MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021845	AG	3	6	129899	129904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021845	TCC	2	6	129913	129918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_021845	TC	3	6	130051	130056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_021845	ATC	2	6	130069	130074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021845	GAA	2	6	130528	130533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021845	CAC	2	6	130575	130580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_021845	AGTA	2	8	130626	130633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021845	GA	3	6	130649	130654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021845	TAA	2	6	130705	130710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021845	AGG	2	6	130721	130726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021845	AGC	2	6	131038	131043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021845	CT	3	6	131470	131475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_021845	TGG	2	6	131478	131483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021845	GCTG	2	8	131599	131606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_021845	CAA	2	6	131663	131668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021845	ACC	2	6	133640	133645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021845	CCT	2	6	141869	141874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_021845	GGA	2	6	141894	141899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021845	T	8	8	141908	141915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021845	AGA	2	6	141923	141928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021845	TGA	2	6	141944	141949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021845	ATT	2	6	142082	142087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021845	AT	3	6	142125	142130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021845	A	8	8	142147	142154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021845	GAC	2	6	142207	142212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021845	TGA	2	6	142308	142313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021845	CGT	2	6	142351	142356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021845	T	9	9	142393	142401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021845	A	6	6	142569	142574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021845	A	6	6	143943	143948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021845	TGT	2	6	144002	144007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021845	TTC	2	6	144093	144098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021845	T	7	7	144117	144123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021845	ACT	2	6	144140	144145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021845	GAC	2	6	144172	144177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021845	AT	3	6	144198	144203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021845	CTT	2	6	144226	144231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021845	CTT	2	6	144248	144253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021845	TGA	2	6	144279	144284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021845	T	7	7	144285	144291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021845	GATG	2	8	144386	144393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021845	TCT	2	6	144415	144420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021845	T	8	8	144484	144491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021845	CAT	2	6	144498	144503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021845	CCT	2	6	150958	150963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_021845	T	7	7	151032	151038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021845	ATT	2	6	152674	152679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021845	CAAT	2	8	152695	152702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021845	CAG	2	6	152728	152733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021845	TGT	2	6	153224	153229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021845	TTC	2	6	153230	153235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021845	CTT	2	6	153247	153252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021845	ATG	2	6	153254	153259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021845	AAGA	2	8	153276	153283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021845	AG	3	6	153284	153289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021845	TAAA	2	8	153295	153302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021845	AGA	3	9	153311	153319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021845	AT	3	6	153322	153327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021845	TGG	2	6	153355	153360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021845	GAT	2	6	153377	153382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021845	AT	3	6	153985	153990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021845	CTTT	2	8	153998	154005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_021845	ATA	2	6	154061	154066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021845	GT	3	6	154860	154865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021845	A	6	6	155285	155290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021845	CCG	2	6	155761	155766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_021845	AAT	2	6	156416	156421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021845	TAAC	2	8	156460	156467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_021845	TGA	2	6	157317	157322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021845	A	6	6	158969	158974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021845	TTG	2	6	158993	158998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021845	TGTA	2	8	159047	159054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021845	TC	3	6	159090	159095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_021845	TCA	2	6	159131	159136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021845	GAA	2	6	159183	159188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021845	CAAG	2	8	159195	159202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_021845	CTA	2	6	159844	159849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021845	A	7	7	159861	159867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021845	TAT	2	6	160338	160343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021845	AAG	2	6	160358	160363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021845	T	6	6	160366	160371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021845	TAAT	2	8	160429	160436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021845	AAT	2	6	160438	160443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021845	T	6	6	160483	160488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021845	TTA	2	6	160492	160497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021845	GGAA	2	8	160542	160549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021845	CAAA	2	8	163920	163927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_021845	A	6	6	163925	163930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021845	ATG	2	6	163987	163992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021845	TTATC	2	10	164132	164141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
591	NC_021845	CTT	2	6	164168	164173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021845	CCG	2	6	164222	164227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_021845	AAC	2	6	164230	164235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021845	GAT	2	6	164270	164275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021845	AAT	2	6	164317	164322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021845	GCAA	2	8	164356	164363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_021845	TGA	2	6	164364	164369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021845	GA	3	6	164368	164373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021845	TTC	2	6	165025	165030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021845	TTA	2	6	165584	165589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021845	TTA	2	6	165601	165606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021845	TTC	2	6	165631	165636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021845	GTT	2	6	165656	165661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021845	TAA	2	6	166316	166321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021845	AATAT	2	10	166442	166451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021845	CTT	2	6	166456	166461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021845	AAT	2	6	166480	166485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021845	CCA	2	6	166494	166499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_021845	CT	3	6	166500	166505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_021845	CAT	2	6	166519	166524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021845	AAC	2	6	166544	166549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021845	GTC	2	6	166614	166619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.