MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021820	GAT	2	6	1890847	1890852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021820	AG	3	6	1891999	1892004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021820	GC	3	6	1892146	1892151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_021820	TCA	2	6	1892176	1892181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021820	TCG	2	6	1892207	1892212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_021820	GGC	2	6	1892225	1892230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_021820	CTT	2	6	1892266	1892271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021820	T	6	6	1892319	1892324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021820	TTA	2	6	1892344	1892349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021820	ATTA	2	8	1892377	1892384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021820	TAAT	2	8	1892418	1892425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021820	ATCT	2	8	1892433	1892440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_021820	ATA	2	6	1892481	1892486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021820	GT	4	8	1892520	1892527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021820	AGGGA	2	10	1893119	1893128	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021820	AG	3	6	1894449	1894454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021820	TAA	2	6	1899356	1899361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021820	AC	3	6	1899400	1899405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_021820	CA	3	6	1899406	1899411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_021820	AAT	2	6	1899419	1899424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021820	TAA	2	6	1899468	1899473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021820	CAA	2	6	1899498	1899503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021820	A	6	6	1899502	1899507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021820	GTG	2	6	1899631	1899636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021820	AGT	2	6	1899664	1899669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021820	TGT	2	6	1899676	1899681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021820	ATA	2	6	1899696	1899701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021820	TAA	2	6	1899732	1899737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021820	GAG	2	6	1899772	1899777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021820	A	7	7	1899797	1899803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021820	A	6	6	1899890	1899895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021820	CTC	2	6	1900977	1900982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_021820	ATG	2	6	1900992	1900997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021820	AT	3	6	1901003	1901008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021820	CAT	2	6	1901042	1901047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_021820	A	7	7	1901060	1901066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021820	ATT	2	6	1901089	1901094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021820	A	7	7	1901732	1901738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021820	TGAT	2	8	1901782	1901789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021820	GGC	2	6	1901802	1901807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021820	CTTCA	2	10	1901973	1901982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5042	NC_021820	GC	3	6	1902056	1902061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_021820	CTT	2	6	1902085	1902090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021820	TCC	2	6	1902095	1902100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_021820	CAT	2	6	1902129	1902134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021820	GTC	2	6	1902145	1902150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_021820	CAC	2	6	1902208	1902213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_021820	TGA	2	6	1902240	1902245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021820	GCTC	2	8	1902277	1902284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_021820	TC	3	6	1902351	1902356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_021820	ACG	2	6	1902440	1902445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021820	TCAT	2	8	1902554	1902561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5053	NC_021820	T	8	8	1902593	1902600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021820	CGG	2	6	1902645	1902650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021820	ATC	2	6	1902662	1902667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021820	TGG	2	6	1902690	1902695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021820	CTT	2	6	1902712	1902717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_021820	GTA	2	6	1902740	1902745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021820	GCG	2	6	1902761	1902766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021820	CT	3	6	1902853	1902858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_021820	TGG	2	6	1903001	1903006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021820	CGC	2	6	1903184	1903189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_021820	TGG	2	6	1903201	1903206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021820	ATTA	2	8	1903215	1903222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021820	AAT	2	6	1906223	1906228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021820	TTA	2	6	1906261	1906266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021820	GTT	2	6	1906274	1906279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021820	AGT	2	6	1906308	1906313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021820	AC	3	6	1906330	1906335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_021820	GTA	2	6	1906397	1906402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021820	TTG	2	6	1906413	1906418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021820	GC	3	6	1906478	1906483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_021820	GCG	3	9	1906523	1906531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_021820	CTC	2	6	1906601	1906606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_021820	ATT	2	6	1906637	1906642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021820	A	7	7	1906850	1906856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021820	TAA	2	6	1906908	1906913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021820	ATA	2	6	1906919	1906924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021820	GTT	2	6	1906930	1906935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021820	ATT	2	6	1906974	1906979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021820	CAG	2	6	1907368	1907373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_021820	GCG	2	6	1907653	1907658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_021820	ATTT	2	8	1908558	1908565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021820	ACC	2	6	1908644	1908649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_021820	A	6	6	1908667	1908672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021820	T	6	6	1908697	1908702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021820	TTAT	2	8	1908707	1908714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021820	ATAA	2	8	1910086	1910093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021820	T	8	8	1910115	1910122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021820	GAAA	2	8	1910169	1910176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021820	TAT	2	6	1910198	1910203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021820	TCG	2	6	1911078	1911083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021820	TGA	2	6	1911113	1911118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021820	ATG	2	6	1911119	1911124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021820	A	6	6	1912375	1912380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021820	GC	3	6	1912474	1912479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_021820	CTTTT	2	10	1912483	1912492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5098	NC_021820	T	7	7	1912509	1912515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021820	TAACGT	2	12	1912522	1912533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5100	NC_021820	T	6	6	1914024	1914029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021820	TC	3	6	1915314	1915319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_021820	CAG	2	6	1915329	1915334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_021820	ATG	2	6	1915338	1915343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021820	CTG	2	6	1915345	1915350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_021820	CGT	2	6	1915463	1915468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_021820	CAA	2	6	1915511	1915516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_021820	TGAA	2	8	1915517	1915524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021820	CGT	2	6	1915585	1915590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_021820	CAA	2	6	1915597	1915602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_021820	AGGG	2	8	1917602	1917609	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021820	CGTT	2	8	1917617	1917624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_021820	AGTA	2	8	1917668	1917675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021820	CGT	2	6	1917704	1917709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_021820	AGA	2	6	1920528	1920533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021820	GCC	2	6	1920596	1920601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_021820	TCC	2	6	1921628	1921633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_021820	ATA	2	6	1921646	1921651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021820	TAA	2	6	1921660	1921665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021820	TTAT	2	8	1925323	1925330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021820	A	6	6	1925421	1925426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021820	TGGT	2	8	1926120	1926127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021820	CAG	2	6	1926145	1926150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_021820	GGA	2	6	1926179	1926184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021820	GTCGC	2	10	1927205	1927214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5125	NC_021820	ACTC	2	8	1927281	1927288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_021820	TG	3	6	1927360	1927365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021820	TTA	2	6	1927367	1927372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021820	TGCGG	2	10	1927400	1927409	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5129	NC_021820	TCCC	2	8	1929955	1929962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5130	NC_021820	GAGG	2	8	1929968	1929975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021820	GTG	2	6	1932303	1932308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021820	CG	3	6	1932319	1932324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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