MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021818	A	6	6	4638220	4638225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_021818	ACTT	2	8	4638229	4638236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_021818	T	7	7	4638311	4638317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_021818	CCG	2	6	4638447	4638452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_021818	ATT	2	6	4639301	4639306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021818	AGG	2	6	4639324	4639329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_021818	A	7	7	4639334	4639340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021818	CCG	2	6	4639342	4639347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_021818	T	7	7	4639355	4639361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021818	TAC	2	6	4639366	4639371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_021818	CT	3	6	4640795	4640800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_021818	TTTC	2	8	4641435	4641442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13013	NC_021818	CTA	2	6	4642240	4642245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_021818	GTAC	2	8	4642254	4642261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13015	NC_021818	TGGC	2	8	4642321	4642328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13016	NC_021818	A	6	6	4642371	4642376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021818	TCGGC	2	10	4642400	4642409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13018	NC_021818	TAC	2	6	4647200	4647205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_021818	ACT	3	9	4647930	4647938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_021818	A	7	7	4647961	4647967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_021818	A	6	6	4648018	4648023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_021818	TCC	2	6	4649996	4650001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_021818	CTC	2	6	4651130	4651135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13024	NC_021818	ATT	2	6	4653044	4653049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021818	CTC	2	6	4653069	4653074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13026	NC_021818	TAT	2	6	4653204	4653209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_021818	TCTTT	2	10	4653309	4653318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13029	NC_021818	TGTCGC	2	12	4653352	4653363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13031	NC_021818	A	8	8	4654404	4654411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021818	A	6	6	4654707	4654712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021818	AAAT	2	8	4654716	4654723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13037	NC_021818	AGTTA	2	10	4658201	4658210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13039	NC_021818	AGTTT	2	10	4658781	4658790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021818	CTTA	2	8	4658814	4658821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_021818	TAA	2	6	4659247	4659252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021818	CA	3	6	4659261	4659266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_021818	A	8	8	4661094	4661101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_021818	ATT	2	6	4661146	4661151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13047	NC_021818	AT	3	6	4661312	4661317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_021818	A	7	7	4661329	4661335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13052	NC_021818	TAT	2	6	4662283	4662288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_021818	CTT	2	6	4662291	4662296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_021818	CCG	2	6	4662374	4662379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13057	NC_021818	T	7	7	4662652	4662658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021818	GAT	2	6	4662665	4662670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13062	NC_021818	GAA	2	6	4663422	4663427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021818	A	7	7	4663477	4663483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021818	GTT	2	6	4666080	4666085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13068	NC_021818	GGC	2	6	4666206	4666211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_021818	GTT	3	9	4666231	4666239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_021818	GCG	2	6	4666263	4666268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_021818	GC	3	6	4668328	4668333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13074	NC_021818	GAC	2	6	4669085	4669090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13079	NC_021818	TTTG	2	8	4672812	4672819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13084	NC_021818	GCCAG	2	10	4678355	4678364	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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13088	NC_021818	TAA	2	6	4678481	4678486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13098	NC_021818	AATA	2	8	4685433	4685440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_021818	TGACC	2	10	4685461	4685470	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13100	NC_021818	ATAAA	2	10	4685484	4685493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_021818	TCT	2	6	4685511	4685516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_021818	TCA	2	6	4685524	4685529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_021818	CT	3	6	4685542	4685547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13104	NC_021818	ATTA	2	8	4685574	4685581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_021818	TA	3	6	4691554	4691559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_021818	TAA	2	6	4691564	4691569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_021818	TTA	3	9	4691577	4691585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_021818	GAT	2	6	4691644	4691649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13111	NC_021818	CAA	2	6	4691719	4691724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_021818	A	8	8	4691927	4691934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_021818	T	7	7	4691950	4691956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021818	GCAA	2	8	4692037	4692044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_021818	ACTA	2	8	4695335	4695342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13118	NC_021818	GCA	2	6	4698611	4698616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_021818	TTG	2	6	4698716	4698721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021818	GGC	2	6	4698748	4698753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13122	NC_021818	ATC	2	6	4698852	4698857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_021818	GGCAA	2	10	4698876	4698885	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13124	NC_021818	T	6	6	4699002	4699007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_021818	TAC	2	6	4702401	4702406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_021818	CG	3	6	4702407	4702412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_021818	A	6	6	4705012	4705017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021818	T	6	6	4705032	4705037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_021818	CGC	2	6	4705095	4705100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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