MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021814	CAA	2	6	3664110	3664115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_021814	CAA	2	6	3664221	3664226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_021814	A	6	6	3664322	3664327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021814	ATATCA	2	12	3664331	3664342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10005	NC_021814	T	6	6	3664424	3664429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021814	AAC	2	6	3664449	3664454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_021814	AT	3	6	3664484	3664489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_021814	CG	3	6	3664503	3664508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_021814	TAA	2	6	3664523	3664528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_021814	GCA	2	6	3664574	3664579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_021814	TGG	2	6	3664741	3664746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021814	GGC	2	6	3664760	3664765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_021814	GCC	2	6	3664791	3664796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_021814	GGC	2	6	3664801	3664806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_021814	CAAC	2	8	3666744	3666751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_021814	ATA	2	6	3666755	3666760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_021814	GC	3	6	3666763	3666768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_021814	GAAAG	2	10	3666791	3666800	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_021814	AAT	2	6	3666931	3666936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_021814	CT	3	6	3666973	3666978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_021814	TCC	2	6	3668050	3668055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_021814	TTA	2	6	3668072	3668077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021814	A	6	6	3668104	3668109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_021814	TTC	2	6	3668129	3668134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_021814	TC	4	8	3668133	3668140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_021814	GAT	2	6	3668174	3668179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_021814	TTA	2	6	3668215	3668220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_021814	TCA	2	6	3668235	3668240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_021814	A	7	7	3668243	3668249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021814	A	6	6	3668263	3668268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_021814	GAT	2	6	3668297	3668302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_021814	CTGA	2	8	3668308	3668315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10033	NC_021814	TCC	2	6	3669246	3669251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_021814	A	6	6	3669269	3669274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021814	T	6	6	3669347	3669352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021814	T	6	6	3669357	3669362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_021814	AATG	2	8	3669488	3669495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021814	TAT	2	6	3669506	3669511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_021814	CTG	2	6	3670573	3670578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_021814	ATC	2	6	3670603	3670608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021814	CTT	2	6	3670703	3670708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_021814	CGT	2	6	3670720	3670725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_021814	TTA	2	6	3670759	3670764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021814	T	6	6	3671385	3671390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_021814	TATG	2	8	3671435	3671442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021814	A	7	7	3671475	3671481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021814	CAA	2	6	3671493	3671498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_021814	ACG	2	6	3671689	3671694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_021814	TCAAC	2	10	3671705	3671714	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10050	NC_021814	TCA	2	6	3671739	3671744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_021814	GT	3	6	3671819	3671824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_021814	ATG	2	6	3671840	3671845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_021814	TTC	2	6	3671856	3671861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_021814	AGG	2	6	3673767	3673772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_021814	CAA	2	6	3673811	3673816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_021814	AT	3	6	3673839	3673844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021814	CCA	2	6	3673861	3673866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_021814	GTA	2	6	3673925	3673930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021814	CACCT	2	10	3674051	3674060	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10060	NC_021814	ACC	2	6	3674071	3674076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_021814	TGC	2	6	3674093	3674098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_021814	ATT	2	6	3674105	3674110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_021814	A	7	7	3674117	3674123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_021814	AGA	2	6	3674129	3674134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_021814	A	6	6	3674140	3674145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_021814	CCA	2	6	3674154	3674159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_021814	C	6	6	3674187	3674192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10068	NC_021814	TA	3	6	3674232	3674237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021814	ATA	2	6	3674245	3674250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_021814	TTA	2	6	3674270	3674275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_021814	T	6	6	3674297	3674302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_021814	GAG	2	6	3674303	3674308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_021814	A	6	6	3675093	3675098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_021814	AT	3	6	3675113	3675118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021814	TA	3	6	3675212	3675217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_021814	ACG	2	6	3675245	3675250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_021814	T	6	6	3675709	3675714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_021814	GGAT	2	8	3675720	3675727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021814	ATC	2	6	3675804	3675809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_021814	GTTT	2	8	3675810	3675817	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021814	T	7	7	3675815	3675821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_021814	CTG	2	6	3680736	3680741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_021814	AT	3	6	3691023	3691028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_021814	GAG	2	6	3691030	3691035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_021814	CTC	2	6	3691045	3691050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_021814	TCG	2	6	3691064	3691069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_021814	GGCT	2	8	3695818	3695825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10088	NC_021814	TGC	2	6	3695893	3695898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_021814	ATA	2	6	3695906	3695911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021814	GCTC	2	8	3695951	3695958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10091	NC_021814	G	6	6	3696388	3696393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_021814	CTC	2	6	3696396	3696401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_021814	AAAT	2	8	3696484	3696491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_021814	AAAT	2	8	3696507	3696514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_021814	A	7	7	3696565	3696571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_021814	CCA	2	6	3696573	3696578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_021814	ATT	2	6	3696590	3696595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_021814	CCA	2	6	3696735	3696740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10099	NC_021814	CAG	2	6	3696785	3696790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_021814	AAT	2	6	3696808	3696813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_021814	CAG	2	6	3696835	3696840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_021814	CACAA	2	10	3698512	3698521	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10103	NC_021814	T	6	6	3698552	3698557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_021814	AGA	2	6	3698569	3698574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_021814	ACG	2	6	3700536	3700541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_021814	GCT	2	6	3700554	3700559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_021814	TAA	2	6	3700570	3700575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_021814	GA	3	6	3700576	3700581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021814	TCA	2	6	3701908	3701913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_021814	T	6	6	3702970	3702975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_021814	CAT	2	6	3703048	3703053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_021814	GGC	2	6	3703082	3703087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_021814	T	7	7	3705328	3705334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_021814	GTC	2	6	3705383	3705388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_021814	ATC	2	6	3705392	3705397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10117	NC_021814	GCAG	2	8	3705549	3705556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_021814	GAC	2	6	3705641	3705646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10120	NC_021814	TGT	2	6	3705668	3705673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021814	GCC	2	6	3707249	3707254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_021814	GCGCT	2	10	3707275	3707284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10123	NC_021814	CAT	2	6	3707303	3707308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_021814	CCA	2	6	3707325	3707330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_021814	AAG	2	6	3707332	3707337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_021814	CGC	2	6	3710731	3710736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10128	NC_021814	TAA	3	9	3712007	3712015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_021814	GGT	2	6	3712119	3712124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_021814	TAAA	2	8	3712139	3712146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_021814	TTTA	2	8	3712682	3712689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_021814	TAT	2	6	3712701	3712706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_021814	ATAA	2	8	3712717	3712724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_021814	TTA	2	6	3712756	3712761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10246	NC_021814	GCAG	2	8	3744438	3744445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10247	NC_021814	AG	4	8	3745837	3745844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_021814	T	7	7	3745908	3745914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_021814	A	6	6	3748356	3748361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_021814	AAAAG	2	10	3750809	3750818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_021814	ACG	2	6	3750934	3750939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_021814	AATC	2	8	3753131	3753138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10257	NC_021814	A	6	6	3753148	3753153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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