MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021818	TTCC	2	8	4	11	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021818	TG	3	6	851	856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021818	A	6	6	891	896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021818	CCG	2	6	899	904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021818	ATTT	2	8	1105	1112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021818	GTA	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021818	CCT	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021818	T	6	6	2256	2261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021818	GA	3	6	2292	2297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021818	ACG	2	6	2356	2361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021818	GCC	2	6	2384	2389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021818	ATA	2	6	4099	4104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021818	TCA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021818	A	8	8	5545	5552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021818	TC	3	6	6393	6398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021818	TC	3	6	8241	8246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021818	CGG	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021818	TAA	2	6	9307	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021818	ATT	2	6	9316	9321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021818	TTA	2	6	9351	9356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021818	CCT	2	6	11745	11750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021818	CAT	2	6	11809	11814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021818	T	6	6	11832	11837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021818	TGC	2	6	11845	11850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021818	ACG	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021818	AAT	2	6	11889	11894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021818	TAA	2	6	11944	11949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021818	TTC	2	6	12648	12653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021818	CGG	2	6	17867	17872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021818	GCC	2	6	17880	17885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021818	T	6	6	19157	19162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021818	TA	3	6	19214	19219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021818	T	6	6	19236	19241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021818	TCGC	2	8	19257	19264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021818	CCA	2	6	19309	19314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021818	GCG	3	9	20728	20736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021818	CGC	2	6	20745	20750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021818	TGA	2	6	26505	26510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021818	A	6	6	26576	26581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021818	GC	4	8	26623	26630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021818	TCG	2	6	26659	26664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021818	GGC	2	6	26675	26680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021818	GCC	2	6	26702	26707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021818	ACC	2	6	26839	26844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021818	CAG	2	6	26878	26883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021818	CCAG	2	8	26925	26932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021818	ATG	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021818	CGT	2	6	26974	26979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021818	GGC	2	6	26986	26991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021818	CTC	2	6	27126	27131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021818	AGC	2	6	27230	27235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021818	TC	3	6	27342	27347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021818	ATT	2	6	27379	27384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021818	CAG	2	6	27391	27396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021818	TCA	2	6	27682	27687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021818	C	6	6	27803	27808	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_021818	GCATTA	2	12	27836	27847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021818	TA	3	6	27896	27901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021818	TGA	2	6	27908	27913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021818	A	6	6	27961	27966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021818	TAA	3	9	27982	27990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021818	TCA	2	6	28028	28033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021818	GCA	2	6	28056	28061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021818	TTAT	2	8	28083	28090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021818	T	6	6	28127	28132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021818	ATG	2	6	28186	28191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021818	T	6	6	28218	28223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021818	TAT	2	6	28301	28306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021818	ATTT	2	8	28319	28326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021818	TAT	2	6	29003	29008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021818	ATT	2	6	29015	29020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021818	AGG	2	6	29052	29057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021818	AAC	2	6	31922	31927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021818	AGA	2	6	33371	33376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021818	AT	3	6	33556	33561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021818	A	6	6	33572	33577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021818	AGC	2	6	33654	33659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021818	TA	3	6	33666	33671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021818	TTA	2	6	33687	33692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021818	TAA	2	6	33713	33718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021818	TAAATA	2	12	33763	33774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021818	AAT	2	6	33812	33817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021818	CTAT	2	8	33825	33832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021818	GTTT	2	8	33856	33863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021818	T	6	6	33861	33866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021818	CAAT	2	8	33867	33874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021818	CT	3	6	33879	33884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021818	ATA	2	6	33911	33916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021818	TTG	2	6	33923	33928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021818	AGAA	2	8	33988	33995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021818	TCA	2	6	34033	34038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021818	CAA	3	9	34105	34113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021818	GAAT	2	8	34115	34122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021818	CGC	2	6	34905	34910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021818	GCG	2	6	34913	34918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021818	TAC	2	6	34954	34959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021818	GC	3	6	34978	34983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021818	TGG	2	6	35018	35023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021818	AAC	2	6	35567	35572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021818	CAG	2	6	35607	35612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021818	GAT	2	6	35644	35649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021818	A	6	6	35670	35675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021818	T	8	8	35689	35696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021818	A	6	6	38658	38663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021818	TTTTA	2	10	38694	38703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021818	CAT	2	6	38720	38725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021818	CCT	2	6	38728	38733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021818	GAA	2	6	39476	39481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021818	CGT	2	6	39534	39539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021818	CGG	2	6	39545	39550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021818	ACATGA	2	12	39571	39582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021818	ATT	2	6	39615	39620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021818	TGC	2	6	39648	39653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021818	AGC	2	6	39668	39673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021818	GCGT	2	8	39683	39690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021818	TTA	2	6	39755	39760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021818	AGTC	2	8	39762	39769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021818	GTTT	2	8	39818	39825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021818	A	7	7	39841	39847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021818	ACAG	2	8	41899	41906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021818	GAG	2	6	41930	41935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021818	TTG	2	6	45571	45576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021818	ACTT	2	8	45599	45606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021818	GCC	2	6	45635	45640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021818	TTA	2	6	45667	45672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021818	CCT	2	6	46605	46610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021818	AT	3	6	46636	46641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021818	CGC	2	6	46706	46711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_021818	CAT	2	6	46726	46731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021818	AGA	2	6	46733	46738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021818	GAA	3	9	46772	46780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021818	AGT	2	6	49642	49647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021818	TAT	2	6	51600	51605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021818	CGT	2	6	51623	51628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021818	GCA	2	6	51645	51650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021818	CGT	2	6	52860	52865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021818	TTG	2	6	52935	52940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021818	TCT	2	6	52979	52984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021818	GC	3	6	53813	53818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021818	AGG	2	6	53887	53892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021818	AT	3	6	53944	53949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021818	ATG	2	6	53959	53964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021818	CGT	2	6	53989	53994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021818	GGC	2	6	54046	54051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021818	TCAT	2	8	54122	54129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021818	TTCA	2	8	54711	54718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021818	A	6	6	54759	54764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021818	CA	3	6	54800	54805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021818	GGCA	2	8	56234	56241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021818	AGGTG	2	10	56329	56338	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021818	A	8	8	59791	59798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021818	GC	3	6	59819	59824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_021818	CACG	2	8	66357	66364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_021818	GTT	2	6	66389	66394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_021818	TGA	2	6	66759	66764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021818	GTG	2	6	66905	66910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_021818	A	6	6	71538	71543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_021818	TAA	2	6	138598	138603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_021818	TAA	2	6	146107	146112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021818	TCGAT	2	10	146138	146147	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_021818	CT	3	6	146180	146185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_021818	TAA	2	6	146963	146968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_021818	CA	3	6	154590	154595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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323	NC_021818	ATT	2	6	164959	164964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_021818	AAT	2	6	170532	170537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_021818	T	6	6	173532	173537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_021818	GAA	2	6	173591	173596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_021818	AAG	2	6	173613	173618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_021818	GTG	3	9	173864	173872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_021818	T	8	8	173969	173976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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