MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021820	CAATAA	2	12	4198774	4198785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11502	NC_021820	AC	3	6	4201411	4201416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_021820	GCG	2	6	4201457	4201462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_021820	GCC	2	6	4201470	4201475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_021820	CG	3	6	4201731	4201736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_021820	CCT	2	6	4201749	4201754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_021820	CAC	2	6	4202676	4202681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_021820	GT	3	6	4202692	4202697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_021820	AGG	2	6	4202733	4202738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021820	A	6	6	4203444	4203449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_021820	TTG	2	6	4203475	4203480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_021820	ATTA	2	8	4203531	4203538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_021820	ATC	3	9	4203736	4203744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_021820	ACA	2	6	4203836	4203841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_021820	TAAT	2	8	4203902	4203909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_021820	AAC	3	9	4203914	4203922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_021820	CGC	2	6	4203931	4203936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_021820	A	6	6	4203941	4203946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_021820	CA	3	6	4203947	4203952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11520	NC_021820	TAAA	2	8	4203984	4203991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_021820	TTA	2	6	4204012	4204017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_021820	TA	3	6	4204016	4204021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_021820	ACCA	2	8	4204066	4204073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_021820	CTTAC	2	10	4204977	4204986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11525	NC_021820	CAG	2	6	4205052	4205057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_021820	GGA	2	6	4205099	4205104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_021820	CAT	2	6	4205477	4205482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_021820	CT	3	6	4206882	4206887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11529	NC_021820	TCA	2	6	4206919	4206924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_021820	GAG	2	6	4206929	4206934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_021820	TTG	2	6	4207378	4207383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021820	CGC	2	6	4207448	4207453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_021820	TCA	2	6	4207496	4207501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_021820	GCG	2	6	4207502	4207507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_021820	AATC	2	8	4207512	4207519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11536	NC_021820	AC	3	6	4207583	4207588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11537	NC_021820	ACA	2	6	4211463	4211468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_021820	ATT	2	6	4211493	4211498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_021820	GTT	2	6	4211535	4211540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_021820	A	6	6	4211543	4211548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_021820	TCC	2	6	4211556	4211561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_021820	AAC	2	6	4214061	4214066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_021820	T	6	6	4215069	4215074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_021820	TC	3	6	4215121	4215126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_021820	TCA	2	6	4215142	4215147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_021820	TCA	2	6	4215167	4215172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_021820	AAT	2	6	4215200	4215205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_021820	GAA	2	6	4216519	4216524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_021820	TC	3	6	4216690	4216695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_021820	T	6	6	4216700	4216705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_021820	GGC	2	6	4216751	4216756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_021820	TAA	2	6	4216840	4216845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021820	TAA	2	6	4217467	4217472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_021820	CTG	2	6	4217502	4217507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_021820	ACA	2	6	4217517	4217522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_021820	AAT	2	6	4217542	4217547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_021820	AAC	2	6	4217560	4217565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_021820	T	6	6	4220323	4220328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021820	CAA	2	6	4220336	4220341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_021820	TAG	2	6	4221777	4221782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_021820	TTA	2	6	4221790	4221795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_021820	ATTA	2	8	4221830	4221837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_021820	TAT	2	6	4221917	4221922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_021820	CAGGC	2	10	4221927	4221936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11565	NC_021820	CGC	2	6	4221961	4221966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_021820	ATA	2	6	4221971	4221976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_021820	A	6	6	4221999	4222004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_021820	T	6	6	4222591	4222596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_021820	ATC	3	9	4222659	4222667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_021820	TAA	2	6	4224308	4224313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_021820	GGC	2	6	4224327	4224332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_021820	GGA	2	6	4225471	4225476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_021820	TATCT	2	10	4225541	4225550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11574	NC_021820	GGA	2	6	4225592	4225597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_021820	TCCT	2	8	4225646	4225653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11576	NC_021820	TATCT	2	10	4225675	4225684	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11577	NC_021820	GGA	2	6	4225726	4225731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_021820	ATG	2	6	4225799	4225804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_021820	TAC	2	6	4225807	4225812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_021820	GGA	2	6	4225862	4225867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_021820	TCCT	2	8	4225916	4225923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11582	NC_021820	TCA	2	6	4225961	4225966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_021820	GGA	2	6	4225996	4226001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_021820	GGA	2	6	4226135	4226140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_021820	ACTT	2	8	4226209	4226216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11586	NC_021820	GGA	2	6	4226274	4226279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_021820	CAC	2	6	4226432	4226437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11588	NC_021820	GAA	2	6	4226458	4226463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_021820	TCG	2	6	4226477	4226482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_021820	A	6	6	4226577	4226582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_021820	TGA	2	6	4226614	4226619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_021820	GCC	2	6	4226627	4226632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_021820	A	6	6	4226662	4226667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_021820	GCGA	2	8	4226688	4226695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_021820	AG	3	6	4226698	4226703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_021820	TC	3	6	4226957	4226962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_021820	CAT	2	6	4226980	4226985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_021820	CGC	2	6	4227120	4227125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11599	NC_021820	GCG	2	6	4227136	4227141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_021820	AACG	2	8	4227144	4227151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11601	NC_021820	GCC	2	6	4229826	4229831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11602	NC_021820	TCG	2	6	4229925	4229930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_021820	ATAAG	2	10	4229981	4229990	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_021820	A	6	6	4230526	4230531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_021820	GGC	2	6	4230604	4230609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_021820	GCCC	2	8	4230618	4230625	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11607	NC_021820	TGA	2	6	4230636	4230641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_021820	A	6	6	4232379	4232384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_021820	CAG	2	6	4232388	4232393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_021820	TTAT	2	8	4232395	4232402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_021820	GA	3	6	4232466	4232471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_021820	A	7	7	4232489	4232495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_021820	CA	3	6	4232503	4232508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_021820	AAAC	2	8	4232519	4232526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11615	NC_021820	AT	3	6	4232589	4232594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_021820	GTC	2	6	4232596	4232601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_021820	CGG	2	6	4232623	4232628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_021820	AGA	2	6	4232679	4232684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_021820	GCAG	2	8	4232695	4232702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_021820	ATA	3	9	4232722	4232730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_021820	CTCCC	2	10	4232743	4232752	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11622	NC_021820	CGC	2	6	4233895	4233900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11623	NC_021820	GA	3	6	4234087	4234092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_021820	A	6	6	4236006	4236011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_021820	ACA	2	6	4236852	4236857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_021820	AAT	2	6	4237283	4237288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_021820	GGC	2	6	4237303	4237308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11628	NC_021820	CAT	2	6	4240720	4240725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11630	NC_021820	AAC	2	6	4240821	4240826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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