MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021844	CCA	2	6	3630836	3630841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_021844	GC	3	6	3630876	3630881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_021844	GTA	2	6	3630900	3630905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021844	GCC	2	6	3630939	3630944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_021844	GCG	2	6	3630949	3630954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_021844	TAA	2	6	3631059	3631064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_021844	TTCATC	2	12	3631560	3631571	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_021844	GAG	2	6	3631665	3631670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_021844	CGA	2	6	3631685	3631690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_021844	T	6	6	3631723	3631728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021844	T	6	6	3631765	3631770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021844	GGA	2	6	3632618	3632623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021844	TGT	2	6	3632752	3632757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021844	GC	3	6	3632844	3632849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_021844	GGA	2	6	3632945	3632950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021844	TAT	2	6	3632989	3632994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_021844	TC	3	6	3633008	3633013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_021844	ATAA	2	8	3633025	3633032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_021844	AAATA	2	10	3633091	3633100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_021844	ATA	3	9	3633098	3633106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021844	AAC	2	6	3633108	3633113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_021844	A	6	6	3633123	3633128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021844	CT	3	6	3633132	3633137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_021844	ATTTAA	2	12	3633167	3633178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_021844	CATG	2	8	3633192	3633199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_021844	TAA	2	6	3633225	3633230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_021844	CAT	2	6	3633293	3633298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_021844	AT	3	6	3633320	3633325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_021844	ATA	2	6	3633335	3633340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021844	AT	3	6	3633351	3633356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_021844	TGG	2	6	3633369	3633374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_021844	TAA	2	6	3633378	3633383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021844	TTG	2	6	3633386	3633391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10035	NC_021844	TAA	2	6	3633461	3633466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021844	AAAAC	2	10	3633467	3633476	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10037	NC_021844	AAT	2	6	3633477	3633482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021844	ATAA	2	8	3633492	3633499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_021844	CAC	2	6	3634187	3634192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_021844	GTT	3	9	3634231	3634239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_021844	AAG	2	6	3634244	3634249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_021844	ATA	2	6	3634251	3634256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_021844	AGTA	2	8	3634269	3634276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021844	TAAA	2	8	3634798	3634805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_021844	TA	3	6	3634811	3634816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021844	A	6	6	3634833	3634838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021844	AAGA	2	8	3634845	3634852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_021844	AATAA	2	10	3634857	3634866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_021844	AAT	2	6	3636796	3636801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_021844	TAA	2	6	3636868	3636873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_021844	GT	3	6	3637499	3637504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_021844	AAG	2	6	3638285	3638290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_021844	TG	3	6	3638319	3638324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_021844	CAT	2	6	3638330	3638335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_021844	T	7	7	3638367	3638373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_021844	GAAA	2	8	3638377	3638384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021844	A	6	6	3638382	3638387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021844	TAAA	2	8	3638392	3638399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021844	TTCA	2	8	3638411	3638418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_021844	TAA	2	6	3638459	3638464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_021844	CGC	2	6	3638465	3638470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_021844	TTC	2	6	3638488	3638493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_021844	GTT	2	6	3638502	3638507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_021844	CCT	2	6	3638551	3638556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_021844	CAA	2	6	3638563	3638568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_021844	TAACA	2	10	3638574	3638583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10067	NC_021844	AAAG	2	8	3638604	3638611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_021844	AGG	2	6	3638618	3638623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021844	ATC	2	6	3638682	3638687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10071	NC_021844	TAAT	2	8	3638728	3638735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10073	NC_021844	TA	3	6	3638815	3638820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_021844	CAT	2	6	3638821	3638826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10077	NC_021844	A	7	7	3638983	3638989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_021844	TGT	2	6	3639026	3639031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021844	GCA	2	6	3639141	3639146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10081	NC_021844	CCAG	2	8	3639243	3639250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_021844	ATCG	2	8	3639253	3639260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10085	NC_021844	GTT	2	6	3639398	3639403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10092	NC_021844	TG	3	6	3641369	3641374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_021844	ATC	2	6	3641391	3641396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10095	NC_021844	A	6	6	3641402	3641407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_021844	C	6	6	3641696	3641701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10099	NC_021844	ATT	2	6	3641714	3641719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_021844	GGA	2	6	3641729	3641734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_021844	AACAG	2	10	3641735	3641744	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10102	NC_021844	CTC	2	6	3641791	3641796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10104	NC_021844	CAA	3	9	3641873	3641881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_021844	CTG	2	6	3641959	3641964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10109	NC_021844	GCA	2	6	3642094	3642099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_021844	A	6	6	3642961	3642966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_021844	ATT	2	6	3642970	3642975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_021844	AAAC	2	8	3643050	3643057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_021844	CAAA	2	8	3643102	3643109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_021844	ATA	2	6	3643125	3643130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10116	NC_021844	ATA	2	6	3643166	3643171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021844	A	7	7	3643185	3643191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_021844	ATCA	2	8	3643212	3643219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_021844	AATT	2	8	3647097	3647104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10122	NC_021844	T	7	7	3647710	3647716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_021844	AAT	2	6	3647728	3647733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10125	NC_021844	TA	3	6	3647859	3647864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_021844	A	7	7	3647885	3647891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_021844	GAATA	2	10	3647946	3647955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10130	NC_021844	ACAT	2	8	3648094	3648101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10131	NC_021844	ATT	2	6	3648121	3648126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_021844	CTGA	2	8	3648227	3648234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10133	NC_021844	CCTT	2	8	3648275	3648282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10152	NC_021844	ACAT	2	8	3649326	3649333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10153	NC_021844	GCC	2	6	3649344	3649349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10162	NC_021844	GTTTC	2	10	3649580	3649589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10163	NC_021844	ACA	3	9	3649648	3649656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10191	NC_021844	TACC	2	8	3650804	3650811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10246	NC_021844	TTTA	2	8	3661967	3661974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10250	NC_021844	TAAT	2	8	3662464	3662471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10252	NC_021844	GCT	2	6	3662766	3662771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10254	NC_021844	CTG	2	6	3663696	3663701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_021844	AT	3	6	3663719	3663724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_021844	CCAG	2	8	3663742	3663749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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