MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 12969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021902	CTT	2	6	2336637	2336642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021902	T	6	6	2336650	2336655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021902	ACC	2	6	2338756	2338761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_021902	TTG	2	6	2338819	2338824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021902	TTA	2	6	2338926	2338931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021902	TGT	2	6	2338936	2338941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021902	CGG	2	6	2341544	2341549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_021902	GAA	2	6	2342754	2342759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021902	TAA	2	6	2344978	2344983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021902	GAA	2	6	2345010	2345015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_021902	AGGC	2	8	2345025	2345032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_021902	AAATA	2	10	2347070	2347079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021902	GGC	2	6	2348270	2348275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_021902	A	6	6	2349837	2349842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021902	GCA	2	6	2349861	2349866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_021902	AAAAAC	2	12	2351197	2351208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6017	NC_021902	TAT	2	6	2351231	2351236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_021902	TAG	2	6	2351292	2351297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021902	C	6	6	2351334	2351339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6020	NC_021902	TAA	2	6	2351381	2351386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021902	TG	3	6	2351387	2351392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021902	T	6	6	2351402	2351407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021902	TTA	2	6	2351432	2351437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021902	T	6	6	2351447	2351452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_021902	ATT	2	6	2351509	2351514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_021902	GCT	2	6	2351542	2351547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6028	NC_021902	TTA	2	6	2352760	2352765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021902	TACAGA	2	12	2352970	2352981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6030	NC_021902	TCA	2	6	2352999	2353004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_021902	T	9	9	2353154	2353162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021902	AAT	2	6	2353203	2353208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021902	ATT	2	6	2353402	2353407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021902	TTC	2	6	2353416	2353421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_021902	TCA	2	6	2353451	2353456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_021902	GC	3	6	2353514	2353519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_021902	CAA	2	6	2353541	2353546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_021902	AATA	2	8	2353610	2353617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_021902	T	6	6	2354548	2354553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021902	ATAG	2	8	2354561	2354568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021902	TAA	2	6	2354602	2354607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_021902	TGA	2	6	2354702	2354707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021902	TAA	2	6	2354786	2354791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021902	ACA	2	6	2354792	2354797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_021902	TTG	2	6	2354844	2354849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021902	CAA	3	9	2354919	2354927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_021902	AGG	2	6	2355012	2355017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_021902	TA	3	6	2355307	2355312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021902	GCC	2	6	2355330	2355335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_021902	GTAAA	2	10	2355361	2355370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021902	TGT	2	6	2355403	2355408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021902	CT	3	6	2355430	2355435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_021902	ATT	2	6	2355977	2355982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021902	AAAT	2	8	2355990	2355997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021902	GC	3	6	2356101	2356106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_021902	AGCC	2	8	2356107	2356114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_021902	TA	3	6	2356132	2356137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_021902	TTC	2	6	2356193	2356198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_021902	G	8	8	2356218	2356225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021902	AT	3	6	2356232	2356237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021902	AAAT	2	8	2356267	2356274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_021902	A	6	6	2356369	2356374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021902	GGC	2	6	2356407	2356412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_021902	TGA	2	6	2356538	2356543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_021902	ACAA	2	8	2356598	2356605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_021902	CAT	2	6	2356784	2356789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_021902	GTC	2	6	2356797	2356802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_021902	GCTT	2	8	2356830	2356837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_021902	GGT	2	6	2356854	2356859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021902	TAC	2	6	2356870	2356875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6072	NC_021902	TGT	2	6	2356908	2356913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_021902	A	6	6	2356954	2356959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021902	ATG	2	6	2356985	2356990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_021902	T	6	6	2357062	2357067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021902	TAA	3	9	2357092	2357100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_021902	T	6	6	2357123	2357128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021902	GTTA	2	8	2357149	2357156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_021902	T	7	7	2357160	2357166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_021902	TC	3	6	2357178	2357183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_021902	ATTCT	2	10	2357222	2357231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6084	NC_021902	TATAA	2	10	2357232	2357241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_021902	TGT	2	6	2357249	2357254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_021902	TGG	2	6	2357507	2357512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_021902	TGT	2	6	2357516	2357521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_021902	ATA	2	6	2357782	2357787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_021902	CTT	2	6	2358421	2358426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_021902	CCTG	2	8	2358442	2358449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_021902	TC	3	6	2358455	2358460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_021902	AGGT	2	8	2358541	2358548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_021902	AGGA	2	8	2358556	2358563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_021902	TCA	2	6	2358635	2358640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6104	NC_021902	GTAT	2	8	2358703	2358710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_021902	T	6	6	2358729	2358734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021902	GCC	2	6	2358755	2358760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_021902	CCT	2	6	2358787	2358792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_021902	TTA	2	6	2358852	2358857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021902	TGA	2	6	2358872	2358877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021902	AAT	2	6	2358943	2358948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_021902	TTA	2	6	2358954	2358959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021902	A	6	6	2358981	2358986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_021902	TTA	2	6	2359009	2359014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_021902	GCG	2	6	2359057	2359062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021902	T	6	6	2359145	2359150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_021902	ACGTT	2	10	2359525	2359534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6124	NC_021902	TTG	2	6	2359644	2359649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_021902	TAT	2	6	2361117	2361122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_021902	TGA	2	6	2361146	2361151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_021902	CAC	2	6	2361218	2361223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_021902	GAA	2	6	2361249	2361254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_021902	ATG	2	6	2361314	2361319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_021902	TAT	2	6	2361327	2361332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_021902	AGC	2	6	2361551	2361556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_021902	TCATT	2	10	2361584	2361593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6134	NC_021902	ACA	2	6	2361606	2361611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_021902	TCC	2	6	2361809	2361814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_021902	GCC	2	6	2361821	2361826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6137	NC_021902	GGC	2	6	2361831	2361836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_021902	AACC	2	8	2361877	2361884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6139	NC_021902	AC	3	6	2361888	2361893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6140	NC_021902	TGA	2	6	2361925	2361930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_021902	A	7	7	2362013	2362019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_021902	T	6	6	2362042	2362047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_021902	AGG	2	6	2362113	2362118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_021902	ATG	2	6	2362122	2362127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_021902	TAT	2	6	2362699	2362704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_021902	TCG	2	6	2362720	2362725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6147	NC_021902	CGG	2	6	2362734	2362739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_021902	ACT	2	6	2362875	2362880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_021902	A	6	6	2362890	2362895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_021902	AAT	3	9	2364005	2364013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_021902	CT	3	6	2364029	2364034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6152	NC_021902	AGC	2	6	2364513	2364518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6153	NC_021902	ATT	3	9	2364586	2364594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6154	NC_021902	AAC	2	6	2364605	2364610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6155	NC_021902	ACAG	2	8	2364672	2364679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6156	NC_021902	CGG	2	6	2364711	2364716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6157	NC_021902	TA	3	6	2364954	2364959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6158	NC_021902	A	7	7	2365265	2365271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6164	NC_021902	CTT	2	6	2365434	2365439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6166	NC_021902	TTAA	2	8	2365536	2365543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6171	NC_021902	CTT	2	6	2371995	2372000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6174	NC_021902	GCC	2	6	2372124	2372129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6175	NC_021902	GC	3	6	2372199	2372204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6191	NC_021902	CCAT	2	8	2375748	2375755	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6192	NC_021902	ACTC	2	8	2375853	2375860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6193	NC_021902	GCC	2	6	2375865	2375870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6198	NC_021902	A	6	6	2376249	2376254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6199	NC_021902	TCACA	2	10	2376270	2376279	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6200	NC_021902	TTCT	2	8	2376348	2376355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6201	NC_021902	TAA	2	6	2376409	2376414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6202	NC_021902	TAA	2	6	2376431	2376436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6210	NC_021902	CG	3	6	2378633	2378638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6211	NC_021902	TTTA	2	8	2378679	2378686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6214	NC_021902	A	7	7	2379499	2379505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6217	NC_021902	TAT	2	6	2380056	2380061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6218	NC_021902	ATA	2	6	2380197	2380202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6219	NC_021902	GAC	2	6	2380219	2380224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6230	NC_021902	TGA	2	6	2384266	2384271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_021902	TAC	2	6	2384412	2384417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6241	NC_021902	TAA	2	6	2387198	2387203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_021902	C	6	6	2388512	2388517	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6243	NC_021902	AAGCGC	2	12	2388604	2388615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6246	NC_021902	AGA	2	6	2390698	2390703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_021902	CTT	2	6	2390725	2390730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6248	NC_021902	TCA	2	6	2390803	2390808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_021902	TGG	2	6	2390821	2390826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_021902	ATC	2	6	2390859	2390864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_021902	ATC	2	6	2390870	2390875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6252	NC_021902	GGT	3	9	2390887	2390895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_021902	GGC	2	6	2391812	2391817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_021902	A	6	6	2391886	2391891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_021902	TAA	2	6	2391945	2391950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_021902	TTG	2	6	2391951	2391956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_021902	GCTG	2	8	2391961	2391968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6258	NC_021902	TTC	2	6	2392005	2392010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_021902	ATG	2	6	2393249	2393254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6261	NC_021902	GGC	2	6	2394226	2394231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6263	NC_021902	AAC	2	6	2395305	2395310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6264	NC_021902	GGACAT	2	12	2395331	2395342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6265	NC_021902	AC	3	6	2395403	2395408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6266	NC_021902	A	8	8	2395444	2395451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6267	NC_021902	AATC	2	8	2396588	2396595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6271	NC_021902	ATT	2	6	2397262	2397267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6272	NC_021902	GGT	2	6	2397597	2397602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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