MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021820	TA	3	6	3274975	3274980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_021820	CGAT	2	8	3275126	3275133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9003	NC_021820	TTC	2	6	3275175	3275180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_021820	TATT	2	8	3275190	3275197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_021820	TTA	2	6	3275819	3275824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_021820	AGC	2	6	3275842	3275847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_021820	GGT	2	6	3275885	3275890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_021820	TAT	2	6	3275908	3275913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_021820	CAT	2	6	3275919	3275924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_021820	TGTCT	2	10	3275951	3275960	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9011	NC_021820	AC	3	6	3276677	3276682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9012	NC_021820	TAA	2	6	3276692	3276697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_021820	CA	3	6	3276727	3276732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9014	NC_021820	GGC	2	6	3277196	3277201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_021820	GGA	2	6	3277229	3277234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_021820	TAA	2	6	3277334	3277339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_021820	ATA	2	6	3277367	3277372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_021820	CCT	2	6	3278222	3278227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_021820	CGG	2	6	3278288	3278293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_021820	ATC	2	6	3279701	3279706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_021820	TGA	2	6	3280411	3280416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_021820	T	7	7	3280459	3280465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_021820	GCAG	2	8	3280466	3280473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_021820	GAG	2	6	3280512	3280517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_021820	AGG	2	6	3280541	3280546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_021820	CA	3	6	3280584	3280589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9027	NC_021820	GA	3	6	3280595	3280600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_021820	TAT	2	6	3280615	3280620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_021820	CCAG	2	8	3280967	3280974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_021820	CAA	2	6	3280982	3280987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_021820	TG	3	6	3281003	3281008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_021820	T	6	6	3281080	3281085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_021820	CT	3	6	3281107	3281112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9034	NC_021820	ATA	2	6	3282632	3282637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_021820	TTA	2	6	3282695	3282700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_021820	ATG	2	6	3282729	3282734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_021820	ATG	2	6	3282751	3282756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_021820	TTAA	2	8	3282779	3282786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_021820	TA	3	6	3282813	3282818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_021820	CT	3	6	3283120	3283125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_021820	TAA	2	6	3283127	3283132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_021820	T	6	6	3283156	3283161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_021820	TGT	2	6	3283248	3283253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_021820	T	6	6	3283279	3283284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_021820	A	7	7	3283341	3283347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_021820	GGT	2	6	3283357	3283362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_021820	ATT	2	6	3283387	3283392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_021820	CCA	2	6	3283480	3283485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_021820	T	7	7	3283581	3283587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_021820	CAGC	2	8	3283595	3283602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9051	NC_021820	TGC	2	6	3283758	3283763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_021820	TCAC	2	8	3283819	3283826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_021820	GCG	2	6	3283845	3283850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_021820	TGT	2	6	3284423	3284428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_021820	ATT	2	6	3287345	3287350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_021820	ATGA	2	8	3287351	3287358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_021820	TA	4	8	3287384	3287391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_021820	TAA	2	6	3287462	3287467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_021820	ATT	2	6	3287488	3287493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_021820	GT	3	6	3289990	3289995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_021820	TAT	2	6	3290002	3290007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_021820	A	6	6	3290029	3290034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_021820	CTGC	2	8	3290098	3290105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_021820	AAG	2	6	3292481	3292486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_021820	AATA	2	8	3292558	3292565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_021820	TCC	2	6	3292566	3292571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_021820	CT	3	6	3292608	3292613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_021820	TTG	2	6	3293146	3293151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_021820	TAA	2	6	3293204	3293209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_021820	A	6	6	3294530	3294535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_021820	AATC	2	8	3294576	3294583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9072	NC_021820	GGC	2	6	3296207	3296212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9075	NC_021820	ACT	2	6	3296303	3296308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_021820	GAA	2	6	3296325	3296330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9080	NC_021820	AAG	2	6	3300570	3300575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_021820	CGC	2	6	3300598	3300603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9082	NC_021820	TTA	2	6	3300652	3300657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_021820	GTA	2	6	3300683	3300688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_021820	CTT	2	6	3300695	3300700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9085	NC_021820	CGG	2	6	3302193	3302198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_021820	GTC	2	6	3302257	3302262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_021820	TAT	2	6	3302284	3302289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_021820	ATT	3	9	3302362	3302370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_021820	CAT	2	6	3302422	3302427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_021820	GC	3	6	3302821	3302826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9091	NC_021820	GCGTC	2	10	3302869	3302878	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9092	NC_021820	CGC	2	6	3302882	3302887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9093	NC_021820	TGT	2	6	3302924	3302929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9096	NC_021820	GCA	2	6	3303280	3303285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_021820	A	6	6	3303330	3303335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_021820	AAT	2	6	3303373	3303378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_021820	GAGT	2	8	3303412	3303419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_021820	A	6	6	3303435	3303440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_021820	AGG	2	6	3308218	3308223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_021820	CGA	2	6	3308225	3308230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_021820	GGACA	2	10	3309937	3309946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9104	NC_021820	A	6	6	3314120	3314125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_021820	AT	3	6	3314137	3314142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_021820	TCAC	2	8	3314168	3314175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9107	NC_021820	ACTTT	2	10	3314190	3314199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9108	NC_021820	GAT	2	6	3314202	3314207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_021820	TGAG	2	8	3314343	3314350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_021820	TCC	2	6	3315221	3315226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9111	NC_021820	GGT	2	6	3315334	3315339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_021820	A	7	7	3315581	3315587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_021820	AAG	2	6	3315625	3315630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_021820	T	7	7	3315686	3315692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_021820	T	6	6	3315709	3315714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_021820	ATGA	2	8	3315717	3315724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_021820	TGC	2	6	3315769	3315774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_021820	CTT	2	6	3315811	3315816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_021820	CCG	2	6	3315852	3315857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9120	NC_021820	TCA	2	6	3318445	3318450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9122	NC_021820	CGA	2	6	3318500	3318505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_021820	CCT	2	6	3318743	3318748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9124	NC_021820	TCT	2	6	3319745	3319750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_021820	CGG	2	6	3319790	3319795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_021820	ATA	2	6	3319847	3319852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_021820	GTGA	2	8	3319891	3319898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_021820	AAT	2	6	3322709	3322714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_021820	CT	3	6	3323466	3323471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9130	NC_021820	TTA	2	6	3323488	3323493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9132	NC_021820	ATTA	2	8	3323887	3323894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9133	NC_021820	ATTC	2	8	3323956	3323963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9134	NC_021820	CTG	2	6	3324008	3324013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9250	NC_021820	CG	3	6	3351787	3351792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9251	NC_021820	G	6	6	3352992	3352997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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9260	NC_021820	TTTC	2	8	3353176	3353183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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