MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021820	AT	4	8	1497523	1497530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021820	ATT	2	6	1497538	1497543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021820	GTTT	2	8	1497553	1497560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021820	GCT	2	6	1497607	1497612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_021820	AAT	2	6	1497625	1497630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021820	T	7	7	1497636	1497642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021820	A	6	6	1497647	1497652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021820	GT	3	6	1497667	1497672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021820	A	7	7	1497681	1497687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021820	CAT	2	6	1497696	1497701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021820	GGA	2	6	1497720	1497725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021820	GAC	2	6	1498184	1498189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_021820	T	6	6	1498211	1498216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021820	CTT	2	6	1499853	1499858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_021820	TGA	2	6	1500821	1500826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021820	GCGCT	2	10	1500839	1500848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4017	NC_021820	CGCGT	2	10	1500891	1500900	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4018	NC_021820	G	6	6	1501771	1501776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021820	TAA	2	6	1503736	1503741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021820	AG	3	6	1503786	1503791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021820	CAT	2	6	1503813	1503818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_021820	CGC	2	6	1503822	1503827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_021820	AACG	2	8	1504826	1504833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_021820	ACGC	2	8	1505427	1505434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_021820	TAA	2	6	1505447	1505452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021820	GA	3	6	1509286	1509291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021820	TCT	3	9	1509294	1509302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_021820	GTC	2	6	1509303	1509308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021820	GAA	2	6	1509314	1509319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021820	TCC	2	6	1511993	1511998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_021820	ATAA	2	8	1511999	1512006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021820	TTA	2	6	1512021	1512026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021820	CCTT	2	8	1512029	1512036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_021820	CGA	2	6	1512096	1512101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_021820	TGC	2	6	1512116	1512121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021820	TAA	3	9	1512127	1512135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021820	TCA	2	6	1512161	1512166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021820	CAATAT	2	12	1518220	1518231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4039	NC_021820	CTGTC	2	10	1518287	1518296	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4040	NC_021820	AAG	2	6	1518333	1518338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021820	GC	3	6	1518382	1518387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_021820	TGA	2	6	1518440	1518445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021820	AAT	2	6	1518468	1518473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021820	TAA	3	9	1518562	1518570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021820	ATA	2	6	1518591	1518596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021820	ATT	2	6	1518601	1518606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021820	T	6	6	1518605	1518610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021820	TAA	2	6	1518618	1518623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021820	A	6	6	1518622	1518627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021820	AAAT	2	8	1518639	1518646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021820	A	8	8	1518665	1518672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021820	T	6	6	1518685	1518690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021820	T	8	8	1518692	1518699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021820	AAAT	2	8	1518717	1518724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021820	TA	3	6	1518740	1518745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021820	T	7	7	1518767	1518773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021820	T	7	7	1518796	1518802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021820	CTTG	2	8	1518814	1518821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_021820	TTTG	2	8	1518823	1518830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021820	T	6	6	1518831	1518836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021820	TAT	2	6	1518853	1518858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021820	TAAA	2	8	1518877	1518884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021820	A	6	6	1518882	1518887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021820	TTAT	2	8	1518939	1518946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021820	GTT	2	6	1518953	1518958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021820	CTT	2	6	1518961	1518966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_021820	ATATA	2	10	1519000	1519009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021820	CTA	2	6	1519013	1519018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_021820	TG	3	6	1519048	1519053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021820	TAA	2	6	1519081	1519086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021820	ATC	2	6	1519664	1519669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021820	GAT	2	6	1519689	1519694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021820	A	7	7	1519704	1519710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021820	TA	3	6	1519716	1519721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021820	A	9	9	1525589	1525597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021820	GGC	2	6	1525604	1525609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_021820	GTT	2	6	1525629	1525634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021820	TCT	2	6	1527093	1527098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021820	C	6	6	1534410	1534415	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4080	NC_021820	TGCTC	2	10	1534488	1534497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4081	NC_021820	AGG	2	6	1534500	1534505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021820	CGG	2	6	1535672	1535677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_021820	AT	3	6	1535703	1535708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021820	AC	3	6	1535748	1535753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_021820	TCA	2	6	1536155	1536160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_021820	AAT	2	6	1536175	1536180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021820	CCA	2	6	1536202	1536207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_021820	A	7	7	1536216	1536222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021820	AGA	2	6	1536237	1536242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021820	GCG	2	6	1536270	1536275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021820	G	6	6	1537698	1537703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021820	ATAA	2	8	1538569	1538576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021820	CT	3	6	1541396	1541401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_021820	GCC	2	6	1541403	1541408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_021820	GAT	2	6	1542306	1542311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021820	AAT	2	6	1542318	1542323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021820	TCAG	2	8	1542346	1542353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_021820	T	6	6	1542422	1542427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021820	ACTG	2	8	1542438	1542445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_021820	TGC	2	6	1542474	1542479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_021820	CAA	2	6	1542524	1542529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_021820	GC	3	6	1542563	1542568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_021820	AC	3	6	1542594	1542599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_021820	AAC	2	6	1542632	1542637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_021820	AC	4	8	1542636	1542643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_021820	GGC	2	6	1543503	1543508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_021820	GTA	2	6	1543616	1543621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021820	GAG	2	6	1544578	1544583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021820	CTT	2	6	1544598	1544603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021820	CT	3	6	1544611	1544616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_021820	GAAA	2	8	1544706	1544713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021820	TTA	2	6	1545489	1545494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021820	TG	3	6	1545539	1545544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021820	GTCTG	2	10	1545548	1545557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_021820	GTG	2	6	1546195	1546200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021820	AGA	2	6	1546216	1546221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021820	GCG	2	6	1546240	1546245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_021820	AGA	2	6	1547497	1547502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021820	T	6	6	1547569	1547574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021820	T	6	6	1547604	1547609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021820	CG	3	6	1547698	1547703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_021820	A	6	6	1547782	1547787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021820	TTAG	2	8	1550792	1550799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021820	GAA	2	6	1550800	1550805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021820	ATA	2	6	1550809	1550814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021820	TTA	2	6	1554935	1554940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021820	T	7	7	1562486	1562492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021820	GCAG	2	8	1562588	1562595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_021820	T	6	6	1564443	1564448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021820	GCGCT	2	10	1568404	1568413	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4131	NC_021820	CAC	2	6	1568461	1568466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_021820	CAA	2	6	1568474	1568479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_021820	CCT	2	6	1568937	1568942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_021820	CAA	2	6	1570887	1570892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_021820	A	7	7	1572672	1572678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_021820	AATG	2	8	1573850	1573857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4141	NC_021820	ATCA	2	8	1576590	1576597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4242	NC_021820	CCGT	2	8	1583324	1583331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_021820	TTA	2	6	1583340	1583345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_021820	ACAAA	2	10	1586545	1586554	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4250	NC_021820	AGTG	2	8	1586573	1586580	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_021820	AGA	2	6	1586597	1586602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_021820	TGC	2	6	1587492	1587497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_021820	TCG	2	6	1588344	1588349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_021820	GAC	2	6	1589749	1589754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_021820	AAT	2	6	1590565	1590570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_021820	ATC	2	6	1592592	1592597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_021820	GCA	2	6	1592613	1592618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_021820	CCTG	2	8	1592728	1592735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_021820	CCGT	2	8	1592763	1592770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4261	NC_021820	A	8	8	1592817	1592824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_021820	T	8	8	1592850	1592857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_021820	AAG	2	6	1592865	1592870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_021820	AAT	2	6	1597042	1597047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4377	NC_021820	TCTGT	2	10	1636589	1636598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4378	NC_021820	TCC	2	6	1636600	1636605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4380	NC_021820	AAT	2	6	1636649	1636654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_021820	GATG	2	8	1636875	1636882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4382	NC_021820	T	6	6	1636925	1636930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4383	NC_021820	GAT	2	6	1636936	1636941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_021820	CA	3	6	1636958	1636963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_021820	ATG	2	6	1638019	1638024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_021820	GTC	2	6	1638063	1638068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4387	NC_021820	ATG	2	6	1638093	1638098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_021820	ATA	2	6	1638115	1638120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_021820	TCC	2	6	1638259	1638264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4390	NC_021820	A	6	6	1639113	1639118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_021820	A	6	6	1639155	1639160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_021820	TCG	2	6	1639193	1639198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4393	NC_021820	AGATGA	2	12	1639296	1639307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_021820	TTA	2	6	1639804	1639809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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