MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021820	TGG	2	6	2609920	2609925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_021820	ATC	2	6	2609958	2609963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_021820	ATC	2	6	2609969	2609974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_021820	AAT	2	6	2609979	2609984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_021820	A	6	6	2610985	2610990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021820	TAA	2	6	2611044	2611049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_021820	TTG	2	6	2611050	2611055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_021820	GCTG	2	8	2611060	2611067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_021820	TTC	2	6	2611104	2611109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_021820	ATG	2	6	2612348	2612353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_021820	GCC	2	6	2613298	2613303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_021820	GGC	2	6	2613325	2613330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_021820	AC	3	6	2614502	2614507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_021820	A	8	8	2614543	2614550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021820	CCA	2	6	2615595	2615600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_021820	AATC	2	8	2615687	2615694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7017	NC_021820	GCC	2	6	2615761	2615766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_021820	ATA	2	6	2615790	2615795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_021820	GCC	2	6	2615821	2615826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_021820	ATT	2	6	2616361	2616366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_021820	GCC	2	6	2616685	2616690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_021820	CGG	2	6	2616694	2616699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_021820	ATT	2	6	2616819	2616824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021820	GCCA	2	8	2616855	2616862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_021820	TGACG	2	10	2616934	2616943	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7026	NC_021820	GATAC	2	10	2616998	2617007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7027	NC_021820	TCT	2	6	2617675	2617680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_021820	GTC	2	6	2617685	2617690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_021820	GGC	2	6	2618763	2618768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_021820	CGC	2	6	2618779	2618784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_021820	TGA	2	6	2618801	2618806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021820	AAC	2	6	2620687	2620692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_021820	CAG	2	6	2620758	2620763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_021820	CTGC	2	8	2620770	2620777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_021820	AATA	2	8	2620813	2620820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_021820	GAC	2	6	2624527	2624532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_021820	TA	3	6	2625897	2625902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_021820	A	7	7	2625985	2625991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_021820	GCT	2	6	2625996	2626001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_021820	CGG	2	6	2626068	2626073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_021820	AAT	2	6	2627865	2627870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_021820	GCTG	2	8	2628000	2628007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7043	NC_021820	TGC	2	6	2628015	2628020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_021820	ATTA	2	8	2628049	2628056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_021820	ATAA	2	8	2628061	2628068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021820	GAT	2	6	2634158	2634163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_021820	ATT	2	6	2634191	2634196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_021820	TAA	2	6	2634215	2634220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_021820	TGC	2	6	2634225	2634230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_021820	TGT	2	6	2634265	2634270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_021820	T	7	7	2634303	2634309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_021820	T	6	6	2634332	2634337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_021820	GTT	2	6	2634357	2634362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021820	ACA	2	6	2634401	2634406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_021820	AGGA	2	8	2634443	2634450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_021820	CCG	2	6	2634963	2634968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_021820	ACA	2	6	2634978	2634983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_021820	CGG	2	6	2635006	2635011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_021820	A	6	6	2635952	2635957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_021820	AG	3	6	2635968	2635973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021820	A	7	7	2636866	2636872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_021820	CGC	2	6	2636903	2636908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_021820	ACA	2	6	2636913	2636918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_021820	ACA	2	6	2636947	2636952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_021820	T	7	7	2637455	2637461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_021820	TGCC	2	8	2637463	2637470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7067	NC_021820	TTAT	2	8	2637477	2637484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_021820	ATT	2	6	2637493	2637498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021820	G	6	6	2637513	2637518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021820	GA	3	6	2637537	2637542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021820	GGT	2	6	2637572	2637577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021820	A	6	6	2637607	2637612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_021820	GCG	2	6	2637663	2637668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_021820	T	6	6	2638032	2638037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021820	ATGCC	2	10	2639488	2639497	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7076	NC_021820	ATTA	2	8	2640737	2640744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_021820	GCG	2	6	2642983	2642988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_021820	T	6	6	2643004	2643009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_021820	TTA	2	6	2643069	2643074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_021820	CAA	2	6	2643127	2643132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_021820	AG	3	6	2643665	2643670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_021820	GGA	2	6	2643707	2643712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_021820	TATT	2	8	2643713	2643720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_021820	TCA	2	6	2645999	2646004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_021820	GTA	2	6	2646019	2646024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_021820	CG	3	6	2646111	2646116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_021820	GC	3	6	2646225	2646230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_021820	GTA	2	6	2646249	2646254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_021820	A	6	6	2646589	2646594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_021820	GACA	2	8	2646629	2646636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7091	NC_021820	T	7	7	2648095	2648101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_021820	AATGG	2	10	2648175	2648184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_021820	GTG	2	6	2648864	2648869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_021820	A	6	6	2649645	2649650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021820	ACG	2	6	2649744	2649749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_021820	TC	3	6	2651215	2651220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7097	NC_021820	CGC	2	6	2651297	2651302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7098	NC_021820	GCG	2	6	2651643	2651648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_021820	GCC	2	6	2651654	2651659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7100	NC_021820	CCT	2	6	2652642	2652647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7101	NC_021820	TTTA	2	8	2652718	2652725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_021820	AAG	2	6	2652726	2652731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021820	TA	3	6	2652745	2652750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_021820	AATG	2	8	2652755	2652762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_021820	A	6	6	2652783	2652788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_021820	ATTG	2	8	2652799	2652806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_021820	CTT	2	6	2652822	2652827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_021820	CGT	2	6	2652886	2652891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_021820	T	6	6	2652898	2652903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_021820	TA	3	6	2652918	2652923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_021820	GTTAC	2	10	2653695	2653704	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7112	NC_021820	GTG	2	6	2653721	2653726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_021820	TAA	2	6	2654737	2654742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021820	CAG	2	6	2654746	2654751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_021820	ATG	2	6	2654753	2654758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_021820	CAG	2	6	2654800	2654805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_021820	T	7	7	2656081	2656087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_021820	CAT	3	9	2656096	2656104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_021820	TAA	2	6	2656228	2656233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_021820	TTCA	2	8	2656243	2656250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7121	NC_021820	TCGT	2	8	2656260	2656267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7122	NC_021820	AT	4	8	2656312	2656319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_021820	GTAC	2	8	2656362	2656369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_021820	TCAT	2	8	2656395	2656402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7125	NC_021820	GAT	2	6	2656456	2656461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_021820	TAA	3	9	2656506	2656514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_021820	CGG	2	6	2656516	2656521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_021820	ATC	3	9	2656554	2656562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_021820	AT	3	6	2656586	2656591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_021820	ATG	2	6	2656613	2656618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_021820	CAA	2	6	2656631	2656636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7132	NC_021820	CGG	2	6	2656678	2656683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7133	NC_021820	GCC	2	6	2656688	2656693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7134	NC_021820	A	6	6	2657938	2657943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7135	NC_021820	TCT	2	6	2657996	2658001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7139	NC_021820	TCA	2	6	2658227	2658232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7249	NC_021820	TTTTC	2	10	2697131	2697140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7251	NC_021820	A	6	6	2698626	2698631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7257	NC_021820	TTG	2	6	2698834	2698839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7259	NC_021820	AAGCG	2	10	2704546	2704555	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7260	NC_021820	GTC	2	6	2704562	2704567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7432	NC_021820	ACA	2	6	2782533	2782538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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