MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021820	CTG	2	6	4023695	4023700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_021820	CTG	2	6	4023725	4023730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_021820	TGCC	2	8	4023750	4023757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_021820	GCG	2	6	4023760	4023765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_021820	CTT	2	6	4023803	4023808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_021820	CCA	2	6	4023809	4023814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_021820	CGT	2	6	4023848	4023853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_021820	ATC	2	6	4023900	4023905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_021820	TAA	2	6	4023914	4023919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_021820	CCA	2	6	4023947	4023952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_021820	ACC	2	6	4024039	4024044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_021820	A	6	6	4024151	4024156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_021820	GCCC	2	8	4024157	4024164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11014	NC_021820	GCAG	2	8	4024165	4024172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_021820	ATTC	2	8	4024180	4024187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_021820	TTA	2	6	4027837	4027842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021820	TCTG	2	8	4027876	4027883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11018	NC_021820	TCTGT	2	10	4027886	4027895	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11019	NC_021820	CAC	2	6	4029112	4029117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_021820	ATG	2	6	4029179	4029184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_021820	AG	3	6	4034067	4034072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_021820	TCC	2	6	4034823	4034828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_021820	TCC	2	6	4037884	4037889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_021820	TCC	2	6	4038972	4038977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_021820	CTT	2	6	4039011	4039016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_021820	CAG	2	6	4045139	4045144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_021820	CTTT	2	8	4045148	4045155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11028	NC_021820	T	7	7	4045153	4045159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_021820	A	7	7	4045162	4045168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021820	AAG	2	6	4045194	4045199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_021820	GCC	2	6	4045255	4045260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_021820	A	6	6	4045295	4045300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_021820	CTGA	2	8	4045344	4045351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_021820	GTTC	2	8	4045784	4045791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_021820	GTA	2	6	4045911	4045916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_021820	CCT	2	6	4045983	4045988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11037	NC_021820	GAT	2	6	4047255	4047260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_021820	AGTG	2	8	4047277	4047284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021820	GGTTG	2	10	4047289	4047298	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_021820	ATTG	2	8	4047420	4047427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_021820	TAA	2	6	4047486	4047491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021820	TCA	2	6	4048201	4048206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_021820	A	6	6	4048206	4048211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_021820	ACA	2	6	4048231	4048236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_021820	CAG	2	6	4048254	4048259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_021820	ATCGG	2	10	4048312	4048321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11047	NC_021820	TG	3	6	4048341	4048346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_021820	A	6	6	4048372	4048377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_021820	GCC	2	6	4048379	4048384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_021820	TC	3	6	4048606	4048611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_021820	CTT	2	6	4048614	4048619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_021820	ATC	2	6	4048668	4048673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_021820	A	6	6	4048766	4048771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021820	CCCA	2	8	4048832	4048839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11055	NC_021820	A	6	6	4048894	4048899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021820	A	6	6	4048969	4048974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021820	TTTG	2	8	4049028	4049035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021820	CGA	2	6	4049038	4049043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_021820	CGA	2	6	4049056	4049061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_021820	TTGTT	2	10	4049689	4049698	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021820	CAC	2	6	4049702	4049707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_021820	GTG	2	6	4049729	4049734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_021820	ACCG	2	8	4049763	4049770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_021820	CCA	2	6	4049798	4049803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_021820	A	6	6	4049834	4049839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_021820	ATG	3	9	4051542	4051550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_021820	GTT	2	6	4052206	4052211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_021820	GGT	2	6	4052239	4052244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021820	GAC	2	6	4052261	4052266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_021820	CTT	2	6	4052300	4052305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_021820	CAT	2	6	4052306	4052311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_021820	GATA	2	8	4052348	4052355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_021820	TGCC	2	8	4052359	4052366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11074	NC_021820	TGA	2	6	4052367	4052372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_021820	TCT	2	6	4052403	4052408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_021820	TCT	2	6	4052428	4052433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_021820	GCA	3	9	4052508	4052516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_021820	GC	3	6	4052553	4052558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11079	NC_021820	ACT	2	6	4052827	4052832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_021820	TA	3	6	4052834	4052839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_021820	AGAA	2	8	4052857	4052864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_021820	GTT	2	6	4052905	4052910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_021820	TCT	2	6	4053091	4053096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_021820	AGAA	2	8	4053122	4053129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_021820	CTG	2	6	4053134	4053139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_021820	GTT	2	6	4053142	4053147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_021820	CCG	2	6	4053212	4053217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_021820	AGT	2	6	4053262	4053267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_021820	TACC	2	8	4056821	4056828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_021820	TGC	2	6	4056885	4056890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_021820	AAT	2	6	4057519	4057524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_021820	T	6	6	4057962	4057967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_021820	CA	3	6	4057980	4057985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_021820	TGA	2	6	4058034	4058039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_021820	AAG	2	6	4058047	4058052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_021820	T	6	6	4059236	4059241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021820	CAG	2	6	4059265	4059270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_021820	AT	3	6	4059359	4059364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021820	ATC	2	6	4059384	4059389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_021820	ACC	2	6	4059452	4059457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_021820	TAG	2	6	4059851	4059856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_021820	ATGAA	2	10	4059866	4059875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_021820	AAC	2	6	4060284	4060289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_021820	AT	3	6	4060293	4060298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_021820	GAG	2	6	4064427	4064432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_021820	A	7	7	4064724	4064730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_021820	TGA	2	6	4064746	4064751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021820	TTC	2	6	4064783	4064788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_021820	ACA	2	6	4064824	4064829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_021820	AT	3	6	4064855	4064860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_021820	CAA	2	6	4064870	4064875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_021820	ACA	2	6	4064965	4064970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_021820	CAT	2	6	4066254	4066259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_021820	TGG	2	6	4066275	4066280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_021820	TCA	2	6	4066297	4066302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_021820	TTC	2	6	4066448	4066453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_021820	ATT	2	6	4066464	4066469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_021820	CGC	2	6	4066539	4066544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11119	NC_021820	CTACA	2	10	4066548	4066557	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11120	NC_021820	T	6	6	4066617	4066622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_021820	ACA	2	6	4066666	4066671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_021820	CCAAA	2	10	4069413	4069422	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11123	NC_021820	AGCA	2	8	4069466	4069473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11124	NC_021820	TTTGTT	2	12	4069515	4069526	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_021820	TGT	2	6	4069532	4069537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_021820	AAC	2	6	4069577	4069582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_021820	TCG	2	6	4069609	4069614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11129	NC_021820	TC	3	6	4069700	4069705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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