MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021820	ATA	2	6	3649502	3649507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_021820	TAAC	2	8	3649521	3649528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_021820	AAT	3	9	3649543	3649551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021820	TGCT	2	8	3651296	3651303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10005	NC_021820	GT	3	6	3651312	3651317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021820	CGT	2	6	3652451	3652456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_021820	A	6	6	3652481	3652486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_021820	TTA	2	6	3653660	3653665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_021820	T	6	6	3653691	3653696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_021820	AAT	2	6	3653762	3653767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021820	T	6	6	3653848	3653853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021820	AT	3	6	3653893	3653898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021820	TGA	2	6	3653930	3653935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021820	ATC	2	6	3653995	3654000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_021820	TTTA	2	8	3654007	3654014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021820	T	8	8	3654077	3654084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_021820	AC	3	6	3654097	3654102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_021820	AAT	2	6	3654185	3654190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_021820	AGT	2	6	3654220	3654225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_021820	TCCCG	2	10	3654264	3654273	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10021	NC_021820	ATTC	2	8	3654322	3654329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_021820	CCTTCA	2	12	3654347	3654358	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_021820	CGC	2	6	3657807	3657812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_021820	CT	3	6	3663542	3663547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_021820	ATT	2	6	3663783	3663788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_021820	ATC	2	6	3668157	3668162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_021820	GAA	2	6	3668185	3668190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_021820	T	9	9	3668214	3668222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_021820	TTG	2	6	3668228	3668233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021820	CTA	2	6	3668333	3668338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_021820	TA	4	8	3668379	3668386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_021820	G	6	6	3668432	3668437	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021820	TTTC	2	8	3668443	3668450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_021820	GCC	2	6	3670838	3670843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_021820	GCTCA	2	10	3673490	3673499	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10036	NC_021820	AAC	2	6	3674494	3674499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_021820	TTTA	2	8	3677066	3677073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021820	GTTC	2	8	3677089	3677096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10039	NC_021820	AAC	2	6	3677098	3677103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_021820	GCT	2	6	3677107	3677112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021820	AGCG	2	8	3677234	3677241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_021820	A	6	6	3677290	3677295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_021820	ATT	2	6	3681487	3681492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021820	ACG	2	6	3681578	3681583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_021820	AAT	3	9	3681662	3681670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021820	AAT	2	6	3681684	3681689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021820	AT	3	6	3681717	3681722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_021820	TAA	3	9	3681730	3681738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_021820	TACAT	2	10	3681757	3681766	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10050	NC_021820	ATG	2	6	3682871	3682876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_021820	GAA	2	6	3682883	3682888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_021820	TA	3	6	3682897	3682902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_021820	AGGCC	2	10	3682912	3682921	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10054	NC_021820	A	6	6	3687344	3687349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_021820	A	6	6	3687458	3687463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_021820	GAT	2	6	3687467	3687472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021820	ATG	2	6	3688758	3688763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021820	AGA	2	6	3688800	3688805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021820	AGG	2	6	3688817	3688822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_021820	CGA	2	6	3688832	3688837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_021820	CAT	2	6	3689534	3689539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_021820	CAA	2	6	3689567	3689572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_021820	A	6	6	3689580	3689585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_021820	TGG	2	6	3689654	3689659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_021820	GAC	2	6	3690103	3690108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_021820	GCAT	2	8	3690854	3690861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_021820	AAAGC	2	10	3690884	3690893	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10068	NC_021820	TTAAT	2	10	3690942	3690951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021820	A	6	6	3690983	3690988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_021820	GT	3	6	3701937	3701942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_021820	ATCA	2	8	3704389	3704396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10072	NC_021820	ATT	2	6	3704429	3704434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_021820	CCCT	2	8	3705762	3705769	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10074	NC_021820	A	6	6	3705804	3705809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021820	AGGG	2	8	3705824	3705831	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_021820	G	6	6	3705849	3705854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_021820	TGT	2	6	3706691	3706696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_021820	T	6	6	3707664	3707669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021820	A	6	6	3707691	3707696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_021820	TACAG	2	10	3708740	3708749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10081	NC_021820	TAT	2	6	3710615	3710620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_021820	AAT	2	6	3710640	3710645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_021820	AT	3	6	3710807	3710812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_021820	CCA	2	6	3710864	3710869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10085	NC_021820	TGC	2	6	3710926	3710931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_021820	AAT	2	6	3710942	3710947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_021820	GTT	2	6	3711073	3711078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_021820	CTG	2	6	3711107	3711112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_021820	ATT	2	6	3711199	3711204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021820	TTCG	2	8	3711260	3711267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10091	NC_021820	TCA	2	6	3711379	3711384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_021820	CCG	2	6	3711392	3711397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_021820	CGG	2	6	3711404	3711409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_021820	CAT	2	6	3711417	3711422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_021820	CA	3	6	3714498	3714503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_021820	ATC	2	6	3714561	3714566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_021820	ATT	2	6	3714672	3714677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_021820	CAA	2	6	3714732	3714737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_021820	GTG	2	6	3725382	3725387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_021820	GAAGT	2	10	3725425	3725434	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_021820	GCT	2	6	3725435	3725440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_021820	TCA	2	6	3726585	3726590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_021820	A	8	8	3726656	3726663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_021820	T	6	6	3726710	3726715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_021820	TCA	2	6	3726778	3726783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_021820	CATTAA	2	12	3726785	3726796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10107	NC_021820	G	6	6	3726829	3726834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_021820	TGT	2	6	3726841	3726846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021820	AC	4	8	3726879	3726886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_021820	CAA	2	6	3726981	3726986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_021820	T	6	6	3726996	3727001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_021820	T	6	6	3727036	3727041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_021820	A	7	7	3727125	3727131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_021820	T	6	6	3727145	3727150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_021820	T	6	6	3727166	3727171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_021820	CTTA	2	8	3728300	3728307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_021820	ATA	2	6	3728313	3728318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_021820	AT	3	6	3728338	3728343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021820	ATG	2	6	3728389	3728394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_021820	AT	3	6	3728454	3728459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021820	TAT	2	6	3728567	3728572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021820	AAT	2	6	3728577	3728582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_021820	ATT	2	6	3728623	3728628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_021820	ATA	2	6	3728660	3728665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_021820	ATTA	2	8	3728666	3728673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_021820	CATT	2	8	3728684	3728691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10127	NC_021820	C	6	6	3728717	3728722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10128	NC_021820	GCC	2	6	3728723	3728728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_021820	ATG	2	6	3728796	3728801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_021820	ACA	2	6	3728835	3728840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10262	NC_021820	TCG	2	6	3794134	3794139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10263	NC_021820	TTA	2	6	3794153	3794158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10374	NC_021820	T	6	6	3831326	3831331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10375	NC_021820	TCACC	2	10	3831350	3831359	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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10392	NC_021820	TGA	2	6	3843606	3843611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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