MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1 plasmid

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021832	T	17	17	1	17	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021832	AAT	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021832	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021832	A	7	7	69	75	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021832	TAA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021832	TAA	3	9	141	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021832	T	7	7	185	191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021832	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021832	AAATT	2	10	1189	1198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021832	AAC	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021832	TAA	2	6	1210	1215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021832	AT	3	6	1240	1245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021832	TTTTA	2	10	1248	1257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021832	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021832	TAAC	2	8	1300	1307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021832	ATC	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021832	ATA	2	6	1561	1566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021832	TA	3	6	1565	1570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021832	A	6	6	1575	1580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021832	ATAA	2	8	1584	1591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021832	TAAT	2	8	1600	1607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021832	AGC	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021832	ATA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021832	CTT	2	6	1730	1735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021832	A	6	6	1739	1744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021832	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021832	ATT	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021832	A	6	6	1850	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021832	GTT	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021832	T	7	7	1870	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021832	A	7	7	1905	1911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021832	A	9	9	1937	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021832	GCGA	2	8	1956	1963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021832	GT	3	6	1987	1992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021832	A	8	8	2003	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021832	ATTTT	2	10	2060	2069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021832	T	6	6	2066	2071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021832	ATT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021832	TAA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021832	TCT	3	9	2101	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021832	A	9	9	2830	2838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021832	CCT	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021832	AAGG	2	8	2875	2882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021832	ATA	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021832	A	7	7	2925	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021832	T	6	6	2938	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021832	T	6	6	2948	2953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021832	TAA	2	6	2999	3004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021832	ATTA	2	8	3006	3013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021832	AGG	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021832	T	7	7	3488	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021832	T	7	7	3496	3502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021832	TAAT	2	8	3511	3518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021832	AAT	2	6	5158	5163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021832	TGT	2	6	5240	5245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021832	TTC	2	6	5271	5276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021832	ACA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021832	TAT	2	6	5298	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021832	TA	3	6	5313	5318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021832	A	7	7	5872	5878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021832	T	9	9	5920	5928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021832	T	10	10	5930	5939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021832	T	7	7	6563	6569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021832	T	8	8	6574	6581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021832	T	6	6	7109	7114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021832	T	8	8	7119	7126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021832	A	7	7	7149	7155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021832	GTTTT	2	10	7602	7611	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021832	T	7	7	7608	7614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021832	TAAAAT	2	12	7619	7630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021832	AT	3	6	7629	7634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021832	A	6	6	7650	7655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021832	A	9	9	7662	7670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021832	A	9	9	7684	7692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021832	A	8	8	7733	7740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021832	A	6	6	7745	7750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021832	A	9	9	8203	8211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021832	TACT	2	8	8212	8219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021832	T	6	6	8261	8266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021832	TACCAA	2	12	8283	8294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021832	T	6	6	8298	8303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021832	TCT	2	6	8310	8315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021832	A	7	7	8327	8333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021832	ATT	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021832	A	7	7	8348	8354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021832	GTTA	2	8	8363	8370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021832	A	6	6	8390	8395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021832	TGT	2	6	8464	8469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021832	T	7	7	8469	8475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021832	T	7	7	8478	8484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021832	TAT	2	6	8486	8491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021832	T	8	8	8513	8520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021832	AGC	2	6	8539	8544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021832	ATT	2	6	8555	8560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021832	A	6	6	9669	9674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021832	AT	3	6	9686	9691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021832	TTATA	2	10	9692	9701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021832	TATAA	2	10	9706	9715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021832	TA	3	6	9722	9727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021832	TA	3	6	9733	9738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021832	TA	4	8	9740	9747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021832	ATA	2	6	9758	9763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021832	TA	3	6	9762	9767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021832	ATT	2	6	9771	9776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021832	T	6	6	9781	9786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021832	ATT	2	6	9822	9827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021832	TAC	2	6	9858	9863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021832	A	6	6	9884	9889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021832	ATT	2	6	9893	9898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021832	T	6	6	9906	9911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021832	TA	3	6	9914	9919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021832	T	8	8	9928	9935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021832	ATC	2	6	9957	9962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021832	T	7	7	9983	9989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021832	TAA	2	6	9998	10003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021832	TTA	2	6	10039	10044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021832	TTA	2	6	10059	10064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021832	ATTAT	2	10	10072	10081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021832	A	7	7	10093	10099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021832	TAAAA	2	10	10115	10124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021832	A	7	7	10127	10133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021832	ATTTG	2	10	10182	10191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021832	ACA	2	6	10207	10212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021832	AACAA	2	10	10245	10254	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021832	AGT	2	6	10299	10304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021832	A	6	6	10328	10333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021832	GA	3	6	10357	10362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021832	ATT	2	6	10872	10877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021832	A	6	6	10903	10908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021832	T	7	7	10926	10932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021832	T	7	7	10934	10940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021832	ATT	2	6	10967	10972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021832	TTAA	2	8	10996	11003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021832	ACTTA	2	10	11030	11039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021832	GAA	2	6	11076	11081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021832	T	16	16	11103	11118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021832	AAT	2	6	11125	11130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.