MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021844	CGA	2	6	2555454	2555459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_021844	CCA	2	6	2555508	2555513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_021844	TCG	2	6	2555745	2555750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_021844	TCT	2	6	2555778	2555783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_021844	TAT	2	6	2555827	2555832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021844	TGT	2	6	2558227	2558232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_021844	CAA	3	9	2558240	2558248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_021844	ATC	2	6	2558306	2558311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_021844	T	6	6	2558316	2558321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_021844	TTG	2	6	2558361	2558366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_021844	TCG	2	6	2563232	2563237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_021844	AT	3	6	2563337	2563342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_021844	ACA	2	6	2563344	2563349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_021844	ATT	2	6	2563412	2563417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021844	CATT	2	8	2563420	2563427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7016	NC_021844	ACA	2	6	2563478	2563483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_021844	CCTGC	2	10	2565525	2565534	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7018	NC_021844	CA	3	6	2565535	2565540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_021844	CAA	2	6	2567825	2567830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_021844	CGC	2	6	2567848	2567853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_021844	GCG	2	6	2567864	2567869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_021844	TAA	2	6	2567897	2567902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_021844	T	6	6	2567956	2567961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021844	GC	3	6	2567981	2567986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_021844	CA	3	6	2568073	2568078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_021844	CAT	2	6	2568123	2568128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_021844	GC	3	6	2568163	2568168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_021844	TCC	2	6	2568188	2568193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_021844	AAGACT	2	12	2568202	2568213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7030	NC_021844	TTG	2	6	2569633	2569638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_021844	TG	3	6	2569637	2569642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021844	AATT	2	8	2569643	2569650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_021844	A	6	6	2569656	2569661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021844	T	7	7	2569677	2569683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_021844	TAA	2	6	2569704	2569709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_021844	A	7	7	2569708	2569714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_021844	AAG	2	6	2569751	2569756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7039	NC_021844	CTT	2	6	2569817	2569822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_021844	A	7	7	2569857	2569863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_021844	A	6	6	2569876	2569881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_021844	TAA	2	6	2570188	2570193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_021844	ATA	2	6	2570563	2570568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_021844	ATT	2	6	2570576	2570581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_021844	T	7	7	2570860	2570866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021844	CGT	2	6	2570870	2570875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7048	NC_021844	CCT	2	6	2571896	2571901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_021844	CGA	2	6	2571924	2571929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_021844	CTGT	2	8	2572031	2572038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7051	NC_021844	TCA	2	6	2575693	2575698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_021844	CAA	2	6	2577653	2577658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_021844	TTA	2	6	2577679	2577684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021844	GACA	2	8	2577713	2577720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7055	NC_021844	A	6	6	2577720	2577725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_021844	AACTT	2	10	2577727	2577736	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7057	NC_021844	TAAT	2	8	2577814	2577821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_021844	GCG	2	6	2577841	2577846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_021844	T	6	6	2577861	2577866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_021844	T	6	6	2579337	2579342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021844	GAAAA	2	10	2579352	2579361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_021844	AAT	2	6	2579458	2579463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_021844	GC	4	8	2579474	2579481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7064	NC_021844	T	8	8	2579508	2579515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_021844	ATC	2	6	2579813	2579818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_021844	TGT	2	6	2583400	2583405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_021844	GCGAGC	2	12	2583426	2583437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_021844	TGT	2	6	2583486	2583491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021844	T	7	7	2583498	2583504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021844	TCA	2	6	2583563	2583568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_021844	GGC	2	6	2584766	2584771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7073	NC_021844	CGC	2	6	2584844	2584849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7076	NC_021844	TG	3	6	2585004	2585009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7079	NC_021844	CGC	2	6	2585057	2585062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7099	NC_021844	ATA	2	6	2590399	2590404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_021844	ATAAA	2	10	2594177	2594186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_021844	ATT	2	6	2594233	2594238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_021844	TAT	2	6	2594299	2594304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7105	NC_021844	TGA	2	6	2594388	2594393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7109	NC_021844	CGT	2	6	2596350	2596355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7111	NC_021844	ACG	2	6	2597979	2597984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7113	NC_021844	GTA	2	6	2598071	2598076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7116	NC_021844	ATTA	2	8	2602481	2602488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_021844	CTGC	2	8	2603468	2603475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7121	NC_021844	ACCC	2	8	2604673	2604680	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7122	NC_021844	CG	4	8	2604690	2604697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_021844	ATTA	2	8	2604735	2604742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021844	ATA	3	9	2604746	2604754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7126	NC_021844	AATA	2	8	2604776	2604783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_021844	CAG	2	6	2604986	2604991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_021844	TGC	2	6	2604996	2605001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_021844	CCT	2	6	2606459	2606464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7130	NC_021844	ACGG	2	8	2607274	2607281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7132	NC_021844	T	7	7	2607350	2607356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_021844	TGT	2	6	2607387	2607392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7251	NC_021844	GCA	2	6	2657832	2657837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7260	NC_021844	AAAC	2	8	2665308	2665315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7261	NC_021844	CTG	2	6	2665400	2665405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7262	NC_021844	T	6	6	2665412	2665417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7263	NC_021844	TGA	2	6	2665699	2665704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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