MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 13746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021818	TGC	2	6	2106222	2106227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_021818	ATC	2	6	2106277	2106282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_021818	CGA	2	6	2106368	2106373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_021818	TTA	2	6	2106433	2106438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021818	ATA	2	6	2106452	2106457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021818	GTA	2	6	2106490	2106495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021818	TTA	2	6	2106575	2106580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_021818	AT	3	6	2106690	2106695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021818	A	6	6	2106724	2106729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021818	TCA	2	6	2106756	2106761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_021818	TGA	2	6	2106765	2106770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021818	GTA	2	6	2107450	2107455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021818	TGC	2	6	2107461	2107466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_021818	TA	3	6	2107474	2107479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021818	GCA	2	6	2107480	2107485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_021818	TAT	2	6	2107491	2107496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021818	AGTT	2	8	2107550	2107557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021818	T	6	6	2107614	2107619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_021818	TA	4	8	2108404	2108411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_021818	T	6	6	2108431	2108436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021818	TGAT	2	8	2108458	2108465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_021818	A	6	6	2108473	2108478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021818	GATTA	2	10	2108485	2108494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021818	TATTTT	2	12	2108510	2108521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021818	A	6	6	2108534	2108539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_021818	AGG	2	6	2108554	2108559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_021818	CCG	2	6	2108808	2108813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_021818	GGC	2	6	2108828	2108833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_021818	AT	3	6	2109091	2109096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_021818	TAA	2	6	2109104	2109109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021818	CCT	3	9	2109909	2109917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_021818	TA	3	6	2110780	2110785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021818	CAT	2	6	2110797	2110802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021818	TA	3	6	2111153	2111158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021818	TGTC	2	8	2111182	2111189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_021818	TG	3	6	2111294	2111299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021818	ATGG	2	8	2111304	2111311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021818	ATCTCG	2	12	2111359	2111370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_021818	T	6	6	2111549	2111554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021818	T	7	7	2114224	2114230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021818	CGCT	2	8	2114243	2114250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_021818	TATT	2	8	2114288	2114295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021818	ATA	2	6	2114332	2114337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021818	GTT	2	6	2115430	2115435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021818	TAT	2	6	2115478	2115483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021818	TAA	2	6	2115489	2115494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021818	GA	3	6	2115541	2115546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021818	CAA	2	6	2117268	2117273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_021818	T	7	7	2124849	2124855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021818	GTT	2	6	2124877	2124882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_021818	T	6	6	2124893	2124898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021818	TTTTC	2	10	2125015	2125024	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5553	NC_021818	GGA	2	6	2125198	2125203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021818	TTATT	2	10	2125855	2125864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021818	T	6	6	2127678	2127683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021818	TGT	2	6	2127688	2127693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021818	G	6	6	2127698	2127703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_021818	TTCTT	2	10	2127788	2127797	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5559	NC_021818	A	6	6	2127807	2127812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021818	CCAGA	2	10	2128327	2128336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5561	NC_021818	A	6	6	2128339	2128344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021818	T	6	6	2128360	2128365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021818	A	7	7	2129623	2129629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021818	CAT	2	6	2129645	2129650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_021818	GAT	2	6	2129663	2129668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021818	A	8	8	2129718	2129725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_021818	A	8	8	2129756	2129763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021818	AATC	2	8	2130298	2130305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_021818	AAAAAT	2	12	2130408	2130419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021818	T	7	7	2133773	2133779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021818	GCGG	2	8	2135906	2135913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_021818	CCCG	2	8	2135922	2135929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5573	NC_021818	TGC	2	6	2136445	2136450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_021818	AAGAGA	2	12	2136451	2136462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_021818	A	7	7	2136462	2136468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021818	GC	3	6	2136471	2136476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_021818	TAA	2	6	2137183	2137188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021818	TACA	2	8	2137776	2137783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_021818	GAT	2	6	2139407	2139412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021818	TGG	2	6	2139486	2139491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_021818	TTC	2	6	2139531	2139536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_021818	GAA	2	6	2139571	2139576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021818	CCA	2	6	2140959	2140964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_021818	ACGG	2	8	2141618	2141625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_021818	A	6	6	2141635	2141640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021818	CT	3	6	2142348	2142353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_021818	TAAT	2	8	2142365	2142372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_021818	AAT	2	6	2142380	2142385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021818	GAA	2	6	2142615	2142620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_021818	A	6	6	2142910	2142915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_021818	AAT	2	6	2143685	2143690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021818	CTT	2	6	2144746	2144751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_021818	AGTCA	2	10	2144782	2144791	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5597	NC_021818	AAT	2	6	2144805	2144810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021818	A	7	7	2144811	2144817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021818	TGAGTA	2	12	2144852	2144863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_021818	GCTG	2	8	2144962	2144969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_021818	ATG	2	6	2144988	2144993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021818	A	6	6	2144998	2145003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021818	TAA	2	6	2145016	2145021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021818	TCA	2	6	2145050	2145055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_021818	TGA	2	6	2145061	2145066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021818	GTT	2	6	2145103	2145108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021818	A	6	6	2145121	2145126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021818	AAC	2	6	2145129	2145134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_021818	GGGT	2	8	2145193	2145200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021818	ATG	2	6	2145207	2145212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_021818	GCCA	2	8	2145225	2145232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_021818	TAT	2	6	2145249	2145254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021818	TGG	2	6	2145256	2145261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021818	ACA	2	6	2145312	2145317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_021818	ATA	2	6	2145350	2145355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021818	AAT	2	6	2145365	2145370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021818	TCA	3	9	2145420	2145428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_021818	TTG	2	6	2145447	2145452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_021818	A	6	6	2145472	2145477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021818	TAA	2	6	2145478	2145483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_021818	T	8	8	2145493	2145500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021818	TGA	2	6	2145552	2145557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_021818	GA	4	8	2145605	2145612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021818	CCA	2	6	2145635	2145640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_021818	AAC	2	6	2147812	2147817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_021818	A	7	7	2147856	2147862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_021818	AGG	2	6	2147874	2147879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_021818	G	6	6	2147936	2147941	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_021818	CTT	2	6	2148015	2148020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5902	NC_021818	AT	3	6	2211401	2211406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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