MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021814	CTGG	2	8	2870258	2870265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_021814	GCA	2	6	2870278	2870283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_021814	CACG	2	8	2870303	2870310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_021814	ACG	2	6	2870336	2870341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_021814	GGCG	2	8	2870396	2870403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_021814	T	8	8	2870430	2870437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_021814	A	6	6	2870640	2870645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021814	ATA	2	6	2870649	2870654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021814	ATT	2	6	2870662	2870667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021814	AAC	2	6	2870701	2870706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_021814	TAT	2	6	2876071	2876076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021814	TA	3	6	2876085	2876090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_021814	AT	3	6	2876100	2876105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_021814	ATA	2	6	2876108	2876113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021814	ATTTGC	2	12	2876126	2876137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8016	NC_021814	CG	3	6	2876163	2876168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_021814	CAC	2	6	2876179	2876184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_021814	TCCC	2	8	2878510	2878517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8019	NC_021814	GGGA	2	8	2878525	2878532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021814	CGCAC	2	10	2881079	2881088	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8021	NC_021814	TAA	2	6	2881115	2881120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_021814	CA	3	6	2881122	2881127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_021814	TGAG	2	8	2881198	2881205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021814	GCGAC	2	10	2881273	2881282	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8025	NC_021814	TCC	2	6	2882303	2882308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_021814	CTG	2	6	2882337	2882342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_021814	ACCA	2	8	2882360	2882367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_021814	T	6	6	2883061	2883066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_021814	ATAA	2	8	2883157	2883164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021814	TTA	2	6	2886822	2886827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021814	TTA	2	6	2886835	2886840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_021814	GGA	2	6	2886854	2886859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021814	GGC	2	6	2887886	2887891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_021814	TCTT	2	8	2887950	2887957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_021814	ACG	2	6	2890778	2890783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_021814	TACT	2	8	2890812	2890819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8037	NC_021814	ACGA	2	8	2890860	2890867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8038	NC_021814	CCCT	2	8	2890878	2890885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8039	NC_021814	TTG	2	6	2892885	2892890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021814	ACG	2	6	2892897	2892902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_021814	TCAT	2	8	2892964	2892971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_021814	ACG	2	6	2893019	2893024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_021814	CAG	2	6	2893137	2893142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_021814	TCA	2	6	2893143	2893148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_021814	GCT	2	6	2893152	2893157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_021814	GA	3	6	2893168	2893173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_021814	A	6	6	2894458	2894463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021814	ACGTTA	2	12	2895954	2895965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8049	NC_021814	A	7	7	2895972	2895978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021814	GC	3	6	2896008	2896013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_021814	T	6	6	2896107	2896112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021814	CAT	2	6	2897363	2897368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_021814	TCA	2	6	2897369	2897374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_021814	CGA	2	6	2897404	2897409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_021814	TTTC	2	8	2898311	2898318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_021814	A	8	8	2898365	2898372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_021814	TAT	2	6	2898392	2898397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021814	A	6	6	2899785	2899790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_021814	T	6	6	2899815	2899820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021814	TGG	2	6	2899837	2899842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_021814	AAAT	2	8	2899922	2899929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021814	CGC	2	6	2900829	2900834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_021814	CTG	2	6	2901114	2901119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_021814	AAT	2	6	2901508	2901513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021814	CAA	2	6	2901551	2901556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_021814	TAT	2	6	2901563	2901568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_021814	TTA	2	6	2901574	2901579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_021814	T	7	7	2901631	2901637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_021814	AAT	2	6	2901845	2901850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_021814	TTCT	2	8	2901856	2901863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_021814	GAG	2	6	2901881	2901886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_021814	CGC	3	9	2901956	2901964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_021814	GC	3	6	2902004	2902009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8074	NC_021814	AAC	2	6	2902067	2902072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_021814	TAC	2	6	2902085	2902090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_021814	TG	3	6	2902151	2902156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_021814	ACT	2	6	2902174	2902179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_021814	AAC	2	6	2902208	2902213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_021814	TAA	2	6	2902221	2902226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_021814	ATT	2	6	2902259	2902264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_021814	TAAT	2	8	2905265	2905272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_021814	CCA	2	6	2905281	2905286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_021814	GCG	2	6	2905298	2905303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_021814	CCA	2	6	2905481	2905486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_021814	AG	3	6	2905629	2905634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_021814	TAC	2	6	2905742	2905747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_021814	AAG	2	6	2905770	2905775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_021814	CTC	2	6	2905787	2905792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_021814	GAT	2	6	2905820	2905825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_021814	CCG	2	6	2905837	2905842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_021814	A	8	8	2905887	2905894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_021814	ATGA	2	8	2905926	2905933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021814	GAC	2	6	2906337	2906342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_021814	AAG	2	6	2906397	2906402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_021814	GC	3	6	2906426	2906431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8098	NC_021814	TGAAG	2	10	2906505	2906514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021814	GCC	2	6	2906680	2906685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_021814	ATCA	2	8	2906698	2906705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_021814	T	7	7	2906749	2906755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_021814	AAT	2	6	2907393	2907398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_021814	T	7	7	2907421	2907427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_021814	ATG	2	6	2907440	2907445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_021814	ATA	2	6	2907449	2907454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_021814	AT	3	6	2907479	2907484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021814	CAT	2	6	2907490	2907495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_021814	GGA	2	6	2907504	2907509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_021814	T	6	6	2908592	2908597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_021814	T	7	7	2908684	2908690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021814	TCC	2	6	2908708	2908713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_021814	TTA	2	6	2908750	2908755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021814	ATT	2	6	2908787	2908792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021814	ACA	2	6	2908806	2908811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_021814	ACT	2	6	2908818	2908823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8117	NC_021814	T	6	6	2908980	2908985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021814	TATT	2	8	2909011	2909018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_021814	TAT	2	6	2909062	2909067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021814	TG	3	6	2909076	2909081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021814	GT	3	6	2909082	2909087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021814	TTA	2	6	2909126	2909131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021814	ACA	2	6	2909164	2909169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_021814	CT	3	6	2914033	2914038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_021814	TCCCT	2	10	2915359	2915368	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8126	NC_021814	AC	4	8	2915960	2915967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_021814	ATT	2	6	2915999	2916004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_021814	AGAT	2	8	2916047	2916054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021814	ATTA	2	8	2916062	2916069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_021814	TAAT	2	8	2916103	2916110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021814	TAA	2	6	2916138	2916143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_021814	TAAA	2	8	2916158	2916165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_021814	A	6	6	2916163	2916168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_021814	AAG	2	6	2916216	2916221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8173	NC_021814	ATAAA	2	10	2937697	2937706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8252	NC_021814	AAT	2	6	2985568	2985573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8261	NC_021814	T	6	6	2990892	2990897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8262	NC_021814	TAA	2	6	2990905	2990910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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