1411410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022221	TTC	2	6	1411417	1411422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_022221	AGA	2	6	1411546	1411551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_022221	GTT	2	6	1411571	1411576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_022221	CG	3	6	1413198	1413203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_022221	CG	3	6	1413210	1413215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_022221	GGC	2	6	1413395	1413400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_022221	TTCG	2	8	1413405	1413412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_022221	GCT	2	6	1413443	1413448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_022221	CGC	2	6	1413529	1413534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_022221	CCG	2	6	1413651	1413656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_022221	ATT	2	6	1413677	1413682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_022221	CTT	2	6	1413727	1413732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_022221	TGGC	2	8	1413812	1413819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_022221	GC	3	6	1413840	1413845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_022221	GCC	2	6	1413921	1413926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_022221	GC	3	6	1413964	1413969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_022221	ATG	2	6	1413995	1414000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_022221	CG	3	6	1414001	1414006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_022221	TGG	2	6	1414014	1414019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_022221	AAT	2	6	1414037	1414042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_022221	GGC	2	6	1414150	1414155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_022221	CT	3	6	1414178	1414183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_022221	ATG	2	6	1414197	1414202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_022221	AGCG	2	8	1414325	1414332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_022221	GTC	2	6	1414337	1414342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_022221	AAT	2	6	1414409	1414414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_022221	AAC	2	6	1414418	1414423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_022221	GAT	2	6	1414537	1414542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_022221	GAT	2	6	1414597	1414602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_022221	CGG	3	9	1414639	1414647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_022221	GGCT	2	8	1414691	1414698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_022221	CTGGA	2	10	1414715	1414724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_022221	CGCC	2	8	1414727	1414734	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5608	NC_022221	GCCA	2	8	1414772	1414779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_022221	ACTG	2	8	1414795	1414802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5610	NC_022221	CGC	2	6	1414818	1414823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_022221	GC	3	6	1414870	1414875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_022221	GGCT	2	8	1414886	1414893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_022221	AGCG	2	8	1414936	1414943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_022221	GCG	2	6	1414964	1414969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_022221	ATTT	2	8	1415052	1415059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_022221	CTC	2	6	1415083	1415088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_022221	CTG	2	6	1415120	1415125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_022221	CCG	2	6	1415202	1415207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_022221	CTGT	2	8	1415263	1415270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_022221	CCG	2	6	1415358	1415363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_022221	CCTG	2	8	1415372	1415379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_022221	GT	4	8	1415435	1415442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_022221	CGG	2	6	1415499	1415504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_022221	TCG	2	6	1415583	1415588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_022221	CTG	2	6	1415642	1415647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_022221	CGG	2	6	1415662	1415667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_022221	AGA	2	6	1415896	1415901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_022221	CAA	2	6	1416053	1416058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_022221	GC	3	6	1416082	1416087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_022221	TGG	2	6	1416102	1416107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_022221	CCG	2	6	1416116	1416121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5632	NC_022221	CGC	2	6	1416198	1416203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5633	NC_022221	CTG	2	6	1416242	1416247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_022221	CG	3	6	1416261	1416266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5635	NC_022221	GGT	2	6	1416373	1416378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_022221	CAGC	2	8	1416379	1416386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5637	NC_022221	CCG	2	6	1416392	1416397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5640	NC_022221	CGG	2	6	1416523	1416528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5643	NC_022221	ATG	2	6	1416630	1416635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5654	NC_022221	CTGA	2	8	1420115	1420122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5662	NC_022221	A	6	6	1420612	1420617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_022221	CATTAA	2	12	1421474	1421485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5665	NC_022221	A	7	7	1421569	1421575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5666	NC_022221	CGC	2	6	1421660	1421665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5685	NC_022221	CTTAA	2	10	1426055	1426064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5760	NC_022221	A	6	6	1445329	1445334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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