MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021844	CGG	2	6	427534	427539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021844	CGA	2	6	427651	427656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021844	GCG	2	6	430514	430519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021844	G	6	6	430524	430529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021844	CAA	2	6	430576	430581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021844	ATTT	2	8	430679	430686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021844	TTAA	2	8	430736	430743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021844	TAA	2	6	430756	430761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021844	TAAT	2	8	430767	430774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021844	ATTA	2	8	430795	430802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021844	TTAA	2	8	430831	430838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021844	A	6	6	430837	430842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021844	AAG	2	6	430880	430885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021844	TGGC	2	8	433289	433296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_021844	GCCA	2	8	433303	433310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_021844	TTC	2	6	433328	433333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021844	AATA	2	8	433876	433883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021844	GCT	2	6	433913	433918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021844	T	6	6	433986	433991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021844	AC	3	6	433998	434003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_021844	TTG	2	6	434010	434015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021844	AGGG	2	8	436110	436117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021844	TCT	2	6	436131	436136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021844	GCC	2	6	436161	436166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_021844	AT	4	8	437819	437826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021844	T	6	6	437844	437849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021844	GGTT	2	8	437852	437859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021844	GCG	2	6	437938	437943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021844	TTA	2	6	437945	437950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021844	TGT	2	6	437969	437974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021844	CT	3	6	438087	438092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_021844	T	7	7	438096	438102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021844	GAC	2	6	438116	438121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021844	GAT	2	6	438137	438142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021844	AAT	2	6	438145	438150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021844	TCA	2	6	438160	438165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021844	GGC	2	6	439904	439909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021844	AGCGC	2	10	439957	439966	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_021844	CGG	2	6	442037	442042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021844	ACC	2	6	444324	444329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_021844	AATT	2	8	444394	444401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021844	TTA	2	6	444403	444408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021844	TAAA	2	8	444422	444429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021844	GCG	2	6	445071	445076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021844	A	6	6	445134	445139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021844	T	6	6	445154	445159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021844	AAAC	2	8	447752	447759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_021844	GTA	2	6	447765	447770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021844	A	6	6	451164	451169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021844	TTGCC	2	10	451286	451295	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1051	NC_021844	GAT	2	6	451314	451319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021844	TGT	2	6	451408	451413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021844	CAA	2	6	451450	451455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_021844	CTG	2	6	451554	451559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021844	TAG	2	6	451603	451608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021844	TTAG	2	8	454828	454835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021844	TTGC	2	8	458127	458134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_021844	A	7	7	458215	458221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021844	T	7	7	458237	458243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021844	TTG	2	6	458446	458451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021844	ACT	2	6	458463	458468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021844	AATA	2	8	458474	458481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021844	ATT	2	6	458513	458518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021844	TAA	3	9	458585	458593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021844	TA	3	6	458611	458616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021844	TTTA	2	8	458623	458630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021844	CTTC	2	8	458681	458688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_021844	TGC	2	6	458723	458728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_021844	GCC	3	9	458763	458771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_021844	CGC	2	6	458805	458810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_021844	GCC	2	6	458859	458864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_021844	CCG	2	6	458936	458941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021844	GCGCT	2	10	458980	458989	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1074	NC_021844	CCT	2	6	458998	459003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_021844	TCA	2	6	459059	459064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_021844	TTG	2	6	459133	459138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021844	GCT	2	6	459162	459167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021844	TGT	2	6	459197	459202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021844	TCA	2	6	459217	459222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021844	GCC	2	6	459261	459266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021844	CTGG	2	8	459342	459349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1089	NC_021844	TGG	2	6	459752	459757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_021844	TGC	2	6	459785	459790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_021844	GGT	2	6	459816	459821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_021844	CAA	2	6	459923	459928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_021844	TGC	2	6	459980	459985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021844	TCGG	2	8	459988	459995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_021844	GTA	2	6	460057	460062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021844	CAG	2	6	460095	460100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1104	NC_021844	GAT	2	6	460119	460124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021844	GCC	2	6	460137	460142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_021844	GTT	2	6	460191	460196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021844	TGG	3	9	460199	460207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021844	TCC	2	6	460255	460260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1111	NC_021844	GCG	2	6	460412	460417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021844	TGC	2	6	460478	460483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021844	GTG	2	6	460492	460497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021844	GC	3	6	460561	460566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1117	NC_021844	GGT	2	6	460800	460805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021844	TGC	2	6	460808	460813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021844	GCGTCC	2	12	460852	460863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_021844	CCG	2	6	460894	460899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_021844	CAGC	2	8	460950	460957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1123	NC_021844	GAA	2	6	461022	461027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_021844	TG	3	6	461111	461116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_021844	CGC	2	6	461228	461233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_021844	TGA	2	6	461243	461248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021844	CGC	2	6	461252	461257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_021844	GCC	2	6	461266	461271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_021844	CGG	2	6	461312	461317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021844	GCC	2	6	461349	461354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_021844	CAT	2	6	461364	461369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021844	GTT	2	6	461382	461387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021844	CATCGG	2	12	461426	461437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_021844	CCA	2	6	461447	461452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_021844	GAT	2	6	461476	461481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1143	NC_021844	GCC	2	6	461659	461664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1148	NC_021844	TAA	2	6	461992	461997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_021844	TA	3	6	462006	462011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_021844	GTC	2	6	462036	462041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_021844	CCG	3	9	462223	462231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1157	NC_021844	GTT	2	6	462240	462245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_021844	CGG	2	6	462797	462802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1176	NC_021844	CGC	2	6	462959	462964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1233	NC_021844	CAGGT	2	10	464633	464642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1234	NC_021844	TTAT	2	8	464664	464671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_021844	ATGA	2	8	464675	464682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1236	NC_021844	ATT	2	6	464724	464729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_021844	GCC	2	6	467218	467223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1249	NC_021844	ATT	2	6	471702	471707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_021844	T	6	6	471730	471735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_021844	CAT	2	6	471752	471757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_021844	CGT	2	6	471778	471783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_021844	CTGGC	2	10	471825	471834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1265	NC_021844	TTG	2	6	481829	481834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_021844	GC	3	6	481856	481861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1267	NC_021844	CCG	2	6	483920	483925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1407	NC_021844	AGG	2	6	525889	525894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_021844	GGT	2	6	525971	525976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_021844	CGG	2	6	526058	526063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_021844	TCA	2	6	526086	526091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_021844	CGT	2	6	526166	526171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_021844	G	6	6	526215	526220	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_021844	GAC	3	9	526397	526405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_021844	GGT	2	6	526939	526944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_021844	AAT	2	6	527563	527568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_021844	CTGT	2	8	527609	527616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1440	NC_021844	GAATA	2	10	527667	527676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_021844	TAT	2	6	527781	527786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_021844	ACC	2	6	528126	528131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1444	NC_021844	ATC	2	6	528157	528162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_021844	A	9	9	532717	532725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_021844	ATTT	2	8	532824	532831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_021844	TAT	2	6	532837	532842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_021844	TC	3	6	532878	532883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1455	NC_021844	GTT	2	6	532909	532914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_021844	CTT	2	6	535795	535800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1458	NC_021844	ATAA	2	8	535858	535865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_021844	A	6	6	537046	537051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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