MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021818	AC	3	6	1303019	1303024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_021818	GTAG	2	8	1303060	1303067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021818	CCT	2	6	1303160	1303165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_021818	AAG	2	6	1303173	1303178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021818	CA	3	6	1303195	1303200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_021818	TGA	2	6	1303208	1303213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021818	GGT	2	6	1303251	1303256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021818	GGT	2	6	1303286	1303291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021818	AGG	2	6	1303465	1303470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021818	CCA	2	6	1303495	1303500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_021818	A	6	6	1303518	1303523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021818	AAC	2	6	1303605	1303610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021818	GTT	2	6	1303615	1303620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021818	TC	3	6	1303627	1303632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_021818	ACG	2	6	1303646	1303651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021818	GCG	2	6	1303927	1303932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021818	GAG	2	6	1303943	1303948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021818	TG	3	6	1303968	1303973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021818	GC	3	6	1303995	1304000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_021818	G	6	6	1304088	1304093	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021818	TCC	2	6	1304098	1304103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_021818	CTGA	2	8	1304118	1304125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_021818	GTAC	2	8	1304202	1304209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_021818	CAC	2	6	1304225	1304230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_021818	AGC	2	6	1304263	1304268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021818	CGT	2	6	1304284	1304289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_021818	AC	3	6	1304302	1304307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_021818	TGGGG	2	10	1304328	1304337	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021818	GGA	2	6	1304509	1304514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021818	AC	3	6	1304727	1304732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_021818	CGTC	2	8	1304745	1304752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_021818	AAC	2	6	1304764	1304769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021818	AGC	2	6	1304854	1304859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021818	CAT	2	6	1304860	1304865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021818	AAAG	2	8	1304868	1304875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021818	AGCGA	2	10	1304994	1305003	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3537	NC_021818	AGTCG	2	10	1305021	1305030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3538	NC_021818	CGTT	2	8	1305042	1305049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_021818	G	6	6	1305286	1305291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021818	GT	4	8	1305344	1305351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021818	TGA	2	6	1305387	1305392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021818	CAA	2	6	1305414	1305419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021818	GGT	2	6	1305486	1305491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021818	GA	3	6	1305516	1305521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021818	AGTC	2	8	1305612	1305619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_021818	GCTG	2	8	1305630	1305637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_021818	TTA	2	6	1305645	1305650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021818	CGG	2	6	1305769	1305774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_021818	ATG	2	6	1305845	1305850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021818	ACC	2	6	1306040	1306045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_021818	TGG	2	6	1306100	1306105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021818	TCC	2	6	1306126	1306131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_021818	GGA	2	6	1306143	1306148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021818	AGG	2	6	1306181	1306186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021818	GGT	2	6	1306263	1306268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021818	CGG	2	6	1306350	1306355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021818	TCA	2	6	1306378	1306383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021818	CGT	2	6	1306458	1306463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021818	G	6	6	1306507	1306512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021818	GAC	3	9	1306689	1306697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021818	GT	3	6	1306711	1306716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021818	GA	3	6	1306798	1306803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021818	GGC	2	6	1306868	1306873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_021818	GGT	2	6	1306882	1306887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021818	ACT	2	6	1307020	1307025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021818	AG	3	6	1307030	1307035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021818	CCTG	2	8	1307199	1307206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_021818	CCGT	2	8	1307234	1307241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_021818	TTA	2	6	1307250	1307255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021818	ATT	2	6	1307302	1307307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021818	AAATT	2	10	1309168	1309177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021818	CTG	2	6	1309236	1309241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021818	ATT	2	6	1310432	1310437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021818	ACAAA	2	10	1310455	1310464	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3575	NC_021818	AGTG	2	8	1310483	1310490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021818	AGA	2	6	1310507	1310512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021818	TGC	2	6	1311402	1311407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_021818	GCG	2	6	1312235	1312240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_021818	TCG	2	6	1312254	1312259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_021818	GAC	2	6	1313659	1313664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021818	AAT	2	6	1314475	1314480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021818	ATC	2	6	1316502	1316507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021818	GCA	2	6	1316523	1316528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_021818	CCTG	2	8	1316638	1316645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_021818	CCGT	2	8	1316673	1316680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_021818	A	8	8	1316727	1316734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021818	T	8	8	1316760	1316767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021818	CAG	2	6	1316774	1316779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021818	AAT	2	6	1320951	1320956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021818	TATT	2	8	1323185	1323192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021818	GGA	2	6	1323198	1323203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021818	ATAA	2	8	1323226	1323233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021818	ATT	2	6	1323258	1323263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021818	TAT	2	6	1323278	1323283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021818	TCG	2	6	1323286	1323291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021818	TTG	2	6	1323300	1323305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021818	T	6	6	1323320	1323325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021818	ATT	2	6	1323331	1323336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021818	ATT	2	6	1323380	1323385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021818	TTGTT	2	10	1323430	1323439	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021818	T	6	6	1323446	1323451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021818	TA	3	6	1323476	1323481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021818	ATT	2	6	1323499	1323504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021818	GGC	2	6	1326239	1326244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_021818	AGA	2	6	1328387	1328392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021818	GAA	2	6	1328415	1328420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021818	ATG	2	6	1328465	1328470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021818	TCT	2	6	1328641	1328646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_021818	AT	3	6	1328697	1328702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021818	AGT	2	6	1328719	1328724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021818	A	6	6	1328779	1328784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021818	CTT	2	6	1328906	1328911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_021818	AGA	2	6	1328949	1328954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021818	TAT	2	6	1329023	1329028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021818	ATT	2	6	1329044	1329049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021818	AAT	2	6	1329061	1329066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021818	TCT	2	6	1329118	1329123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_021818	TAA	2	6	1329220	1329225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021818	CTGG	2	8	1329750	1329757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_021818	TAT	2	6	1329761	1329766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021818	CGG	2	6	1329813	1329818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021818	CCTGCT	2	12	1329844	1329855	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_021818	GCG	2	6	1329959	1329964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021818	TGA	2	6	1330915	1330920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021818	AAGA	2	8	1330931	1330938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021818	TAA	2	6	1330968	1330973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021818	TAG	2	6	1331013	1331018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021818	GGC	2	6	1335556	1335561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_021818	TGG	2	6	1335694	1335699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_021818	ATT	2	6	1336177	1336182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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