MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021844	GCT	2	6	549037	549042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021844	TGGT	2	8	549048	549055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021844	CGC	2	6	553866	553871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_021844	T	6	6	553901	553906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021844	GA	3	6	553917	553922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021844	AAC	2	6	557808	557813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021844	GT	3	6	559340	559345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021844	GCC	2	6	559346	559351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_021844	AGCGC	2	10	559363	559372	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1510	NC_021844	ATA	2	6	560402	560407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021844	TAT	2	6	560440	560445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021844	GCG	2	6	560494	560499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021844	CT	4	8	560525	560532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_021844	T	7	7	563696	563702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021844	ATG	2	6	563786	563791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021844	TAG	2	6	563794	563799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021844	TGTC	2	8	563813	563820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_021844	TGG	2	6	563826	563831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021844	A	6	6	564119	564124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021844	GTC	2	6	564146	564151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021844	GAC	2	6	564158	564163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021844	TCG	2	6	564814	564819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021844	TCA	2	6	564853	564858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021844	ATTA	2	8	564886	564893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021844	ATTTT	2	10	564934	564943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021844	T	6	6	564940	564945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021844	GTG	2	6	565060	565065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021844	GCG	2	6	565110	565115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021844	AGGGG	2	10	565116	565125	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021844	CCG	2	6	565140	565145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_021844	ACG	3	9	565147	565155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_021844	ACA	2	6	565665	565670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_021844	AAT	2	6	565726	565731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021844	AATT	2	8	565813	565820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021844	ATG	2	6	565830	565835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021844	TAG	2	6	565850	565855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021844	CAC	2	6	565866	565871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_021844	CT	3	6	565886	565891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_021844	TGA	2	6	565959	565964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021844	CGC	3	9	566001	566009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_021844	ATA	2	6	566036	566041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021844	CTT	2	6	567027	567032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021844	CTC	2	6	567076	567081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_021844	TTA	2	6	567094	567099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021844	TTC	2	6	568432	568437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021844	AAT	2	6	568540	568545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021844	AT	3	6	568575	568580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021844	ATTG	2	8	568582	568589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021844	TGG	2	6	571447	571452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021844	ATA	3	9	571468	571476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021844	GGC	2	6	571496	571501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_021844	TTA	2	6	571518	571523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021844	CCT	2	6	571555	571560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_021844	ACG	2	6	575680	575685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021844	CGT	2	6	575699	575704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021844	CGT	2	6	576785	576790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021844	A	6	6	576792	576797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021844	GCA	3	9	576805	576813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_021844	ACATC	2	10	576831	576840	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_021844	TGC	2	6	578240	578245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021844	TGAA	2	8	578256	578263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021844	ATA	2	6	578320	578325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021844	AG	4	8	578343	578350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021844	T	7	7	578926	578932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021844	ACG	2	6	578945	578950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021844	AATAAC	2	12	578969	578980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1567	NC_021844	AGCGC	2	10	580117	580126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_021844	TAT	2	6	580142	580147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021844	CCGA	2	8	580163	580170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_021844	AG	3	6	580266	580271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021844	T	6	6	580272	580277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021844	TTAT	2	8	580387	580394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021844	A	6	6	581279	581284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021844	CGG	2	6	581292	581297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_021844	T	7	7	581299	581305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_021844	ATG	2	6	582368	582373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021844	T	6	6	582376	582381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021844	CTGG	2	8	582402	582409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_021844	TGTTT	2	10	583626	583635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_021844	TAT	2	6	584560	584565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021844	TGC	2	6	584567	584572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_021844	AT	3	6	584613	584618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021844	TCA	2	6	584619	584624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1592	NC_021844	ACA	2	6	585570	585575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1599	NC_021844	CCG	2	6	591844	591849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1601	NC_021844	T	8	8	591895	591902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021844	ATT	2	6	591907	591912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021844	GA	3	6	593170	593175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021844	GAG	2	6	593180	593185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021844	ATC	2	6	593204	593209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021844	GC	3	6	599177	599182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_021844	CAT	2	6	599216	599221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_021844	ATG	2	6	599305	599310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021844	T	6	6	599448	599453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021844	GCT	2	6	599462	599467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021844	CAG	2	6	599615	599620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021844	A	6	6	599627	599632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021844	ATC	2	6	599652	599657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_021844	ATGA	2	8	599667	599674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021844	TAT	2	6	600786	600791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021844	TTA	2	6	603221	603226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021844	TGA	2	6	603227	603232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021844	CGCA	2	8	603261	603268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_021844	TG	3	6	603315	603320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021844	ATT	2	6	603342	603347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021844	AGG	2	6	603368	603373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_021844	GTC	2	6	604808	604813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021844	T	6	6	605540	605545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021844	AGAA	2	8	606865	606872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021844	CCTGT	2	10	607394	607403	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1627	NC_021844	CA	3	6	607455	607460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1630	NC_021844	CAA	2	6	613864	613869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_021844	AGC	2	6	617065	617070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_021844	GTT	2	6	618796	618801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021844	CATC	2	8	619101	619108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_021844	AAC	2	6	619137	619142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_021844	CGA	2	6	619144	619149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_021844	GGC	2	6	619203	619208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_021844	A	6	6	620393	620398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_021844	CGC	2	6	620399	620404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1755	NC_021844	TGGTTA	2	12	675029	675040	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1758	NC_021844	AAT	2	6	675225	675230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1759	NC_021844	ATA	3	9	675330	675338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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