MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 13337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021820	AATGT	2	10	1666632	1666641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021820	GCA	2	6	1666674	1666679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_021820	ATT	2	6	1666734	1666739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021820	TCT	2	6	1666803	1666808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_021820	TTTC	2	8	1666812	1666819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_021820	TGAAA	2	10	1666916	1666925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021820	TA	3	6	1666944	1666949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021820	GGA	2	6	1672632	1672637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021820	ATT	2	6	1672654	1672659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021820	CAA	2	6	1672769	1672774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_021820	GGA	2	6	1673436	1673441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021820	CCT	2	6	1673490	1673495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_021820	AAAC	2	8	1673517	1673524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_021820	TTGA	2	8	1673607	1673614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021820	TC	3	6	1673633	1673638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_021820	ATAG	2	8	1673648	1673655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021820	ATA	2	6	1673724	1673729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021820	T	6	6	1673792	1673797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021820	ATT	2	6	1673907	1673912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021820	T	6	6	1673969	1673974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021820	ATA	2	6	1673982	1673987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_021820	GTC	2	6	1673989	1673994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_021820	AAT	2	6	1675238	1675243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021820	TCA	2	6	1675281	1675286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_021820	TC	3	6	1675443	1675448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_021820	AAGG	2	8	1675508	1675515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021820	A	7	7	1677128	1677134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021820	AT	3	6	1677147	1677152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021820	GAA	2	6	1677175	1677180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021820	TGT	2	6	1678421	1678426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_021820	T	6	6	1678525	1678530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_021820	GATGC	2	10	1678586	1678595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4533	NC_021820	TAA	2	6	1678631	1678636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021820	A	6	6	1678635	1678640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021820	AT	3	6	1678680	1678685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021820	TAA	2	6	1678720	1678725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021820	TG	3	6	1678758	1678763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021820	TA	3	6	1678789	1678794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021820	ATA	2	6	1679382	1679387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021820	GCT	2	6	1679392	1679397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_021820	TGA	2	6	1679473	1679478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021820	TTA	2	6	1680383	1680388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021820	AT	3	6	1680793	1680798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021820	GC	5	10	1680808	1680817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_021820	CAT	2	6	1686862	1686867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_021820	GTC	2	6	1686981	1686986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_021820	CA	3	6	1689810	1689815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_021820	CGCTT	2	10	1690074	1690083	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4549	NC_021820	TAA	2	6	1690144	1690149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021820	TA	3	6	1690190	1690195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021820	GAC	2	6	1690245	1690250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_021820	T	6	6	1690293	1690298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_021820	TCC	2	6	1691611	1691616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_021820	CGT	2	6	1691617	1691622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_021820	AAC	2	6	1691641	1691646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_021820	ATG	2	6	1691655	1691660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_021820	ATC	2	6	1691686	1691691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_021820	T	6	6	1691698	1691703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021820	ATTG	2	8	1691715	1691722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_021820	TGAA	2	8	1696705	1696712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021820	GCC	2	6	1696750	1696755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_021820	AGCG	2	8	1696760	1696767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_021820	CCCGT	2	10	1696795	1696804	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4564	NC_021820	T	7	7	1696900	1696906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021820	TAC	2	6	1696987	1696992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_021820	GAC	2	6	1697011	1697016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_021820	CAGC	2	8	1697052	1697059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4568	NC_021820	A	8	8	1697063	1697070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_021820	CGTTT	2	10	1697122	1697131	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4570	NC_021820	TA	4	8	1697172	1697179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021820	GGGA	2	8	1697183	1697190	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_021820	TCG	2	6	1699756	1699761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_021820	TC	3	6	1699822	1699827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_021820	ATT	2	6	1699847	1699852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021820	CCG	2	6	1700969	1700974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_021820	T	6	6	1701004	1701009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_021820	TAA	2	6	1701066	1701071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_021820	TTA	2	6	1703911	1703916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021820	GAT	2	6	1703929	1703934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_021820	GTT	2	6	1703973	1703978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_021820	ACT	2	6	1704023	1704028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_021820	GAT	2	6	1704069	1704074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021820	TAA	3	9	1704079	1704087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021820	CAT	2	6	1704387	1704392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_021820	CGG	2	6	1704414	1704419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_021820	TATT	2	8	1704423	1704430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_021820	T	6	6	1706167	1706172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_021820	T	9	9	1706243	1706251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021820	CTTTG	2	10	1706350	1706359	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4590	NC_021820	GCC	2	6	1707314	1707319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_021820	TACGG	2	10	1707357	1707366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4592	NC_021820	AAT	2	6	1707396	1707401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021820	TTA	2	6	1708591	1708596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_021820	GC	3	6	1712084	1712089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_021820	GCAG	2	8	1713127	1713134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_021820	CGG	4	12	1713176	1713187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_021820	CTT	2	6	1713197	1713202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_021820	TA	3	6	1713204	1713209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021820	GTT	2	6	1713263	1713268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021820	ATT	2	6	1713313	1713318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021820	T	7	7	1713369	1713375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_021820	TTA	2	6	1713428	1713433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021820	AAT	2	6	1713475	1713480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021820	CGC	2	6	1713499	1713504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_021820	CTT	2	6	1713511	1713516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_021820	GAG	2	6	1713577	1713582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021820	TC	3	6	1716535	1716540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_021820	ATT	2	6	1716595	1716600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_021820	CGA	2	6	1717275	1717280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_021820	GGT	2	6	1718465	1718470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_021820	TAC	2	6	1718483	1718488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_021820	CGG	2	6	1718490	1718495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_021820	A	6	6	1718518	1718523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_021820	A	6	6	1718531	1718536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021820	CGG	2	6	1718542	1718547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_021820	CTG	2	6	1718616	1718621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_021820	TCG	2	6	1718632	1718637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_021820	GCC	2	6	1718735	1718740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_021820	CAG	2	6	1718745	1718750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_021820	TAA	2	6	1718754	1718759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021820	AAG	2	6	1718764	1718769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021820	GC	3	6	1721141	1721146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_021820	GAT	2	6	1721474	1721479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021820	CTCG	2	8	1721669	1721676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_021820	TA	3	6	1723881	1723886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021820	ATG	2	6	1723907	1723912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_021820	ACC	2	6	1723958	1723963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_021820	GCTAA	2	10	1723980	1723989	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4629	NC_021820	AT	3	6	1725287	1725292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_021820	ATT	2	6	1725350	1725355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_021820	TAT	2	6	1725370	1725375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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