MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021902	GTCGCC	2	12	1375575	1375586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_021902	GCC	2	6	1375593	1375598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_021902	GATT	2	8	1375604	1375611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021902	TGT	2	6	1375722	1375727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021902	TACT	2	8	1375814	1375821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_021902	ACG	2	6	1375834	1375839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021902	TCA	2	6	1375879	1375884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_021902	GCT	2	6	1375932	1375937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_021902	AAG	2	6	1375944	1375949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021902	GGA	2	6	1376060	1376065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021902	CCT	2	6	1376114	1376119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_021902	AAAC	2	8	1376141	1376148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_021902	TACA	2	8	1376193	1376200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_021902	TTGA	2	8	1376231	1376238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021902	TC	3	6	1376257	1376262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_021902	ATAG	2	8	1376272	1376279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021902	ATA	2	6	1376348	1376353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021902	T	6	6	1376416	1376421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021902	ATT	2	6	1376531	1376536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021902	T	6	6	1376593	1376598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021902	ATA	2	6	1376606	1376611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021902	GTC	2	6	1376613	1376618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_021902	ATG	2	6	1376622	1376627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021902	ATGA	2	8	1376652	1376659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021902	CTT	2	6	1376763	1376768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021902	A	6	6	1376790	1376795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021902	ATT	2	6	1376802	1376807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021902	TTTG	2	8	1376811	1376818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021902	TAG	2	6	1376888	1376893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021902	AAT	2	6	1377862	1377867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021902	TCA	2	6	1377905	1377910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021902	TC	3	6	1378067	1378072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_021902	AAGG	2	8	1378132	1378139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021902	A	7	7	1379752	1379758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021902	AT	3	6	1379771	1379776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021902	TGT	2	6	1381045	1381050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021902	AAT	2	6	1381109	1381114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021902	AGG	2	6	1381161	1381166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021902	GATGC	2	10	1381208	1381217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3540	NC_021902	TAA	2	6	1381253	1381258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021902	A	6	6	1381257	1381262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021902	AT	3	6	1381302	1381307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021902	TAA	2	6	1381342	1381347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021902	TG	3	6	1381380	1381385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021902	TA	3	6	1381411	1381416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021902	T	7	7	1381462	1381468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021902	TAT	2	6	1381474	1381479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021902	ATA	2	6	1382004	1382009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021902	TGC	2	6	1382013	1382018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021902	TGA	2	6	1382095	1382100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021902	A	6	6	1382750	1382755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021902	GA	3	6	1382774	1382779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021902	CTA	2	6	1382797	1382802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021902	TGC	2	6	1382803	1382808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021902	A	6	6	1382842	1382847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021902	AG	3	6	1382862	1382867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021902	A	6	6	1382875	1382880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021902	CAT	2	6	1382915	1382920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021902	TTC	2	6	1382932	1382937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021902	TTA	2	6	1383005	1383010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021902	TCG	2	6	1383061	1383066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021902	AT	3	6	1383415	1383420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021902	GC	5	10	1383430	1383439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_021902	CAT	2	6	1389484	1389489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021902	CA	3	6	1392432	1392437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_021902	TA	3	6	1392812	1392817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021902	GAC	2	6	1392867	1392872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021902	CGC	2	6	1392891	1392896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_021902	T	6	6	1392914	1392919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021902	TCCT	2	8	1394228	1394235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_021902	AAC	2	6	1394262	1394267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021902	ATG	2	6	1394276	1394281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021902	ATC	2	6	1394307	1394312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021902	T	6	6	1394319	1394324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021902	ATTG	2	8	1394336	1394343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021902	TGAA	2	8	1399326	1399333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021902	GCC	2	6	1399371	1399376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_021902	AGCG	2	8	1399381	1399388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_021902	CCCGT	2	10	1399416	1399425	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3580	NC_021902	TAC	2	6	1399608	1399613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021902	GAC	2	6	1399632	1399637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_021902	CAGC	2	8	1399673	1399680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_021902	A	8	8	1399684	1399691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021902	CGTTT	2	10	1399743	1399752	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3585	NC_021902	TA	4	8	1399793	1399800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021902	GGGA	2	8	1399804	1399811	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021902	TCG	2	6	1402377	1402382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_021902	ATT	2	6	1402468	1402473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021902	CCG	2	6	1403590	1403595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021902	T	6	6	1403625	1403630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021902	TAA	2	6	1403687	1403692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021902	TTA	2	6	1406530	1406535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021902	GAT	2	6	1406548	1406553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021902	GTT	2	6	1406592	1406597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021902	ACT	2	6	1406642	1406647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021902	GAT	2	6	1406688	1406693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021902	TAA	3	9	1406698	1406706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021902	CAT	2	6	1407006	1407011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_021902	CGG	2	6	1407033	1407038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021902	TCA	2	6	1407102	1407107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_021902	T	6	6	1408786	1408791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021902	TTTTC	2	10	1408863	1408872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3603	NC_021902	CTTTG	2	10	1408970	1408979	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3604	NC_021902	AAGGCG	2	12	1409926	1409937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3605	NC_021902	TACGG	2	10	1409977	1409986	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3606	NC_021902	AAT	2	6	1410016	1410021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021902	TTA	2	6	1411211	1411216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021902	G	7	7	1414677	1414683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021902	GC	3	6	1414704	1414709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_021902	GCAG	2	8	1415747	1415754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_021902	CTT	2	6	1415817	1415822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_021902	TA	3	6	1415824	1415829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021902	GTT	2	6	1415883	1415888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021902	ATT	2	6	1415933	1415938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021902	TATAT	2	10	1415971	1415980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021902	T	7	7	1415989	1415995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021902	GAG	2	6	1416197	1416202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021902	CTA	2	6	1416291	1416296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_021902	GAT	2	6	1416347	1416352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021902	TGG	2	6	1416379	1416384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021902	ACA	2	6	1416393	1416398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021902	CTT	2	6	1416549	1416554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021902	TGA	3	9	1416619	1416627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021902	GAT	2	6	1416662	1416667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021902	CTG	2	6	1416750	1416755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_021902	TAATAT	2	12	1416790	1416801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021902	GAA	2	6	1416944	1416949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021902	GAT	2	6	1417010	1417015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021902	TTG	2	6	1417029	1417034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021902	ACGTT	2	10	1417068	1417077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3631	NC_021902	GTC	2	6	1417103	1417108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_021902	GAT	2	6	1417157	1417162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3764	NC_021902	GGC	2	6	1470327	1470332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3883	NC_021902	AATC	2	8	1520154	1520161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3889	NC_021902	ATGT	2	8	1524703	1524710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3890	NC_021902	TGTT	2	8	1525438	1525445	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3892	NC_021902	CG	3	6	1528887	1528892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3893	NC_021902	GC	3	6	1528903	1528908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3894	NC_021902	TTG	2	6	1529862	1529867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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