MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 23922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021984	CAT	2	6	1481419	1481424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_021984	GCC	2	6	1481443	1481448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_021984	CGG	2	6	1481473	1481478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_021984	GGC	2	6	1481521	1481526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_021984	ATT	2	6	1483215	1483220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021984	CGG	2	6	1483308	1483313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021984	ACA	2	6	1483321	1483326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_021984	GAT	2	6	1483331	1483336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021984	GCG	2	6	1483397	1483402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_021984	CTA	2	6	1483438	1483443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_021984	GC	3	6	1483445	1483450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_021984	CTGG	2	8	1483501	1483508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_021984	GTG	2	6	1483534	1483539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_021984	TCA	2	6	1483584	1483589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_021984	CGC	2	6	1483674	1483679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_021984	CG	3	6	1483720	1483725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_021984	TGC	2	6	1483742	1483747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_021984	GTC	2	6	1483825	1483830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_021984	TGGC	2	8	1483877	1483884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_021984	TGCGTT	2	12	1483888	1483899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8021	NC_021984	CTGCA	2	10	1483967	1483976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8022	NC_021984	CCG	2	6	1483980	1483985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_021984	AAT	2	6	1485087	1485092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021984	CTG	2	6	1485657	1485662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_021984	TAC	2	6	1485679	1485684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_021984	AAG	2	6	1485705	1485710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021984	CTT	2	6	1485727	1485732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_021984	T	7	7	1485731	1485737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_021984	AAT	2	6	1487295	1487300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021984	GAT	2	6	1487314	1487319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021984	AGGA	2	8	1487339	1487346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_021984	CAA	2	6	1487353	1487358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_021984	GCG	2	6	1487390	1487395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_021984	CAGCG	2	10	1488515	1488524	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8035	NC_021984	CATC	2	8	1488556	1488563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8036	NC_021984	GC	3	6	1488661	1488666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_021984	T	6	6	1488700	1488705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_021984	CGC	2	6	1488724	1488729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_021984	TGG	2	6	1488730	1488735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021984	GCT	2	6	1488814	1488819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_021984	CCA	2	6	1488829	1488834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_021984	TCG	2	6	1488871	1488876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_021984	ATCA	2	8	1488893	1488900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_021984	TAG	2	6	1489073	1489078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_021984	GCA	2	6	1489092	1489097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_021984	AAAC	2	8	1489209	1489216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8047	NC_021984	AAT	2	6	1489263	1489268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021984	GGC	3	9	1489276	1489284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_021984	GCC	2	6	1489319	1489324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_021984	AAT	2	6	1489388	1489393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021984	GC	4	8	1489683	1489690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_021984	GAAGA	2	10	1489854	1489863	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021984	A	6	6	1489863	1489868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021984	TAA	2	6	1489869	1489874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021984	TTA	2	6	1489906	1489911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_021984	GA	3	6	1489923	1489928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_021984	CAA	2	6	1489930	1489935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_021984	CA	3	6	1490328	1490333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_021984	TGA	2	6	1491221	1491226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021984	GCC	2	6	1491245	1491250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_021984	ATT	2	6	1492025	1492030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021984	A	6	6	1492049	1492054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021984	GTG	2	6	1492062	1492067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021984	TCA	2	6	1492092	1492097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_021984	CGC	2	6	1492173	1492178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_021984	ATT	2	6	1492196	1492201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_021984	TC	3	6	1492249	1492254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_021984	CTG	2	6	1492310	1492315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_021984	GGC	2	6	1492397	1492402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_021984	CCA	2	6	1492513	1492518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_021984	AGGA	2	8	1492543	1492550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_021984	GGCT	2	8	1492576	1492583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8073	NC_021984	GCC	2	6	1492601	1492606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_021984	GTT	2	6	1492721	1492726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_021984	GCA	2	6	1492795	1492800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_021984	CCG	2	6	1492849	1492854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_021984	CGCC	2	8	1492864	1492871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8078	NC_021984	GCT	2	6	1492943	1492948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_021984	ACA	2	6	1492961	1492966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_021984	GCC	2	6	1492989	1492994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8081	NC_021984	ACC	2	6	1493014	1493019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_021984	GAC	2	6	1493073	1493078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_021984	GGAA	2	8	1498539	1498546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021984	TGCC	2	8	1498571	1498578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_021984	GT	3	6	1498601	1498606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_021984	C	6	6	1498615	1498620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8087	NC_021984	AGC	2	6	1498660	1498665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_021984	T	6	6	1498676	1498681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_021984	A	6	6	1498695	1498700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_021984	CGC	2	6	1498718	1498723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_021984	GCA	2	6	1498747	1498752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_021984	GTA	2	6	1498892	1498897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021984	CGA	2	6	1499091	1499096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_021984	A	7	7	1499163	1499169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_021984	CCACT	2	10	1499182	1499191	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8096	NC_021984	ATCA	2	8	1499228	1499235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_021984	AT	3	6	1499249	1499254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021984	A	6	6	1499255	1499260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021984	A	7	7	1499267	1499273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_021984	AT	3	6	1499276	1499281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_021984	TTC	2	6	1499324	1499329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_021984	TAC	2	6	1499352	1499357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_021984	AAC	2	6	1499362	1499367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_021984	ACG	2	6	1499374	1499379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_021984	TGT	2	6	1499446	1499451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_021984	AAT	2	6	1499576	1499581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021984	T	7	7	1499647	1499653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_021984	TCC	2	6	1499690	1499695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_021984	TTC	2	6	1499737	1499742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_021984	TAA	2	6	1499769	1499774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021984	TTG	2	6	1499871	1499876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_021984	AAAGA	2	10	1499938	1499947	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021984	C	6	6	1499999	1500004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8114	NC_021984	AAG	2	6	1500012	1500017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_021984	ATCTTC	2	12	1500039	1500050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_021984	AT	3	6	1500073	1500078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_021984	ATG	2	6	1500118	1500123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021984	TACT	2	8	1500166	1500173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8119	NC_021984	AAC	2	6	1500252	1500257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_021984	TCA	2	6	1500262	1500267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_021984	TATTT	2	10	1500303	1500312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021984	T	7	7	1500310	1500316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021984	TAA	2	6	1500359	1500364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021984	TCA	2	6	1500418	1500423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_021984	GGCG	2	8	1500435	1500442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_021984	TAC	2	6	1500491	1500496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_021984	CTCG	2	8	1500501	1500508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_021984	TTA	2	6	1500553	1500558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021984	A	6	6	1500580	1500585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_021984	GTA	3	9	1500644	1500652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021984	AT	3	6	1500730	1500735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8258	NC_021984	T	8	8	1528005	1528012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8395	NC_021984	GAGT	2	8	1556165	1556172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8396	NC_021984	GAGC	2	8	1556206	1556213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8397	NC_021984	TA	3	6	1556249	1556254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8398	NC_021984	TCA	2	6	1556286	1556291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8399	NC_021984	ATC	2	6	1556301	1556306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8400	NC_021984	TCA	2	6	1556430	1556435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8401	NC_021984	C	6	6	1556486	1556491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8402	NC_021984	T	6	6	1556505	1556510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8403	NC_021984	GCG	2	6	1556513	1556518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8411	NC_021984	GAC	2	6	1557147	1557152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8416	NC_021984	T	6	6	1560422	1560427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8430	NC_021984	TTCGA	2	10	1562657	1562666	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8431	NC_021984	CAC	2	6	1562740	1562745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8434	NC_021984	CCT	2	6	1562879	1562884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8472	NC_021984	AAATT	2	10	1571479	1571488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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