MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021844	TCA	2	6	2361483	2361488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_021844	GAC	2	6	2361509	2361514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_021844	A	7	7	2369725	2369731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021844	A	6	6	2369735	2369740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021844	T	7	7	2369781	2369787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021844	A	6	6	2369812	2369817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021844	GCGCG	2	10	2369826	2369835	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6508	NC_021844	ATG	2	6	2369846	2369851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021844	ATT	2	6	2369897	2369902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_021844	TGA	2	6	2372103	2372108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_021844	GGCA	2	8	2372477	2372484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6512	NC_021844	AGCC	2	8	2372597	2372604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_021844	ACA	2	6	2372633	2372638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_021844	TAA	2	6	2373733	2373738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_021844	AAT	2	6	2373834	2373839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_021844	ATT	2	6	2373859	2373864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_021844	TG	3	6	2373871	2373876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_021844	TAA	2	6	2373928	2373933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021844	AT	3	6	2373935	2373940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021844	GTA	2	6	2373982	2373987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_021844	ATT	2	6	2373995	2374000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_021844	TA	3	6	2374035	2374040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_021844	TTA	2	6	2374042	2374047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_021844	ATC	2	6	2374058	2374063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_021844	AGG	2	6	2374126	2374131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_021844	AC	3	6	2374160	2374165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_021844	GATA	2	8	2374170	2374177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_021844	GCCC	2	8	2374239	2374246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6529	NC_021844	T	6	6	2375215	2375220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_021844	A	6	6	2375297	2375302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_021844	CTGGG	2	10	2375349	2375358	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6532	NC_021844	TGC	2	6	2375363	2375368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_021844	AGG	2	6	2375376	2375381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_021844	A	6	6	2375395	2375400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_021844	CTG	2	6	2380059	2380064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_021844	GAC	2	6	2380077	2380082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_021844	TTA	2	6	2381119	2381124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_021844	GTAA	2	8	2381144	2381151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_021844	TGA	2	6	2381193	2381198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_021844	GGC	2	6	2381208	2381213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_021844	TAG	2	6	2381287	2381292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_021844	GT	3	6	2381323	2381328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_021844	AGA	2	6	2381350	2381355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021844	CGG	2	6	2381366	2381371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_021844	CCG	2	6	2381378	2381383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_021844	ACTC	2	8	2383093	2383100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_021844	CGT	2	6	2383126	2383131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_021844	ATC	2	6	2383134	2383139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_021844	AT	3	6	2383140	2383145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_021844	CCA	2	6	2383152	2383157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_021844	CTC	2	6	2383415	2383420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_021844	GAAA	2	8	2383459	2383466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_021844	TATT	2	8	2383740	2383747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021844	AATT	2	8	2383765	2383772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_021844	GAA	2	6	2383865	2383870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_021844	AT	3	6	2383872	2383877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_021844	TTA	2	6	2383961	2383966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_021844	ATG	2	6	2384007	2384012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_021844	GAA	2	6	2384026	2384031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_021844	AGG	2	6	2384046	2384051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_021844	AT	3	6	2384053	2384058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_021844	AAAG	2	8	2384064	2384071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021844	ACA	2	6	2384146	2384151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_021844	T	6	6	2384205	2384210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_021844	GCTC	2	8	2384727	2384734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_021844	TCA	2	6	2384852	2384857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_021844	AAT	2	6	2384886	2384891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_021844	GA	3	6	2384923	2384928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_021844	TAT	2	6	2384936	2384941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_021844	TTAT	2	8	2384985	2384992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_021844	ATT	2	6	2384996	2385001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_021844	TG	3	6	2385370	2385375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_021844	TCT	2	6	2385422	2385427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6575	NC_021844	T	7	7	2392884	2392890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_021844	ACT	2	6	2395673	2395678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6578	NC_021844	GCG	2	6	2396850	2396855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_021844	ATC	2	6	2396883	2396888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_021844	TAG	2	6	2396913	2396918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_021844	GTG	2	6	2397012	2397017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_021844	CGT	2	6	2398570	2398575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_021844	CAGGC	2	10	2398589	2398598	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6584	NC_021844	CCG	2	6	2398675	2398680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_021844	AAT	2	6	2398726	2398731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_021844	T	6	6	2398761	2398766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_021844	CGAAC	2	10	2398975	2398984	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6588	NC_021844	T	7	7	2398996	2399002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_021844	GCG	2	6	2399011	2399016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_021844	TGC	2	6	2399019	2399024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6592	NC_021844	T	6	6	2399113	2399118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_021844	GCC	2	6	2399135	2399140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_021844	ATA	2	6	2399176	2399181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_021844	AGC	2	6	2399216	2399221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6597	NC_021844	TGA	2	6	2399635	2399640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_021844	TTC	2	6	2399777	2399782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_021844	TA	3	6	2399933	2399938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_021844	CTT	2	6	2399979	2399984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_021844	CT	3	6	2399985	2399990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_021844	A	6	6	2400006	2400011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021844	A	6	6	2400015	2400020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021844	ACT	2	6	2400053	2400058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6607	NC_021844	GCT	2	6	2400256	2400261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_021844	CCA	2	6	2400262	2400267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_021844	CTG	2	6	2400302	2400307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_021844	TATTGA	2	12	2400347	2400358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021844	TGAA	2	8	2400397	2400404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021844	TTA	2	6	2400478	2400483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_021844	ATC	2	6	2400502	2400507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_021844	CTG	2	6	2400508	2400513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_021844	A	6	6	2400575	2400580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_021844	A	7	7	2400600	2400606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_021844	TTGG	2	8	2400660	2400667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021844	A	6	6	2401739	2401744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_021844	CAG	2	6	2401749	2401754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6621	NC_021844	TCA	2	6	2401836	2401841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_021844	AGG	2	6	2401845	2401850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_021844	CT	3	6	2402394	2402399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_021844	TTTTA	2	10	2402980	2402989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021844	TA	3	6	2404109	2404114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021844	TGT	3	9	2404170	2404178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_021844	CTTTT	2	10	2404251	2404260	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6628	NC_021844	ATA	2	6	2404773	2404778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021844	GA	3	6	2404788	2404793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_021844	ATT	2	6	2407554	2407559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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