MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021818	AGC	2	6	410403	410408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021818	TGC	2	6	410410	410415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021818	ACT	2	6	410477	410482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021818	TTG	2	6	410574	410579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021818	CGA	2	6	410602	410607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021818	GCA	2	6	410676	410681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021818	GAA	2	6	410735	410740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021818	GGA	2	6	410771	410776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021818	TAA	2	6	410789	410794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021818	GCA	2	6	410797	410802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021818	AGA	2	6	410818	410823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021818	CAG	2	6	410844	410849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021818	G	6	6	410991	410996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021818	GGA	2	6	411035	411040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021818	GGC	2	6	411055	411060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021818	GAA	2	6	411298	411303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021818	TGC	2	6	411374	411379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021818	GTC	2	6	411386	411391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021818	TTG	2	6	411447	411452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021818	GGA	2	6	411499	411504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021818	TCA	2	6	411524	411529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021818	AC	3	6	411550	411555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_021818	CGT	2	6	411618	411623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021818	AC	3	6	411719	411724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_021818	GTAG	2	8	411760	411767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021818	CCT	2	6	411860	411865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_021818	AAG	2	6	411873	411878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021818	CA	3	6	411895	411900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_021818	TGA	2	6	411908	411913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021818	GGT	2	6	411951	411956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021818	GGT	2	6	411986	411991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021818	TGT	2	6	412031	412036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021818	GCTTC	2	10	412061	412070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_021818	CGC	2	6	412075	412080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_021818	AGG	2	6	412163	412168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021818	CCA	2	6	412193	412198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_021818	A	6	6	412216	412221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021818	AAC	2	6	412303	412308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021818	GTT	2	6	412313	412318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021818	TC	3	6	412325	412330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_021818	GAT	2	6	412346	412351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021818	GAAA	2	8	412357	412364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021818	GCG	2	6	412625	412630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021818	GAG	2	6	412641	412646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021818	TG	3	6	412666	412671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021818	GC	3	6	412693	412698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_021818	G	6	6	412786	412791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021818	TCC	2	6	412796	412801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_021818	CTGA	2	8	412816	412823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_021818	GTAC	2	8	412900	412907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_021818	TG	3	6	412932	412937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021818	GGA	2	6	413107	413112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021818	AC	3	6	413325	413330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_021818	CGTC	2	8	413343	413350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_021818	AAC	2	6	413362	413367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021818	AGC	2	6	413452	413457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021818	CAT	2	6	413458	413463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021818	AAAG	2	8	413466	413473	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021818	GTT	2	6	413561	413566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021818	G	6	6	413803	413808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021818	GT	4	8	413861	413868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021818	TGA	2	6	413904	413909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021818	CAA	2	6	413931	413936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021818	GGT	2	6	414003	414008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021818	GA	3	6	414033	414038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021818	AGTC	2	8	414129	414136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_021818	GCTG	2	8	414147	414154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_021818	TTA	2	6	414162	414167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021818	CGG	2	6	414286	414291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021818	ATG	2	6	414362	414367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021818	ACC	2	6	414557	414562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_021818	TGG	2	6	414617	414622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021818	TCC	2	6	414643	414648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_021818	GGA	2	6	414660	414665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021818	AGG	2	6	414698	414703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021818	GGT	2	6	414780	414785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021818	CGG	2	6	414867	414872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021818	TCA	2	6	414895	414900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021818	CGT	2	6	414975	414980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021818	G	6	6	415024	415029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021818	GAC	3	9	415206	415214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021818	GT	3	6	415228	415233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021818	GA	3	6	415315	415320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021818	AAT	2	6	415354	415359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021818	GCA	3	9	415364	415372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021818	GGC	2	6	415374	415379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021818	AAGGA	2	10	415385	415394	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021818	CGC	2	6	415439	415444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_021818	GGC	2	6	415488	415493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021818	GGT	2	6	415502	415507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021818	GGC	2	6	415666	415671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021818	AGC	2	6	415775	415780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1094	NC_021818	T	6	6	417795	417800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021818	GCT	2	6	418768	418773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021818	AGG	2	6	418858	418863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021818	AAT	2	6	418883	418888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021818	A	6	6	418892	418897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021818	AGA	2	6	418950	418955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021818	CGT	2	6	418988	418993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_021818	CGGT	2	8	419006	419013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_021818	CT	3	6	419033	419038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_021818	T	6	6	419105	419110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021818	GC	3	6	419142	419147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_021818	GTAG	2	8	419170	419177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021818	CAC	2	6	419317	419322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_021818	CG	3	6	419333	419338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_021818	AG	3	6	419383	419388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021818	TC	3	6	419391	419396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_021818	TGA	2	6	419481	419486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021818	CAC	2	6	419593	419598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_021818	TCCT	2	8	419607	419614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_021818	TCT	2	6	419622	419627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021818	TTA	2	6	419630	419635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021818	CAA	2	6	419641	419646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021818	CAT	2	6	420935	420940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_021818	TCA	2	6	420980	420985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021818	GGTT	2	8	421118	421125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021818	A	6	6	422068	422073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021818	CTT	2	6	422176	422181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021818	TAC	2	6	422190	422195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021818	GCA	2	6	423445	423450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021818	GCA	2	6	423453	423458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021818	AGTG	2	8	423459	423466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021818	AGAA	2	8	423548	423555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021818	ATT	2	6	423655	423660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021818	AGTGA	2	10	423718	423727	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021818	ACT	2	6	424807	424812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_021818	CGA	2	6	424840	424845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021818	CAA	2	6	424945	424950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021818	TGG	2	6	433355	433360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021818	CCA	2	6	433377	433382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_021818	GAAA	2	8	433425	433432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_021818	T	6	6	433719	433724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_021818	GT	3	6	509080	509085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_021818	GCC	2	6	509109	509114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_021818	GGT	2	6	510358	510363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_021818	TCC	2	6	510404	510409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_021818	GCGG	2	8	510501	510508	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_021818	TCC	2	6	510563	510568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1415	NC_021818	CCT	2	6	510571	510576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1417	NC_021818	G	6	6	510593	510598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_021818	GGA	2	6	510600	510605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_021818	CAT	2	6	510639	510644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_021818	TGA	2	6	513299	513304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_021818	GC	3	6	513358	513363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1424	NC_021818	GCA	2	6	514350	514355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1426	NC_021818	T	7	7	514406	514412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_021818	C	6	6	514445	514450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1429	NC_021818	TGT	2	6	518477	518482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_021818	TAA	2	6	518554	518559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_021818	T	6	6	518973	518978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_021818	TA	3	6	519013	519018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_021818	TA	3	6	519034	519039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_021818	GCGCT	2	10	519716	519725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1439	NC_021818	GCC	2	6	521586	521591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1440	NC_021818	GCT	2	6	522170	522175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_021818	AAC	2	6	522268	522273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_021818	ATA	2	6	522350	522355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_021818	T	6	6	523738	523743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_021818	TTAT	2	8	523754	523761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_021818	TCC	2	6	523785	523790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1448	NC_021818	TTTAA	2	10	523900	523909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_021818	ATCC	2	8	524554	524561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1451	NC_021818	GGA	2	6	524631	524636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_021818	AGCT	2	8	524663	524670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1453	NC_021818	TGTT	2	8	527304	527311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_021818	TATT	2	8	530863	530870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_021818	A	6	6	530916	530921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_021818	GCC	2	6	530922	530927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1457	NC_021818	GAT	2	6	530957	530962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1464	NC_021818	GAC	2	6	532411	532416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_021818	A	8	8	532783	532790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1472	NC_021818	ACTC	2	8	532829	532836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1473	NC_021818	A	6	6	533210	533215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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