MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 23922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021984	GCG	2	6	2768866	2768871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_021984	CGA	2	6	2768887	2768892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_021984	ACG	2	6	2768902	2768907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_021984	GGCA	2	8	2768942	2768949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15005	NC_021984	CCA	2	6	2768962	2768967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15006	NC_021984	TGA	2	6	2769029	2769034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_021984	A	6	6	2772764	2772769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_021984	ACG	2	6	2772782	2772787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_021984	CAA	2	6	2772795	2772800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_021984	CGC	2	6	2774241	2774246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15011	NC_021984	AGA	2	6	2774256	2774261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_021984	GC	4	8	2774274	2774281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15013	NC_021984	CG	3	6	2774409	2774414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15014	NC_021984	GTTG	2	8	2774481	2774488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_021984	GAA	2	6	2774563	2774568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_021984	CGC	2	6	2774751	2774756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15017	NC_021984	CTG	2	6	2774893	2774898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_021984	GAT	2	6	2775060	2775065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_021984	CTTT	2	8	2775101	2775108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15020	NC_021984	ATT	2	6	2775133	2775138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_021984	GGC	2	6	2775168	2775173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_021984	CTG	2	6	2775175	2775180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_021984	A	7	7	2775206	2775212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_021984	GCC	2	6	2775234	2775239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15025	NC_021984	GGA	2	6	2775290	2775295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_021984	CAG	2	6	2775330	2775335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_021984	GC	3	6	2775457	2775462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15028	NC_021984	CGC	2	6	2775503	2775508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15029	NC_021984	GAT	2	6	2775527	2775532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_021984	GCG	2	6	2775553	2775558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_021984	GC	3	6	2775564	2775569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15032	NC_021984	GCA	2	6	2775572	2775577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_021984	GCG	2	6	2775585	2775590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_021984	ACA	2	6	2775604	2775609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_021984	TCC	2	6	2775664	2775669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15036	NC_021984	ACG	2	6	2775712	2775717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_021984	GGCG	2	8	2775824	2775831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15038	NC_021984	GAT	2	6	2775839	2775844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_021984	CGC	2	6	2775903	2775908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15040	NC_021984	CG	3	6	2775932	2775937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15041	NC_021984	TTC	2	6	2775942	2775947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_021984	GA	3	6	2775958	2775963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_021984	GC	3	6	2775976	2775981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15044	NC_021984	GCG	3	9	2776024	2776032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_021984	GGC	2	6	2776045	2776050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_021984	ATC	2	6	2776066	2776071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_021984	TGC	3	9	2776135	2776143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_021984	TGA	2	6	2776166	2776171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_021984	GTC	2	6	2776251	2776256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15050	NC_021984	AAG	2	6	2776309	2776314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_021984	GATG	2	8	2776325	2776332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_021984	CGGAT	2	10	2776357	2776366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15053	NC_021984	AAG	2	6	2777596	2777601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_021984	CTTAC	2	10	2777640	2777649	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15055	NC_021984	A	7	7	2777733	2777739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_021984	ACG	2	6	2777749	2777754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_021984	AGC	2	6	2777768	2777773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_021984	TAA	2	6	2777775	2777780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_021984	CT	3	6	2777794	2777799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15060	NC_021984	AG	3	6	2777830	2777835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_021984	CCTG	2	8	2777865	2777872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_021984	GTCC	2	8	2777917	2777924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15063	NC_021984	GACT	2	8	2777947	2777954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15064	NC_021984	GTA	2	6	2777961	2777966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_021984	CCA	2	6	2778012	2778017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15066	NC_021984	GGC	2	6	2778067	2778072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_021984	CGT	2	6	2780521	2780526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_021984	C	6	6	2780529	2780534	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15069	NC_021984	CGTTCA	2	12	2780574	2780585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_021984	GAT	3	9	2780645	2780653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_021984	GCGG	2	8	2780679	2780686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15072	NC_021984	CGC	2	6	2780716	2780721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15073	NC_021984	CGG	2	6	2780750	2780755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_021984	GCA	2	6	2780772	2780777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_021984	CAT	2	6	2780783	2780788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_021984	CAA	2	6	2780794	2780799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15077	NC_021984	CG	3	6	2780893	2780898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15078	NC_021984	GCC	2	6	2780906	2780911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_021984	ACC	2	6	2780954	2780959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15080	NC_021984	CAT	2	6	2780966	2780971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_021984	TCG	2	6	2781152	2781157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_021984	CAG	2	6	2781209	2781214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15083	NC_021984	GCA	2	6	2781288	2781293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15084	NC_021984	GCC	2	6	2781306	2781311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15085	NC_021984	CCA	2	6	2781325	2781330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15086	NC_021984	GAGCA	2	10	2781421	2781430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15087	NC_021984	GCA	2	6	2781465	2781470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15088	NC_021984	TGC	2	6	2781513	2781518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_021984	TGCGG	2	10	2781627	2781636	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15090	NC_021984	GAC	2	6	2781643	2781648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_021984	AGTA	2	8	2781657	2781664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_021984	AAGC	2	8	2781686	2781693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15093	NC_021984	GCA	2	6	2781701	2781706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_021984	GCT	2	6	2781741	2781746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_021984	CTG	2	6	2781758	2781763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_021984	CAGC	2	8	2781839	2781846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15097	NC_021984	TCA	2	6	2781902	2781907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_021984	GCG	2	6	2781942	2781947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_021984	GCT	2	6	2782017	2782022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15100	NC_021984	TTG	2	6	2782078	2782083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_021984	TTCT	2	8	2782092	2782099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15102	NC_021984	CAT	2	6	2782115	2782120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_021984	GTT	2	6	2782161	2782166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_021984	CAT	2	6	2782181	2782186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_021984	ACA	2	6	2782205	2782210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_021984	CAGA	2	8	2782220	2782227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15107	NC_021984	CAG	2	6	2782329	2782334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_021984	TGG	2	6	2782367	2782372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_021984	TGC	2	6	2782401	2782406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_021984	GCA	2	6	2782411	2782416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_021984	GCC	2	6	2782459	2782464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15112	NC_021984	ATG	2	6	2782519	2782524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_021984	ATC	2	6	2782548	2782553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_021984	GCC	2	6	2782669	2782674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15115	NC_021984	TGC	2	6	2782677	2782682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_021984	CAG	2	6	2782698	2782703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_021984	GTC	2	6	2782728	2782733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_021984	GC	3	6	2782752	2782757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15119	NC_021984	ACC	2	6	2782758	2782763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_021984	ATC	2	6	2782872	2782877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_021984	CTG	2	6	2782943	2782948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_021984	GGCTCC	2	12	2782992	2783003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15123	NC_021984	TGCGA	2	10	2783004	2783013	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15124	NC_021984	TGT	2	6	2783068	2783073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_021984	TGCC	2	8	2783112	2783119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15126	NC_021984	TTC	2	6	2783124	2783129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15127	NC_021984	ACT	2	6	2783157	2783162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_021984	CAA	2	6	2783223	2783228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15129	NC_021984	CTG	2	6	2783241	2783246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_021984	CTGA	2	8	2783271	2783278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15131	NC_021984	GCG	2	6	2783293	2783298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15157	NC_021984	TTG	2	6	2786802	2786807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15246	NC_021984	T	7	7	2802937	2802943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15251	NC_021984	C	6	6	2807848	2807853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15255	NC_021984	AAAT	2	8	2809987	2809994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15256	NC_021984	AAT	2	6	2810070	2810075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15257	NC_021984	GCT	2	6	2810076	2810081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15258	NC_021984	A	6	6	2810116	2810121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15259	NC_021984	ACA	2	6	2810123	2810128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15263	NC_021984	TC	3	6	2810415	2810420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15264	NC_021984	TA	3	6	2810421	2810426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15265	NC_021984	AC	3	6	2811148	2811153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15269	NC_021984	CTG	2	6	2812012	2812017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15271	NC_021984	TGG	2	6	2812103	2812108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15272	NC_021984	CCA	2	6	2812228	2812233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15273	NC_021984	AAATC	2	10	2812264	2812273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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15278	NC_021984	TATC	2	8	2813351	2813358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15279	NC_021984	CT	3	6	2813428	2813433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15283	NC_021984	A	6	6	2813602	2813607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15371	NC_021984	CAT	2	6	2827914	2827919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15379	NC_021984	A	7	7	2829311	2829317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15380	NC_021984	AAAG	2	8	2830258	2830265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15381	NC_021984	T	6	6	2830282	2830287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15382	NC_021984	TGA	2	6	2830311	2830316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15383	NC_021984	A	6	6	2830323	2830328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15385	NC_021984	TACAC	2	10	2830402	2830411	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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15498	NC_021984	TCTT	2	8	2847271	2847278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15499	NC_021984	TTC	2	6	2847307	2847312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15500	NC_021984	GC	3	6	2847344	2847349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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