MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021902	ACAA	2	8	3841062	3841069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_021902	TGG	2	6	3841104	3841109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_021902	CGG	2	6	3841679	3841684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_021902	TGC	2	6	3841701	3841706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_021902	A	6	6	3842939	3842944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021902	CTT	2	6	3842967	3842972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_021902	TTA	2	6	3844186	3844191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_021902	GGT	2	6	3844202	3844207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_021902	TG	3	6	3845034	3845039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_021902	AAC	2	6	3845045	3845050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_021902	TAA	2	6	3845135	3845140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021902	CTG	2	6	3845143	3845148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_021902	CGG	2	6	3845160	3845165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_021902	GC	3	6	3845189	3845194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_021902	TC	3	6	3846640	3846645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_021902	CGC	2	6	3846668	3846673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_021902	TGT	2	6	3846722	3846727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_021902	CCA	3	9	3847627	3847635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_021902	ATC	2	6	3847653	3847658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_021902	T	6	6	3848925	3848930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021902	T	7	7	3850265	3850271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_021902	TTA	2	6	3850295	3850300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021902	TCA	2	6	3850342	3850347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_021902	A	6	6	3851278	3851283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_021902	T	6	6	3853002	3853007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_021902	CAA	2	6	3853030	3853035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_021902	TGA	2	6	3853072	3853077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_021902	TAT	2	6	3853084	3853089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_021902	TGA	2	6	3853502	3853507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021902	TCA	2	6	3853516	3853521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_021902	AC	3	6	3854266	3854271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_021902	ATA	2	6	3854399	3854404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021902	A	8	8	3854421	3854428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_021902	AGAT	2	8	3854483	3854490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021902	TCA	2	6	3854500	3854505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_021902	T	6	6	3855047	3855052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_021902	CATG	2	8	3855095	3855102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10038	NC_021902	AT	3	6	3855111	3855116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_021902	AATA	2	8	3855144	3855151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_021902	CAA	2	6	3855155	3855160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021902	AT	3	6	3855163	3855168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_021902	ATAA	2	8	3855320	3855327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_021902	A	6	6	3855326	3855331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021902	T	7	7	3855434	3855440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_021902	ATC	2	6	3855449	3855454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_021902	A	6	6	3855480	3855485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021902	A	6	6	3855531	3855536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_021902	TC	3	6	3855558	3855563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_021902	TTAA	2	8	3855615	3855622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_021902	CCA	2	6	3855694	3855699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_021902	A	6	6	3866821	3866826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_021902	ACG	2	6	3866839	3866844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_021902	CAA	2	6	3866852	3866857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_021902	TCA	2	6	3866931	3866936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_021902	AAG	2	6	3871654	3871659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_021902	CTTAC	2	10	3871698	3871707	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10057	NC_021902	A	7	7	3871791	3871797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021902	ACG	2	6	3871807	3871812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_021902	AGC	2	6	3871826	3871831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_021902	TAA	2	6	3871833	3871838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_021902	CT	3	6	3871852	3871857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10062	NC_021902	AG	3	6	3871888	3871893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_021902	CG	3	6	3871912	3871917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10064	NC_021902	CCTG	2	8	3871923	3871930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_021902	GTCC	2	8	3871975	3871982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_021902	GACT	2	8	3872005	3872012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_021902	GTA	2	6	3872019	3872024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_021902	CCA	2	6	3872070	3872075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_021902	TGT	2	6	3872114	3872119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_021902	TA	3	6	3872236	3872241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_021902	A	6	6	3872278	3872283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_021902	TTA	2	6	3872338	3872343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_021902	TAG	2	6	3872450	3872455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_021902	A	9	9	3872878	3872886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021902	TAC	2	6	3872960	3872965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_021902	CATC	2	8	3872994	3873001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10077	NC_021902	CAA	2	6	3873186	3873191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_021902	CTTA	2	8	3873246	3873253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_021902	CG	3	6	3873281	3873286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_021902	AAG	2	6	3873296	3873301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021902	GAT	2	6	3873384	3873389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_021902	AGT	2	6	3873545	3873550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_021902	CGTCA	2	10	3873573	3873582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10084	NC_021902	AGT	2	6	3873629	3873634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_021902	A	6	6	3873645	3873650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_021902	T	6	6	3873672	3873677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_021902	CTA	2	6	3873684	3873689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_021902	TTAC	2	8	3873739	3873746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10089	NC_021902	ATGTT	2	10	3873770	3873779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021902	GGC	2	6	3873818	3873823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_021902	ACC	2	6	3873858	3873863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_021902	GTTT	2	8	3873892	3873899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_021902	T	7	7	3873924	3873930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_021902	CGA	2	6	3873992	3873997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_021902	AAT	2	6	3875201	3875206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_021902	ACT	2	6	3875225	3875230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_021902	ACACG	2	10	3875302	3875311	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10098	NC_021902	CAAAAC	2	12	3875401	3875412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_021902	TCC	2	6	3875415	3875420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_021902	CA	3	6	3875426	3875431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_021902	A	9	9	3875431	3875439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_021902	TTAT	2	8	3875448	3875455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_021902	GTTA	2	8	3875458	3875465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_021902	TCC	2	6	3875479	3875484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_021902	GTGAAA	2	12	3875493	3875504	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_021902	GCC	2	6	3875551	3875556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_021902	ACA	2	6	3875706	3875711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_021902	AAG	2	6	3875751	3875756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021902	A	6	6	3875795	3875800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_021902	CCAG	2	8	3885576	3885583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_021902	GCG	2	6	3885587	3885592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_021902	AAT	2	6	3885627	3885632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_021902	AC	3	6	3890351	3890356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_021902	ATA	2	6	3892152	3892157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_021902	C	6	6	3892997	3893002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10116	NC_021902	A	6	6	3895992	3895997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021902	CAT	2	6	3896012	3896017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_021902	A	6	6	3896232	3896237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021902	TCC	2	6	3896500	3896505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_021902	TA	3	6	3896522	3896527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021902	A	6	6	3900053	3900058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021902	GTT	2	6	3900064	3900069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_021902	CTG	2	6	3900485	3900490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_021902	ATC	2	6	3900519	3900524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_021902	CCA	2	6	3900800	3900805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10126	NC_021902	GAT	2	6	3900856	3900861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_021902	TGC	2	6	3900876	3900881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_021902	GTCA	2	8	3901895	3901902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10129	NC_021902	CAA	2	6	3901984	3901989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_021902	A	6	6	3901988	3901993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_021902	CAG	2	6	3902154	3902159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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