MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021820	ATT	2	6	325163	325168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021820	A	6	6	325873	325878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021820	TTA	2	6	325942	325947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021820	TCT	2	6	325953	325958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021820	TTAT	2	8	325959	325966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021820	A	7	7	325972	325978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021820	CTT	2	6	326105	326110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021820	A	7	7	326124	326130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021820	GTA	2	6	326132	326137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021820	TCC	2	6	327622	327627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_021820	CT	3	6	327661	327666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_021820	ACG	2	6	327688	327693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021820	GTA	2	6	329587	329592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021820	T	7	7	329621	329627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021820	TTCT	2	8	329648	329655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_021820	TGG	2	6	329659	329664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021820	GCCT	2	8	329690	329697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_021820	TCT	2	6	329723	329728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021820	GAT	2	6	331543	331548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021820	T	6	6	332402	332407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021820	TTAAA	2	10	332420	332429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021820	CTGGT	2	10	333840	333849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1023	NC_021820	T	7	7	333866	333872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021820	TCA	2	6	333883	333888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021820	TCA	2	6	333916	333921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021820	AAC	2	6	333954	333959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021820	CGT	2	6	335130	335135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1030	NC_021820	A	7	7	339456	339462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021820	CA	3	6	339467	339472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_021820	CCT	2	6	339519	339524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_021820	G	6	6	340902	340907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021820	T	6	6	341500	341505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021820	ACA	2	6	344605	344610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021820	AT	3	6	344721	344726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021820	T	6	6	344828	344833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021820	TTG	2	6	344897	344902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021820	GCAG	2	8	344913	344920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1041	NC_021820	CT	3	6	344962	344967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_021820	CGC	2	6	344985	344990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_021820	CAG	2	6	345003	345008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_021820	TCTG	2	8	345060	345067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_021820	AGG	2	6	345122	345127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021820	ATTT	2	8	345208	345215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_021820	CAA	2	6	345301	345306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1052	NC_021820	A	7	7	347278	347284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021820	T	6	6	347294	347299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021820	T	6	6	347305	347310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021820	AGG	2	6	347323	347328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021820	TTA	2	6	347473	347478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021820	TAT	2	6	347534	347539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_021820	T	6	6	348824	348829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021820	T	6	6	348836	348841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021820	TTG	2	6	350415	350420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021820	A	7	7	350425	350431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021820	GC	3	6	350495	350500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_021820	GGC	2	6	350511	350516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021820	CGGG	2	8	352217	352224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_021820	CAC	2	6	352235	352240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_021820	CAAC	2	8	352281	352288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1069	NC_021820	TTA	2	6	352785	352790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021820	ACG	3	9	352824	352832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021820	GAC	2	6	352844	352849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021820	TAG	2	6	352856	352861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021820	TAA	2	6	353034	353039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021820	AGC	2	6	353111	353116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021820	T	6	6	353241	353246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_021820	CAA	2	6	353528	353533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_021820	AC	4	8	356210	356217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_021820	CTGC	2	8	360760	360767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_021820	GCAG	2	8	360771	360778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_021820	CTC	2	6	361985	361990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_021820	TTG	2	6	363305	363310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_021820	T	6	6	363507	363512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_021820	GTA	2	6	364531	364536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_021820	ACG	2	6	364574	364579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_021820	TAC	2	6	364596	364601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_021820	AG	3	6	364638	364643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021820	CT	3	6	364663	364668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_021820	CAA	2	6	367997	368002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021820	AC	3	6	368039	368044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_021820	GCC	2	6	372193	372198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_021820	TTG	2	6	372222	372227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021820	TGG	2	6	372229	372234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021820	AAAT	2	8	378449	378456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021820	ATT	2	6	378504	378509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021820	CAAT	2	8	378515	378522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_021820	ATG	2	6	378527	378532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021820	A	7	7	378566	378572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021820	TAAT	2	8	378580	378587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021820	AGG	2	6	381330	381335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021820	GAC	2	6	381342	381347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021820	GTGGC	2	10	386309	386318	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_021820	ATG	2	6	386380	386385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021820	A	8	8	388129	388136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021820	ATG	2	6	388239	388244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021820	CTT	2	6	388786	388791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021820	CCTTG	2	10	389243	389252	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_021820	T	7	7	389274	389280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021820	TA	3	6	389360	389365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021820	GAA	2	6	389417	389422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021820	T	7	7	391239	391245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021820	TGC	2	6	391441	391446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021820	CAA	2	6	391469	391474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021820	AACG	2	8	391493	391500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_021820	GTC	2	6	391525	391530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021820	TGAG	2	8	392829	392836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021820	ATG	2	6	395599	395604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021820	T	6	6	395687	395692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021820	T	7	7	395700	395706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021820	TTA	2	6	396670	396675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021820	A	7	7	398943	398949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021820	A	6	6	398951	398956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021820	TGC	2	6	398968	398973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021820	AAG	2	6	399014	399019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021820	CAA	2	6	399079	399084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021820	CGT	2	6	399971	399976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021820	CAC	2	6	400320	400325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_021820	TCA	2	6	400466	400471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_021820	CTG	2	6	400517	400522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_021820	ACC	2	6	400551	400556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_021820	T	6	6	400591	400596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_021820	ATC	2	6	400622	400627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1147	NC_021820	GTC	2	6	400882	400887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1151	NC_021820	T	6	6	400954	400959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_021820	T	6	6	412477	412482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_021820	GCC	2	6	413190	413195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1260	NC_021820	A	6	6	445485	445490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_021820	CCA	2	6	447025	447030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_021820	CAT	2	6	447430	447435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_021820	TGCGC	2	10	447583	447592	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1274	NC_021820	CTT	2	6	447906	447911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1396	NC_021820	AG	3	6	505932	505937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1397	NC_021820	TAT	2	6	507203	507208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1400	NC_021820	ATG	2	6	507337	507342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_021820	TTAT	2	8	512835	512842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_021820	TTAAT	2	10	512862	512871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_021820	TA	3	6	518137	518142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_021820	TTAT	2	8	518161	518168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_021820	TCA	2	6	518178	518183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_021820	TTAT	2	8	518270	518277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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