MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021820	ATCC	2	8	172970	172977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021820	GATG	2	8	172979	172986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021820	ATT	2	6	173714	173719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021820	GTT	2	6	173754	173759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021820	TCAT	2	8	173768	173775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_021820	ATA	2	6	173816	173821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021820	CCG	2	6	179468	179473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_021820	TCC	2	6	181414	181419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_021820	GTG	2	6	181550	181555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021820	CAG	2	6	181651	181656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021820	ACG	2	6	181676	181681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021820	TGC	2	6	183155	183160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_021820	GCA	2	6	183164	183169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021820	ATAG	2	8	183191	183198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021820	GCA	3	9	183231	183239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021820	T	6	6	183303	183308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021820	CCA	2	6	183311	183316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_021820	CTG	2	6	183391	183396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021820	TAA	2	6	185889	185894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021820	GCT	2	6	185908	185913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021820	G	6	6	185965	185970	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021820	TAT	2	6	185989	185994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021820	GCC	2	6	186047	186052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_021820	TG	3	6	186057	186062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021820	TGG	2	6	186069	186074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021820	AGCGC	2	10	186153	186162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
527	NC_021820	GGC	2	6	187611	187616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021820	CGC	2	6	187642	187647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_021820	AGCA	2	8	188314	188321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_021820	A	6	6	188325	188330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021820	GCC	2	6	188347	188352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_021820	T	6	6	188353	188358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021820	T	7	7	188622	188628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021820	TTAC	2	8	188747	188754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_021820	TGAC	2	8	188817	188824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_021820	GAC	2	6	188828	188833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021820	A	6	6	189548	189553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021820	ACTG	2	8	189568	189575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_021820	GGC	2	6	189577	189582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021820	T	6	6	189673	189678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021820	T	8	8	189706	189713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021820	A	6	6	189779	189784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021820	AGG	2	6	192639	192644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021820	CGC	2	6	192660	192665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_021820	TCGC	2	8	192697	192704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_021820	TG	3	6	192726	192731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021820	TAA	2	6	192779	192784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021820	ATT	2	6	192791	192796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021820	GTT	2	6	192805	192810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021820	GTT	2	6	192863	192868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021820	CAT	2	6	192895	192900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021820	AAT	2	6	192968	192973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021820	CT	3	6	194530	194535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_021820	CAT	2	6	195529	195534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021820	TAC	2	6	195543	195548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021820	GCC	2	6	197054	197059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_021820	GCGCT	2	10	197085	197094	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
558	NC_021820	A	6	6	197130	197135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021820	CGTC	2	8	197139	197146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021820	CTT	2	6	197155	197160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021820	ACTAA	2	10	197162	197171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_021820	GGCG	2	8	197187	197194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
563	NC_021820	TGC	2	6	197220	197225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021820	ACC	2	6	197396	197401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_021820	GCC	2	6	197410	197415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_021820	TC	3	6	197480	197485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_021820	AC	3	6	197567	197572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_021820	CGT	3	9	197585	197593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021820	AGC	2	6	197766	197771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021820	C	6	6	197771	197776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
571	NC_021820	ACG	2	6	197820	197825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021820	TGA	2	6	197900	197905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021820	CCG	2	6	197928	197933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_021820	ACC	2	6	198015	198020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_021820	CCT	2	6	198097	198102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_021820	CTC	2	6	198134	198139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_021820	AGG	2	6	198151	198156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021820	CCA	2	6	198178	198183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_021820	GGT	2	6	198238	198243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021820	CAT	2	6	198433	198438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021820	GCC	2	6	198508	198513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_021820	TAA	2	6	198633	198638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021820	CAGC	2	8	198646	198653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
584	NC_021820	GACT	2	8	198664	198671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_021820	TC	3	6	198762	198767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_021820	ACC	2	6	198792	198797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_021820	TTG	2	6	198864	198869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021820	TCG	2	6	198888	198893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_021820	AC	4	8	198932	198939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_021820	C	6	6	198992	198997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
591	NC_021820	AC	3	6	199197	199202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_021820	AACG	2	8	199234	199241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_021820	TCGCT	2	10	199281	199290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
594	NC_021820	CTTT	2	8	199411	199418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_021820	ATG	2	6	199421	199426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021820	GCT	2	6	199427	199432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021820	GTT	2	6	199517	199522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021820	ACG	2	6	199532	199537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021820	GT	3	6	199554	199559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021820	TCGGT	2	10	199763	199772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
601	NC_021820	GTAC	2	8	199975	199982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_021820	GTCA	2	8	200058	200065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_021820	GGA	2	6	200081	200086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021820	C	6	6	200091	200096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
605	NC_021820	CG	3	6	200183	200188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_021820	AC	3	6	200210	200215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_021820	CTC	2	6	200236	200241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_021820	TCGC	2	8	200247	200254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
609	NC_021820	GA	3	6	200550	200555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021820	AAC	2	6	200562	200567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021820	GTT	2	6	200572	200577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021820	T	6	6	200659	200664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021820	TGG	2	6	200682	200687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021820	CCT	2	6	200712	200717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_021820	ACC	2	6	200891	200896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_021820	ACC	2	6	200926	200931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_021820	TCA	2	6	200969	200974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021820	TG	3	6	200982	200987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021820	TAAGG	2	10	201010	201019	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021820	CTAC	2	8	201115	201122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_021820	GT	3	6	201158	201163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021820	ACG	2	6	201259	201264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021820	GT	3	6	201327	201332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021820	ATG	2	6	201352	201357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021820	TCC	2	6	201378	201383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_021820	CAA	2	6	201430	201435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021820	GAC	2	6	201491	201496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021820	GCA	2	6	201503	201508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021820	TTC	2	6	201579	201584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021820	GCC	2	6	201822	201827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_021820	TCC	2	6	201842	201847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021820	C	6	6	201886	201891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
633	NC_021820	TGCG	2	8	201974	201981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_021820	GCT	2	6	202032	202037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021820	CTT	2	6	202057	202062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021820	TGC	2	6	202080	202085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021820	TTA	2	6	202088	202093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021820	TCC	2	6	202106	202111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_021820	CTT	2	6	202141	202146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021820	CTG	2	6	202200	202205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_021820	TCG	2	6	202275	202280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_021820	CAA	2	6	202303	202308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_021820	AGT	2	6	202400	202405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_021820	AGC	2	6	202466	202471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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646	NC_021820	GCC	2	6	202514	202519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_021820	CA	3	6	202668	202673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
648	NC_021820	CGCTT	2	10	202705	202714	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
649	NC_021820	GCG	2	6	202722	202727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_021820	CGG	2	6	202817	202822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_021820	TG	3	6	202825	202830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
652	NC_021820	GTT	2	6	202833	202838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_021820	GTG	2	6	202847	202852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
654	NC_021820	AAT	2	6	202897	202902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_021820	T	7	7	206941	206947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
656	NC_021820	ATTT	2	8	207032	207039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_021820	T	7	7	207043	207049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
658	NC_021820	AC	3	6	207060	207065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
659	NC_021820	ATA	2	6	210485	210490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_021820	CAA	2	6	210582	210587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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663	NC_021820	T	6	6	210653	210658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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666	NC_021820	AAAT	2	8	212556	212563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
667	NC_021820	AT	3	6	212569	212574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_021820	ATA	2	6	212606	212611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NC_021820	TTA	2	6	212621	212626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_021820	TAGG	2	8	212705	212712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
672	NC_021820	CGC	2	6	213505	213510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
673	NC_021820	CAT	2	6	215037	215042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_021820	GGCG	2	8	216508	216515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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678	NC_021820	ATT	2	6	218138	218143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_021820	AAG	2	6	221355	221360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
684	NC_021820	ACT	2	6	221405	221410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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686	NC_021820	AG	3	6	222979	222984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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768	NC_021820	ATA	2	6	249029	249034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
769	NC_021820	TAC	2	6	249154	249159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_021820	A	6	6	249174	249179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_021820	TAT	2	6	249180	249185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021820	TTC	2	6	249212	249217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_021820	CCT	3	9	249601	249609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
774	NC_021820	GCCG	2	8	249671	249678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
775	NC_021820	GCA	2	6	249695	249700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_021820	CGA	2	6	252373	252378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_021820	A	6	6	252378	252383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_021820	TACA	2	8	252441	252448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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912	NC_021820	TTTC	2	8	296602	296609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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