MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021816	TCCTG	2	10	145	154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021816	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021816	GGC	2	6	240	245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021816	GCA	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021816	GACA	2	8	305	312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021816	GCG	2	6	646	651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021816	CTCA	2	8	663	670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021816	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021816	C	6	6	784	789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_021816	TG	3	6	1019	1024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021816	C	6	6	1031	1036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_021816	GCA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021816	GAT	2	6	1147	1152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021816	TAC	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021816	CTG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021816	TAGGT	2	10	1252	1261	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021816	TAAC	2	8	1275	1282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021816	ACC	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021816	T	6	6	1309	1314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021816	GGA	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021816	A	9	9	2972	2980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021816	A	7	7	2988	2994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021816	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021816	TCA	3	9	3090	3098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021816	CAC	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021816	AGGA	2	8	3211	3218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021816	T	6	6	3439	3444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021816	CTT	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021816	ATC	2	6	3484	3489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021816	GCC	2	6	3521	3526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021816	A	6	6	3530	3535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021816	CAG	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021816	TCT	3	9	3584	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.