MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021844	CTG	2	6	4673536	4673541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_021844	GCG	2	6	4673603	4673608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_021844	CCAG	2	8	4673619	4673626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_021844	AGCCC	2	10	4673727	4673736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13005	NC_021844	AGA	2	6	4674807	4674812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021844	CAAC	3	12	4674915	4674926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13007	NC_021844	AGGTT	2	10	4674950	4674959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021844	TGC	2	6	4675028	4675033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_021844	T	6	6	4675103	4675108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021844	AAT	2	6	4675113	4675118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_021844	ATT	2	6	4675134	4675139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_021844	TG	3	6	4675159	4675164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_021844	GCA	2	6	4675181	4675186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_021844	TAA	2	6	4675202	4675207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_021844	A	6	6	4675209	4675214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021844	AT	3	6	4675216	4675221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021844	TAC	2	6	4675870	4675875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_021844	A	6	6	4675890	4675895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_021844	TTC	2	6	4675928	4675933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_021844	CCT	3	9	4676317	4676325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_021844	GCCG	2	8	4676387	4676394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_021844	GCA	2	6	4676411	4676416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_021844	CGA	2	6	4679089	4679094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_021844	A	6	6	4679094	4679099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021844	AAAG	2	8	4679143	4679150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_021844	TACA	2	8	4679157	4679164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_021844	ATT	2	6	4679222	4679227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_021844	GAC	2	6	4679238	4679243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_021844	CTCA	2	8	4679259	4679266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_021844	CT	3	6	4679289	4679294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_021844	TGAT	2	8	4679317	4679324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021844	A	7	7	4683477	4683483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021844	ACA	2	6	4683527	4683532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_021844	TGA	2	6	4683571	4683576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_021844	CAT	2	6	4683626	4683631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_021844	ATT	2	6	4683691	4683696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021844	A	6	6	4683725	4683730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_021844	A	7	7	4683745	4683751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_021844	C	6	6	4683777	4683782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13040	NC_021844	CAA	2	6	4683905	4683910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_021844	A	6	6	4683961	4683966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021844	CCG	2	6	4683969	4683974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_021844	GA	3	6	4683999	4684004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_021844	T	6	6	4684077	4684082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_021844	GTG	2	6	4684109	4684114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021844	G	8	8	4684118	4684125	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_021844	CCA	2	6	4684289	4684294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_021844	ACC	2	6	4684319	4684324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_021844	TAAA	2	8	4684339	4684346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_021844	ATA	2	6	4684445	4684450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_021844	TAAA	2	8	4684483	4684490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_021844	GTA	2	6	4685943	4685948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_021844	TTG	2	6	4685974	4685979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_021844	A	7	7	4686022	4686028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_021844	ATC	2	6	4686048	4686053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13057	NC_021844	AGC	2	6	4686070	4686075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_021844	GCT	2	6	4686092	4686097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_021844	TCA	2	6	4686102	4686107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_021844	TCC	2	6	4693217	4693222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_021844	ATC	2	6	4699067	4699072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_021844	TGT	2	6	4700457	4700462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021844	A	6	6	4700606	4700611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021844	TAA	2	6	4700644	4700649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021844	ACA	2	6	4700736	4700741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_021844	TCG	2	6	4700774	4700779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_021844	CAA	2	6	4701235	4701240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_021844	GGC	2	6	4702613	4702618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_021844	GGGA	2	8	4706280	4706287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_021844	AGA	2	6	4706311	4706316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_021844	GCT	2	6	4706321	4706326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13073	NC_021844	GGC	2	6	4706365	4706370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_021844	GCG	2	6	4706373	4706378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13077	NC_021844	GT	3	6	4708661	4708666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021844	ACA	2	6	4708719	4708724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_021844	ATT	2	6	4710421	4710426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13082	NC_021844	TTTA	2	8	4714031	4714038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_021844	CTCA	2	8	4714087	4714094	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_021844	TAC	2	6	4714106	4714111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13087	NC_021844	TTC	2	6	4715121	4715126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13089	NC_021844	CTC	2	6	4717102	4717107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13091	NC_021844	ATA	2	6	4717222	4717227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_021844	T	7	7	4717355	4717361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_021844	T	6	6	4717406	4717411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_021844	TCC	2	6	4717448	4717453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13097	NC_021844	CTT	2	6	4717485	4717490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_021844	A	6	6	4717566	4717571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_021844	TCT	2	6	4717596	4717601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13101	NC_021844	AAAAC	2	10	4719586	4719595	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13102	NC_021844	AAT	2	6	4719614	4719619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021844	ATG	2	6	4720474	4720479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13105	NC_021844	A	8	8	4720537	4720544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_021844	ATT	2	6	4720564	4720569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_021844	GA	3	6	4720583	4720588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_021844	ACGG	2	8	4720663	4720670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13109	NC_021844	CAGG	2	8	4720698	4720705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13110	NC_021844	ACC	2	6	4720880	4720885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13112	NC_021844	GCT	2	6	4720951	4720956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_021844	GTCA	2	8	4720966	4720973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13114	NC_021844	GCC	2	6	4721008	4721013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_021844	TTG	2	6	4721059	4721064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021844	TCT	2	6	4721065	4721070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_021844	AC	3	6	4721154	4721159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_021844	CGT	3	9	4721172	4721180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13124	NC_021844	ACC	2	6	4721602	4721607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_021844	CCT	2	6	4721684	4721689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13127	NC_021844	AGG	2	6	4721738	4721743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021844	CCA	2	6	4721765	4721770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13129	NC_021844	GGT	2	6	4721825	4721830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_021844	CAT	2	6	4722020	4722025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_021844	GCC	2	6	4722095	4722100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13132	NC_021844	TAA	2	6	4722220	4722225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_021844	CAGC	2	8	4722233	4722240	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13134	NC_021844	GACT	2	8	4722251	4722258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13135	NC_021844	TC	3	6	4722349	4722354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13152	NC_021844	GTCA	2	8	4723563	4723570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13153	NC_021844	GGA	2	6	4723586	4723591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.