MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_021902	CGC	2	6	4789995	4790000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_021902	AGCA	2	8	4790667	4790674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12504	NC_021902	A	6	6	4790678	4790683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_021902	GCC	2	6	4790700	4790705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_021902	T	6	6	4790706	4790711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_021902	CCA	2	6	4790737	4790742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_021902	TGT	2	6	4790795	4790800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_021902	CCT	2	6	4790861	4790866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_021902	TTACT	2	10	4790924	4790933	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12511	NC_021902	T	7	7	4790975	4790981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_021902	TTAC	2	8	4791100	4791107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12513	NC_021902	CCG	2	6	4791112	4791117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_021902	TGAC	2	8	4791170	4791177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12515	NC_021902	GAC	2	6	4791181	4791186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_021902	A	6	6	4791901	4791906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_021902	ACTG	2	8	4791921	4791928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12518	NC_021902	GGC	2	6	4791930	4791935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_021902	T	6	6	4792026	4792031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_021902	T	8	8	4792059	4792066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_021902	A	6	6	4792132	4792137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_021902	ATT	2	6	4795144	4795149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_021902	GTT	2	6	4795158	4795163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_021902	GTT	2	6	4795216	4795221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12530	NC_021902	TAC	2	6	4797896	4797901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12532	NC_021902	CGG	2	6	4799416	4799421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_021902	GCGCT	2	10	4799438	4799447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12534	NC_021902	A	6	6	4799483	4799488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12538	NC_021902	TGC	2	6	4799573	4799578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_021902	CGG	2	6	4799599	4799604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_021902	TCC	2	6	4799610	4799615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_021902	ACC	2	6	4799787	4799792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12542	NC_021902	GCC	2	6	4799801	4799806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_021902	AATCTG	2	12	4799847	4799858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12544	NC_021902	TC	3	6	4799871	4799876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_021902	AC	3	6	4799958	4799963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_021902	CGT	3	9	4799976	4799984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12548	NC_021902	C	6	6	4800162	4800167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12549	NC_021902	ACG	2	6	4800211	4800216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12553	NC_021902	CCT	2	6	4800488	4800493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_021902	CTC	2	6	4800525	4800530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12556	NC_021902	CCA	2	6	4800569	4800574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_021902	GGT	2	6	4800629	4800634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_021902	CAT	2	6	4800824	4800829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_021902	GCC	2	6	4800899	4800904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_021902	TAA	2	6	4801024	4801029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_021902	CAGC	2	8	4801037	4801044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_021902	GACT	2	8	4801055	4801062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12563	NC_021902	TC	3	6	4801153	4801158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12564	NC_021902	ACC	2	6	4801183	4801188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12568	NC_021902	C	6	6	4801383	4801388	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12569	NC_021902	AC	3	6	4801588	4801593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12572	NC_021902	CTTT	2	8	4801717	4801724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12578	NC_021902	TCGGT	2	10	4802069	4802078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12579	NC_021902	CA	3	6	4802253	4802258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12581	NC_021902	GTCA	2	8	4802366	4802373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12597	NC_021902	GAAGC	2	10	4803120	4803129	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12598	NC_021902	CAA	2	6	4803155	4803160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_021902	ACC	2	6	4803199	4803204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12600	NC_021902	ACC	2	6	4803234	4803239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12601	NC_021902	TCA	2	6	4803277	4803282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_021902	TG	3	6	4803290	4803295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_021902	TAAGG	2	10	4803318	4803327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_021902	CTAC	2	8	4803423	4803430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12605	NC_021902	GT	3	6	4803466	4803471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_021902	ACG	2	6	4803567	4803572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_021902	GT	3	6	4803635	4803640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_021902	ATG	2	6	4803660	4803665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12611	NC_021902	GAC	2	6	4803799	4803804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_021902	GCA	2	6	4803811	4803816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_021902	TTC	2	6	4803887	4803892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_021902	GCC	2	6	4804130	4804135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12615	NC_021902	TCC	2	6	4804150	4804155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_021902	C	6	6	4804194	4804199	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12617	NC_021902	TGCG	2	8	4804282	4804289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12629	NC_021902	CA	3	6	4804976	4804981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.