MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021814	TTAA	2	8	4763900	4763907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_021814	A	6	6	4763906	4763911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_021814	AAG	2	6	4763949	4763954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_021814	TGGC	2	8	4766358	4766365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_021814	GCCA	2	8	4766372	4766379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_021814	TTC	2	6	4766397	4766402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_021814	AATA	2	8	4766945	4766952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021814	GCT	2	6	4766982	4766987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_021814	T	6	6	4767055	4767060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021814	AC	3	6	4767067	4767072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13011	NC_021814	TTG	2	6	4767079	4767084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_021814	CCCT	2	8	4769191	4769198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13013	NC_021814	TTC	2	6	4769199	4769204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_021814	GCC	2	6	4769230	4769235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_021814	AT	4	8	4770888	4770895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021814	T	6	6	4770913	4770918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021814	GGTT	2	8	4770921	4770928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_021814	GCG	2	6	4771007	4771012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_021814	TTA	2	6	4771014	4771019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_021814	TGT	2	6	4771038	4771043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_021814	CT	3	6	4771156	4771161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_021814	T	7	7	4771165	4771171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_021814	GAC	2	6	4771185	4771190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_021814	AAT	2	6	4771214	4771219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021814	TCA	2	6	4771229	4771234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_021814	GGC	2	6	4772973	4772978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_021814	AGCG	2	8	4773026	4773033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13029	NC_021814	CGG	2	6	4775105	4775110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_021814	ACC	2	6	4777392	4777397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13031	NC_021814	AATT	2	8	4777462	4777469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021814	TTA	2	6	4777471	4777476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021814	TAAA	2	8	4777490	4777497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_021814	GCG	2	6	4778139	4778144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13036	NC_021814	T	6	6	4778222	4778227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021814	AAAC	2	8	4780820	4780827	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_021814	GTA	2	6	4780833	4780838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_021814	A	6	6	4784232	4784237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021814	TTGCC	2	10	4784354	4784363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13041	NC_021814	GAT	2	6	4784382	4784387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021814	TGT	2	6	4784476	4784481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_021814	CAA	2	6	4784518	4784523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_021814	CTG	2	6	4784622	4784627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_021814	TAG	2	6	4784671	4784676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021814	T	6	6	4786392	4786397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_021814	TTAG	2	8	4787896	4787903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_021814	A	7	7	4791283	4791289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_021814	T	7	7	4791305	4791311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_021814	TTG	2	6	4791514	4791519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_021814	ACT	2	6	4791531	4791536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_021814	AATA	2	8	4791542	4791549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_021814	ATC	2	6	4791589	4791594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_021814	TAA	3	9	4791653	4791661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_021814	TTA	2	6	4791733	4791738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_021814	CAA	2	6	4791791	4791796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_021814	AG	3	6	4792329	4792334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021814	GGA	2	6	4792371	4792376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_021814	TATT	2	8	4792377	4792384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_021814	TA	3	6	4792390	4792395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021814	TTAA	2	8	4798244	4798251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021814	AG	3	6	4798279	4798284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021814	ATG	2	6	4798296	4798301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021814	AGA	2	6	4798310	4798315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021814	TTTAT	2	10	4798333	4798342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_021814	CAGGT	2	10	4798354	4798363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13067	NC_021814	TTAT	2	8	4798385	4798392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_021814	ATGA	2	8	4798396	4798403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_021814	ATT	4	12	4798445	4798456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_021814	AGTT	2	8	4798479	4798486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_021814	AAT	2	6	4798509	4798514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_021814	AGT	2	6	4798526	4798531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13075	NC_021814	TTG	2	6	4800926	4800931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13077	NC_021814	A	8	8	4800985	4800992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021814	A	6	6	4800996	4801001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_021814	TTTCT	2	10	4803908	4803917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13080	NC_021814	TA	3	6	4803978	4803983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13084	NC_021814	T	6	6	4805451	4805456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_021814	CAT	2	6	4805473	4805478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13087	NC_021814	CTGGC	2	10	4805546	4805555	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13088	NC_021814	CT	3	6	4805598	4805603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_021814	GCC	2	6	4807083	4807088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13091	NC_021814	GGT	2	6	4807726	4807731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_021814	CGG	2	6	4808986	4808991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13094	NC_021814	GT	3	6	4811965	4811970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_021814	TGT	2	6	4812022	4812027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13098	NC_021814	GTC	2	6	4814820	4814825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_021814	AG	3	6	4814856	4814861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_021814	GC	4	8	4814875	4814882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_021814	TTG	2	6	4815550	4815555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_021814	GC	3	6	4815577	4815582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_021814	CCG	2	6	4817641	4817646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_021814	ACA	2	6	4817672	4817677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_021814	GCC	2	6	4817699	4817704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_021814	TC	3	6	4817725	4817730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_021814	GCG	2	6	4817742	4817747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_021814	GAA	2	6	4817801	4817806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_021814	AAC	2	6	4817825	4817830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_021814	T	7	7	4820427	4820433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_021814	TTC	2	6	4820483	4820488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_021814	CGT	2	6	4821102	4821107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_021814	TAT	2	6	4821220	4821225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021814	ATC	2	6	4821240	4821245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_021814	A	7	7	4821252	4821258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021814	T	7	7	4821274	4821280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_021814	TGT	2	6	4821518	4821523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_021814	CGG	2	6	4821530	4821535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_021814	ATA	2	6	4821621	4821626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021814	CTT	2	6	4821672	4821677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_021814	GCC	2	6	4822551	4822556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_021814	GCG	2	6	4822567	4822572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_021814	T	8	8	4822574	4822581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_021814	AT	3	6	4822593	4822598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_021814	ATTTG	2	10	4822610	4822619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_021814	TTAAT	2	10	4822739	4822748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_021814	AAT	2	6	4822759	4822764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021814	T	8	8	4822809	4822816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_021814	TG	3	6	4824644	4824649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_021814	TTA	2	6	4824658	4824663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_021814	TAAG	2	8	4825089	4825096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13248	NC_021814	CGG	2	6	4859868	4859873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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