MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021820	CGT	2	6	1296045	1296050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_021820	ATC	2	6	1296054	1296059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_021820	CTGT	2	8	1297112	1297119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_021820	CCTTC	2	10	1297120	1297129	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3505	NC_021820	AAT	2	6	1297168	1297173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021820	TAG	2	6	1297780	1297785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021820	TCC	2	6	1297792	1297797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_021820	GGA	2	6	1297805	1297810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021820	ATC	2	6	1298400	1298405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_021820	ATA	2	6	1298463	1298468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021820	TAA	2	6	1298497	1298502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021820	GAAAA	2	10	1298507	1298516	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021820	TCTTT	2	10	1299768	1299777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_021820	TTA	2	6	1299778	1299783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021820	ATTTA	2	10	1299810	1299819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021820	TCTG	2	8	1299835	1299842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_021820	A	6	6	1299869	1299874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021820	T	6	6	1299875	1299880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021820	TGA	2	6	1299892	1299897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021820	GTG	2	6	1299932	1299937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021820	A	8	8	1299944	1299951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021820	TTA	2	6	1299986	1299991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021820	ATG	2	6	1300007	1300012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021820	TTC	2	6	1303199	1303204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021820	T	6	6	1303226	1303231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021820	TTG	2	6	1303280	1303285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021820	CAG	2	6	1303323	1303328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_021820	A	7	7	1303350	1303356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021820	GTGAT	2	10	1303358	1303367	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021820	T	6	6	1303383	1303388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021820	TAT	2	6	1303416	1303421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021820	T	7	7	1303431	1303437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021820	ATG	2	6	1304447	1304452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021820	CCT	2	6	1304468	1304473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_021820	ATT	2	6	1304501	1304506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021820	T	6	6	1304924	1304929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021820	TATTG	2	10	1306022	1306031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021820	ATT	2	6	1306058	1306063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021820	GTT	2	6	1306150	1306155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021820	GTT	2	6	1306174	1306179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021820	ATC	2	6	1306203	1306208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021820	GAT	2	6	1306215	1306220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021820	T	6	6	1306237	1306242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021820	CCA	2	6	1308477	1308482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_021820	TTA	2	6	1311612	1311617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021820	TCTTAA	2	12	1311649	1311660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3547	NC_021820	TTAT	2	8	1311711	1311718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021820	AT	3	6	1312502	1312507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021820	GTT	2	6	1312562	1312567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021820	ACA	2	6	1312641	1312646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021820	GAT	2	6	1312678	1312683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021820	TAA	2	6	1312705	1312710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021820	TAA	2	6	1312712	1312717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021820	ACG	2	6	1312752	1312757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021820	AAG	2	6	1312799	1312804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021820	T	7	7	1312809	1312815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021820	GAA	2	6	1312845	1312850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021820	CAG	2	6	1312855	1312860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021820	A	6	6	1312871	1312876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021820	T	7	7	1313471	1313477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021820	CG	3	6	1313510	1313515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_021820	GT	3	6	1321487	1321492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021820	ATA	2	6	1321580	1321585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021820	T	6	6	1321592	1321597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021820	T	6	6	1321600	1321605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021820	T	6	6	1321632	1321637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021820	CAT	2	6	1321647	1321652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021820	TTTTA	2	10	1321657	1321666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021820	TAA	2	6	1321701	1321706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021820	GTG	2	6	1321746	1321751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021820	ATG	2	6	1321773	1321778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021820	CCAG	2	8	1321792	1321799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_021820	ATA	3	9	1323295	1323303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021820	T	6	6	1323349	1323354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021820	ATCGT	2	10	1323364	1323373	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3576	NC_021820	ATG	2	6	1323383	1323388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021820	T	6	6	1323390	1323395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021820	ATTTT	2	10	1323408	1323417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021820	TAG	2	6	1323441	1323446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021820	TGAT	2	8	1323478	1323485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021820	TTG	2	6	1323489	1323494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021820	AAT	2	6	1323501	1323506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021820	A	6	6	1323539	1323544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021820	TAG	2	6	1323598	1323603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021820	TTTTA	2	10	1323669	1323678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021820	ATT	2	6	1323680	1323685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021820	TTG	2	6	1323699	1323704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021820	TGT	2	6	1323738	1323743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021820	TCA	2	6	1327200	1327205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_021820	ATTA	2	8	1327211	1327218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021820	TGT	2	6	1328013	1328018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021820	AAG	2	6	1328022	1328027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021820	TGT	2	6	1328118	1328123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021820	TTA	2	6	1328124	1328129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021820	TGT	2	6	1328163	1328168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021820	AAT	2	6	1328214	1328219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021820	AT	3	6	1328277	1328282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021820	T	7	7	1328350	1328356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021820	AT	3	6	1328392	1328397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021820	AAT	2	6	1328426	1328431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021820	GAA	2	6	1328457	1328462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021820	AT	5	10	1328479	1328488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021820	AATT	2	8	1328494	1328501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021820	AT	3	6	1328535	1328540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021820	AAT	2	6	1330074	1330079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021820	A	6	6	1330083	1330088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021820	GTA	2	6	1331362	1331367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021820	TAAAA	2	10	1332637	1332646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021820	TGA	2	6	1332651	1332656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021820	GTT	2	6	1332660	1332665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021820	ATC	2	6	1334480	1334485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_021820	TGAC	2	8	1334488	1334495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_021820	A	6	6	1334502	1334507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021820	A	6	6	1334536	1334541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021820	TA	4	8	1334554	1334561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021820	TAG	2	6	1334596	1334601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021820	GAA	2	6	1334606	1334611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021820	GA	3	6	1334623	1334628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021820	GA	3	6	1335857	1335862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021820	TACC	2	8	1336767	1336774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_021820	AAC	2	6	1340308	1340313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021820	ATT	2	6	1340340	1340345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021820	AGTA	2	8	1340383	1340390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021820	AGT	2	6	1340405	1340410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021820	ATCA	2	8	1340423	1340430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_021820	ATT	2	6	1340431	1340436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021820	TTA	2	6	1340459	1340464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021820	GGT	2	6	1340497	1340502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021820	T	6	6	1340508	1340513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021820	GAAA	2	8	1340543	1340550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021820	AGGG	2	8	1340576	1340583	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021820	A	6	6	1340591	1340596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021820	A	7	7	1340673	1340679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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