MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 13210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021844	ATC	2	6	2062538	2062543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_021844	CGA	2	6	2062629	2062634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_021844	ATT	2	6	2062649	2062654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021844	C	6	6	2062789	2062794	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5505	NC_021844	CCT	2	6	2062831	2062836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_021844	AGG	2	6	2062895	2062900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021844	ACA	2	6	2062927	2062932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_021844	GGT	2	6	2062999	2063004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021844	A	6	6	2063011	2063016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021844	ATGA	2	8	2063041	2063048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021844	A	6	6	2063123	2063128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021844	CTTCT	2	10	2063183	2063192	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5513	NC_021844	CCAG	2	8	2063260	2063267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_021844	TTAT	2	8	2063299	2063306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021844	GAA	2	6	2063316	2063321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021844	CTGT	2	8	2063325	2063332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_021844	CAG	2	6	2063421	2063426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_021844	TCT	2	6	2063468	2063473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_021844	T	6	6	2063473	2063478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_021844	ATA	2	6	2063573	2063578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021844	TAAA	2	8	2063668	2063675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_021844	TAAA	2	8	2063699	2063706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021844	TATTT	2	10	2063724	2063733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021844	AATT	2	8	2063742	2063749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021844	TGGC	2	8	2063784	2063791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_021844	C	7	7	2063795	2063801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5527	NC_021844	GGA	2	6	2063802	2063807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_021844	ATCA	2	8	2063843	2063850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5529	NC_021844	ACTTC	2	10	2063851	2063860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5530	NC_021844	AGCC	2	8	2063870	2063877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_021844	CGC	2	6	2063962	2063967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_021844	CT	3	6	2064082	2064087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_021844	CTG	2	6	2064115	2064120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021844	GGC	2	6	2064305	2064310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_021844	ATAA	2	8	2064351	2064358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021844	T	6	6	2064376	2064381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021844	AT	3	6	2064437	2064442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021844	TAA	2	6	2064475	2064480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021844	TTA	2	6	2064492	2064497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021844	AAC	2	6	2064520	2064525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_021844	TCT	2	6	2064526	2064531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_021844	TGT	2	6	2064534	2064539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021844	CTG	2	6	2064543	2064548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_021844	CAGC	2	8	2064551	2064558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_021844	GGT	2	6	2064584	2064589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021844	GGC	2	6	2064622	2064627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_021844	CAT	2	6	2064724	2064729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_021844	TGA	2	6	2064790	2064795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021844	ACAG	2	8	2064828	2064835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_021844	GCT	2	6	2064840	2064845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_021844	TGTT	2	8	2064847	2064854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021844	TGG	2	6	2064946	2064951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021844	GCAG	2	8	2064985	2064992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_021844	TTA	2	6	2064999	2065004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021844	CAG	2	6	2065022	2065027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_021844	ATT	2	6	2065034	2065039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021844	ATG	2	6	2065041	2065046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_021844	GTGC	2	8	2065106	2065113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_021844	CAT	2	6	2065177	2065182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_021844	CAT	2	6	2065194	2065199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021844	TTGAG	2	10	2065206	2065215	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021844	TAGT	2	8	2065246	2065253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021844	CTA	2	6	2065265	2065270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_021844	TGCT	2	8	2065376	2065383	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_021844	AT	3	6	2065384	2065389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021844	AC	3	6	2066032	2066037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_021844	A	6	6	2066200	2066205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021844	TTA	2	6	2066211	2066216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_021844	ATT	2	6	2066308	2066313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021844	TTA	2	6	2066318	2066323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021844	A	7	7	2067261	2067267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_021844	A	6	6	2067289	2067294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021844	TTC	2	6	2067303	2067308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5575	NC_021844	AGA	2	6	2067348	2067353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021844	ATA	2	6	2067377	2067382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5580	NC_021844	TTG	2	6	2067517	2067522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_021844	TGTT	2	8	2067756	2067763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_021844	A	6	6	2067778	2067783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021844	AGG	2	6	2067810	2067815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_021844	GCG	2	6	2068038	2068043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_021844	TTG	2	6	2068121	2068126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_021844	GTTT	2	8	2068212	2068219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021844	TTAA	2	8	2068336	2068343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_021844	TA	3	6	2068344	2068349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021844	AGAA	2	8	2068367	2068374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021844	TTG	2	6	2068378	2068383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_021844	T	7	7	2068411	2068417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021844	AAT	2	6	2068442	2068447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021844	GGAA	2	8	2068871	2068878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021844	TCA	2	6	2068941	2068946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021844	ACTGA	2	10	2068955	2068964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5601	NC_021844	GTAA	2	8	2068969	2068976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021844	TTAT	2	8	2070123	2070130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021844	A	6	6	2070151	2070156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021844	GGC	2	6	2070179	2070184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_021844	TAT	2	6	2070201	2070206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021844	TAA	2	6	2070238	2070243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021844	CT	3	6	2070293	2070298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_021844	TTCT	2	8	2070357	2070364	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_021844	CTG	2	6	2070404	2070409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_021844	TGT	2	6	2070436	2070441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_021844	TGT	2	6	2070576	2070581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021844	TGT	2	6	2070594	2070599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021844	CCTT	2	8	2070631	2070638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_021844	ATC	2	6	2070971	2070976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_021844	GGT	2	6	2071024	2071029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021844	AAAC	2	8	2071250	2071257	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_021844	TTAT	2	8	2071282	2071289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021844	TGC	2	6	2071754	2071759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_021844	AT	3	6	2071807	2071812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021844	AC	3	6	2071829	2071834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_021844	TA	3	6	2072002	2072007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021844	CTG	2	6	2072058	2072063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_021844	ATTA	2	8	2072080	2072087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021844	AGA	2	6	2072126	2072131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021844	T	6	6	2072626	2072631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_021844	ATTA	2	8	2072700	2072707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_021844	TGT	2	6	2072791	2072796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_021844	TGC	2	6	2072816	2072821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_021844	GTCG	2	8	2072822	2072829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5631	NC_021844	TAT	2	6	2072924	2072929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_021844	TTG	2	6	2073384	2073389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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