MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08

Total Repeats: 12123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021870	AGAC	2	8	163	170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021870	ACA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021870	CAC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021870	ACC	3	9	227	235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021870	ACC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021870	A	6	6	299	304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021870	T	8	8	328	335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021870	AAC	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021870	GCC	2	6	5116	5121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021870	A	7	7	5946	5952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021870	GC	3	6	7466	7471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021870	CAAT	2	8	7569	7576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021870	CGG	2	6	7601	7606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021870	CGT	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021870	ATC	2	6	7630	7635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021870	CAGC	2	8	8643	8650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021870	AGC	2	6	8662	8667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021870	T	7	7	8693	8699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021870	AAT	2	6	9126	9131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021870	ACA	2	6	9762	9767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021870	TCC	2	6	9815	9820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021870	GGA	2	6	9829	9834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021870	ATC	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021870	ATA	2	6	10486	10491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021870	TGA	2	6	10520	10525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021870	GAAAA	2	10	10530	10539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021870	AATAA	2	10	11284	11293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021870	AAT	2	6	11727	11732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021870	TCTTT	2	10	11782	11791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021870	TTA	2	6	11792	11797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021870	GTG	2	6	11946	11951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021870	A	8	8	11958	11965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021870	ATG	2	6	12021	12026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021870	TGCA	2	8	14025	14032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021870	A	7	7	14047	14053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021870	TTC	2	6	15213	15218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021870	T	6	6	15240	15245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021870	TGTTT	2	10	15301	15310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021870	CAG	2	6	15337	15342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021870	CACT	2	8	15352	15359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021870	A	7	7	15363	15369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021870	T	6	6	15396	15401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021870	T	6	6	15444	15449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021870	TGT	2	6	16430	16435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021870	ATG	2	6	16461	16466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021870	TCC	2	6	16477	16482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021870	C	6	6	16481	16486	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_021870	CTC	2	6	16503	16508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021870	TTC	2	6	16939	16944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021870	TTCCTT	2	12	17488	17499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021870	TATTG	2	10	18036	18045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021870	AGCG	2	8	18057	18064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021870	ATT	2	6	18072	18077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021870	TGC	2	6	18163	18168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021870	ATC	2	6	18227	18232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021870	ATG	2	6	18240	18245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021870	T	6	6	18261	18266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021870	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021870	T	6	6	20526	20531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021870	CCA	2	6	20532	20537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021870	TTTC	2	8	23608	23615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021870	TC	3	6	23641	23646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021870	TCA	2	6	23666	23671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021870	TTAT	2	8	23765	23772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021870	ACA	2	6	23825	23830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021870	A	6	6	23838	23843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021870	ATG	2	6	24573	24578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021870	TG	3	6	24577	24582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021870	T	6	6	24584	24589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021870	TAA	2	6	24594	24599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021870	ATT	2	6	24627	24632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021870	GAT	2	6	24731	24736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021870	TAA	2	6	24758	24763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021870	TAA	2	6	24765	24770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021870	A	7	7	24854	24860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021870	T	7	7	24864	24870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021870	TGC	2	6	24894	24899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021870	A	6	6	24926	24931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021870	TTC	2	6	25529	25534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021870	CG	3	6	25564	25569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021870	G	7	7	26339	26345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021870	T	7	7	31014	31020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021870	TTA	2	6	32651	32656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021870	CCA	2	6	32661	32666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021870	AGG	2	6	32991	32996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021870	ATA	2	6	32998	33003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021870	GGT	2	6	33006	33011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021870	GAT	2	6	33038	33043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021870	ACC	2	6	33045	33050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021870	TC	3	6	33079	33084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021870	GCTAT	2	10	33615	33624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021870	ATA	2	6	33818	33823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021870	ATT	2	6	33832	33837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021870	T	6	6	33836	33841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021870	TGA	2	6	33849	33854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021870	TTA	2	6	33872	33877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021870	CAAAA	2	10	33899	33908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021870	A	6	6	33905	33910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021870	T	7	7	33981	33987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021870	TTTGT	2	10	34161	34170	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021870	TAA	2	6	34185	34190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021870	TGC	2	6	34194	34199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021870	ATA	2	6	34568	34573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021870	GCC	2	6	34581	34586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021870	T	7	7	34610	34616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021870	GTC	2	6	34627	34632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021870	AT	3	6	34667	34672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021870	CGT	2	6	34977	34982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021870	ATAC	2	8	34993	35000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021870	ATC	2	6	35023	35028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021870	AAT	2	6	35037	35042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021870	ATC	2	6	35147	35152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021870	ACA	2	6	35226	35231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021870	TAA	3	9	35272	35280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021870	ATTT	2	8	35287	35294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021870	T	6	6	35292	35297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021870	A	7	7	35300	35306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021870	ATT	2	6	35320	35325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021870	TGA	2	6	35419	35424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021870	AT	3	6	35445	35450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021870	A	6	6	37745	37750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021870	TTTTA	2	10	37814	37823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021870	AGG	2	6	39041	39046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021870	GTT	2	6	40383	40388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021870	GA	3	6	40416	40421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021870	CAT	2	6	42220	42225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021870	AT	3	6	42224	42229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021870	GAT	2	6	42244	42249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021870	GAA	2	6	42275	42280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021870	GA	3	6	42292	42297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021870	GA	3	6	43526	43531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021870	TGC	2	6	44466	44471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021870	CCA	2	6	44580	44585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021870	GGCA	2	8	44589	44596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021870	A	7	7	44598	44604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021870	T	6	6	44619	44624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021870	CAA	2	6	44635	44640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021870	GCG	2	6	44641	44646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021870	GC	3	6	44880	44885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021870	CTT	2	6	44975	44980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021870	CATA	2	8	45257	45264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021870	AGGC	2	8	45270	45277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021870	AGCGT	2	10	49592	49601	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021870	CAG	2	6	51122	51127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021870	AAT	2	6	51128	51133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021870	T	6	6	51141	51146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021870	TTA	2	6	51206	51211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021870	CAA	2	6	51264	51269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_021870	ATT	2	6	51876	51881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_021870	CGG	2	6	59770	59775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_021870	AAT	2	6	107635	107640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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