MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 23922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021984	AAAT	2	8	3194831	3194838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_021984	AAAT	2	8	3194901	3194908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_021984	ATG	2	6	3194927	3194932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_021984	TGGC	2	8	3195036	3195043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17005	NC_021984	AAG	2	6	3195072	3195077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_021984	CTT	2	6	3196276	3196281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_021984	AG	3	6	3199338	3199343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_021984	GCC	2	6	3199385	3199390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_021984	AACA	2	8	3199454	3199461	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17010	NC_021984	TCT	2	6	3199468	3199473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_021984	CTT	2	6	3199482	3199487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_021984	TGA	2	6	3199538	3199543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_021984	TAA	2	6	3199565	3199570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_021984	TTA	2	6	3200648	3200653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_021984	TAT	2	6	3200687	3200692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_021984	AAT	2	6	3200780	3200785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_021984	AAT	2	6	3200803	3200808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_021984	TCGCT	2	10	3200832	3200841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17019	NC_021984	ATT	2	6	3200854	3200859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_021984	ACA	2	6	3200870	3200875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_021984	AAT	3	9	3200883	3200891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_021984	AAT	2	6	3201003	3201008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_021984	TCA	2	6	3201020	3201025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_021984	AT	3	6	3201026	3201031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_021984	AAT	2	6	3201183	3201188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_021984	ATT	2	6	3201196	3201201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_021984	ACA	2	6	3201252	3201257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_021984	CGA	2	6	3201288	3201293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17030	NC_021984	GCT	2	6	3203344	3203349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_021984	ACC	2	6	3203363	3203368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17032	NC_021984	ATA	2	6	3203395	3203400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_021984	CGG	3	9	3203438	3203446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_021984	TAT	2	6	3203563	3203568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_021984	TTG	2	6	3203661	3203666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_021984	CA	3	6	3203709	3203714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17037	NC_021984	CCG	2	6	3203717	3203722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17038	NC_021984	GTT	2	6	3203824	3203829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_021984	GCG	2	6	3203843	3203848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17040	NC_021984	CTG	2	6	3203942	3203947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_021984	CAC	2	6	3203972	3203977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17042	NC_021984	GTG	2	6	3204041	3204046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_021984	ATG	2	6	3204060	3204065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_021984	CGG	2	6	3204135	3204140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17045	NC_021984	GAAC	2	8	3204181	3204188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17046	NC_021984	ATG	2	6	3204257	3204262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_021984	GTA	2	6	3204272	3204277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_021984	GTC	2	6	3204280	3204285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_021984	CTG	2	6	3204303	3204308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_021984	CGCTT	2	10	3204310	3204319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17051	NC_021984	GT	3	6	3204333	3204338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_021984	GCTC	2	8	3204425	3204432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17053	NC_021984	AGGC	2	8	3204433	3204440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17054	NC_021984	TGAT	2	8	3204559	3204566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_021984	CAGC	2	8	3204578	3204585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17056	NC_021984	CCG	2	6	3204590	3204595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17057	NC_021984	CG	3	6	3204610	3204615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17058	NC_021984	CCT	2	6	3204633	3204638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17059	NC_021984	A	6	6	3204651	3204656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_021984	GCT	2	6	3204657	3204662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17061	NC_021984	CTG	2	6	3204690	3204695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_021984	CCG	2	6	3204718	3204723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17063	NC_021984	TCG	2	6	3204792	3204797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_021984	GCCC	2	8	3204818	3204825	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17065	NC_021984	CAG	2	6	3204832	3204837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17067	NC_021984	CCG	2	6	3204915	3204920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17068	NC_021984	GCC	2	6	3204953	3204958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17071	NC_021984	AAT	2	6	3206087	3206092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_021984	ATA	2	6	3206115	3206120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_021984	ACC	2	6	3206390	3206395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17074	NC_021984	GAA	2	6	3212747	3212752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17076	NC_021984	ATA	2	6	3212806	3212811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_021984	TAAT	2	8	3212852	3212859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_021984	ATA	2	6	3212869	3212874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_021984	CCT	2	6	3213178	3213183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17080	NC_021984	TA	3	6	3213191	3213196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_021984	TA	3	6	3213203	3213208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_021984	T	6	6	3213244	3213249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17084	NC_021984	AT	3	6	3214977	3214982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_021984	T	7	7	3214996	3215002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_021984	TA	3	6	3215035	3215040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17087	NC_021984	TTA	2	6	3215070	3215075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_021984	GTA	2	6	3215094	3215099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17090	NC_021984	AAG	2	6	3215143	3215148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_021984	CCG	2	6	3215191	3215196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17092	NC_021984	CGG	2	6	3215201	3215206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17094	NC_021984	GC	3	6	3215826	3215831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17095	NC_021984	GTA	2	6	3215850	3215855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_021984	GCC	2	6	3215889	3215894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17097	NC_021984	GCG	2	6	3215899	3215904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17098	NC_021984	T	8	8	3216497	3216504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_021984	TGT	2	6	3217411	3217416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17100	NC_021984	GTA	2	6	3217462	3217467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_021984	A	6	6	3218457	3218462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_021984	CAG	2	6	3218500	3218505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17103	NC_021984	A	6	6	3219809	3219814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_021984	AT	3	6	3221134	3221139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_021984	TTG	2	6	3221169	3221174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_021984	GA	3	6	3222983	3222988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_021984	ATG	2	6	3223008	3223013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17108	NC_021984	GCC	2	6	3223029	3223034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17109	NC_021984	T	6	6	3224234	3224239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_021984	CGA	2	6	3225189	3225194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_021984	GTC	2	6	3225196	3225201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17112	NC_021984	T	6	6	3225206	3225211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_021984	CA	4	8	3225264	3225271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17114	NC_021984	ATT	2	6	3225280	3225285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17115	NC_021984	TAT	2	6	3225313	3225318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_021984	A	8	8	3225368	3225375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_021984	TATTCT	2	12	3225402	3225413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17118	NC_021984	CGC	2	6	3225420	3225425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17119	NC_021984	GC	3	6	3225461	3225466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17120	NC_021984	ATT	2	6	3225484	3225489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_021984	CGA	2	6	3225497	3225502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17122	NC_021984	TGC	2	6	3225524	3225529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17123	NC_021984	TAT	2	6	3225546	3225551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_021984	TGC	2	6	3225579	3225584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17125	NC_021984	GCG	2	6	3225602	3225607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17126	NC_021984	GAGC	2	8	3225624	3225631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17127	NC_021984	TCG	3	9	3225656	3225664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17129	NC_021984	CG	3	6	3225816	3225821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17142	NC_021984	GCTC	2	8	3226247	3226254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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17251	NC_021984	T	7	7	3239633	3239639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17258	NC_021984	GCG	2	6	3242801	3242806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17259	NC_021984	GCG	2	6	3242833	3242838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17261	NC_021984	ATTG	2	8	3244780	3244787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17288	NC_021984	T	6	6	3252507	3252512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17291	NC_021984	GGC	2	6	3252610	3252615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17334	NC_021984	A	8	8	3261365	3261372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17335	NC_021984	TGA	2	6	3261454	3261459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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