MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021902	C	6	6	4226207	4226212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11002	NC_021902	GCC	2	6	4227533	4227538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_021902	GGC	2	6	4227570	4227575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_021902	T	6	6	4230116	4230121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_021902	TCA	2	6	4230711	4230716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_021902	GGA	2	6	4230720	4230725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_021902	CAG	2	6	4230853	4230858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_021902	GTCC	2	8	4231331	4231338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_021902	GAC	2	6	4231357	4231362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_021902	GCG	2	6	4231401	4231406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_021902	T	6	6	4232067	4232072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_021902	GAGG	2	8	4232097	4232104	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_021902	CCTC	2	8	4232109	4232116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11014	NC_021902	GAT	2	6	4232149	4232154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_021902	CAG	2	6	4232164	4232169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_021902	ATG	2	6	4232171	4232176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021902	TCA	2	6	4232184	4232189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_021902	CCTTT	2	10	4232195	4232204	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11019	NC_021902	ACA	2	6	4232284	4232289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_021902	A	8	8	4233721	4233728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_021902	CGT	2	6	4233759	4233764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_021902	T	6	6	4233886	4233891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_021902	TGG	2	6	4233911	4233916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021902	A	7	7	4234704	4234710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_021902	ACA	2	6	4234726	4234731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_021902	CT	3	6	4235627	4235632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11029	NC_021902	A	6	6	4235835	4235840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021902	TC	3	6	4236640	4236645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11031	NC_021902	TGT	2	6	4236711	4236716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_021902	ATT	2	6	4237417	4237422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_021902	GGA	2	6	4237558	4237563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_021902	CAT	2	6	4238528	4238533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_021902	A	6	6	4238537	4238542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_021902	CTAA	2	8	4238577	4238584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_021902	CGC	2	6	4238585	4238590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_021902	A	7	7	4238608	4238614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021902	CAG	2	6	4238642	4238647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11041	NC_021902	A	6	6	4239765	4239770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021902	GCC	2	6	4239776	4239781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_021902	ATG	2	6	4241014	4241019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_021902	TCG	2	6	4242124	4242129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_021902	TTAA	2	8	4242182	4242189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_021902	GAA	2	6	4242248	4242253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_021902	TCG	2	6	4242348	4242353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_021902	TAT	2	6	4242401	4242406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_021902	GAC	2	6	4242869	4242874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_021902	TCCG	2	8	4244195	4244202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_021902	TA	3	6	4246800	4246805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_021902	AAT	2	6	4246811	4246816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_021902	AG	4	8	4246838	4246845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021902	ACC	2	6	4246847	4246852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_021902	CG	3	6	4246885	4246890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11056	NC_021902	GAA	2	6	4246912	4246917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021902	GA	3	6	4250594	4250599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021902	AAT	2	6	4251029	4251034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_021902	TTATT	2	10	4251057	4251066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_021902	AAAAT	2	10	4251089	4251098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021902	GGC	2	6	4251104	4251109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_021902	AATC	2	8	4251117	4251124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_021902	AGCG	2	8	4251135	4251142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11064	NC_021902	GTTATA	2	12	4251183	4251194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_021902	AATA	2	8	4251239	4251246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_021902	A	7	7	4251246	4251252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_021902	AAAT	2	8	4251298	4251305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_021902	TAAAAA	2	12	4251311	4251322	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021902	GAC	2	6	4253399	4253404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_021902	CAA	2	6	4253436	4253441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_021902	CG	3	6	4253454	4253459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11072	NC_021902	TGCC	2	8	4253535	4253542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_021902	ATA	2	6	4253601	4253606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_021902	GGC	2	6	4254407	4254412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_021902	ATCA	2	8	4254439	4254446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11076	NC_021902	AAC	2	6	4254482	4254487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_021902	CTT	2	6	4255420	4255425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_021902	A	7	7	4255435	4255441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_021902	CGT	2	6	4255450	4255455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_021902	CGA	2	6	4255462	4255467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11082	NC_021902	A	7	7	4255559	4255565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_021902	TA	3	6	4255566	4255571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_021902	ATT	2	6	4256540	4256545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11086	NC_021902	AAT	2	6	4257272	4257277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_021902	GCG	2	6	4260776	4260781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_021902	AAT	2	6	4260935	4260940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_021902	A	7	7	4260958	4260964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_021902	ACC	2	6	4261038	4261043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_021902	AAT	2	6	4261136	4261141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_021902	CAAAC	2	10	4261156	4261165	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11093	NC_021902	TAT	2	6	4261201	4261206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_021902	ATC	2	6	4261247	4261252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_021902	GCT	2	6	4261259	4261264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_021902	GAG	2	6	4261273	4261278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021902	GCC	2	6	4261282	4261287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_021902	A	6	6	4261330	4261335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021902	TGA	2	6	4261337	4261342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_021902	ATA	2	6	4261419	4261424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_021902	ACG	2	6	4261445	4261450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_021902	CGG	2	6	4261495	4261500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_021902	AGGG	2	8	4261503	4261510	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_021902	GAT	2	6	4261525	4261530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_021902	CGT	2	6	4261636	4261641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_021902	CGAT	2	8	4261842	4261849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_021902	TGG	2	6	4261869	4261874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021902	CT	3	6	4261965	4261970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_021902	GGC	2	6	4261985	4261990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_021902	AG	3	6	4262873	4262878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_021902	TTTC	2	8	4262885	4262892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_021902	CA	3	6	4262916	4262921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_021902	CCA	2	6	4262930	4262935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_021902	ATT	2	6	4263742	4263747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_021902	AAT	2	6	4263833	4263838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_021902	GTC	2	6	4265834	4265839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_021902	GC	3	6	4266173	4266178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_021902	CAG	2	6	4266200	4266205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_021902	GCC	2	6	4266241	4266246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11120	NC_021902	GAA	2	6	4266305	4266310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_021902	CGT	2	6	4266313	4266318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_021902	ATCC	2	8	4266506	4266513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11123	NC_021902	TCT	2	6	4266569	4266574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_021902	CTAA	2	8	4266604	4266611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11125	NC_021902	CAT	2	6	4267996	4268001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_021902	CATT	2	8	4268013	4268020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11127	NC_021902	ATT	2	6	4268128	4268133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11129	NC_021902	AAT	2	6	4268159	4268164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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