MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 13249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021814	TCA	2	6	2471262	2471267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_021814	A	7	7	2471325	2471331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_021814	TAA	2	6	2471342	2471347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_021814	CAG	2	6	2472444	2472449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_021814	T	7	7	2472491	2472497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021814	TC	3	6	2472499	2472504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7007	NC_021814	A	6	6	2473843	2473848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_021814	GTT	2	6	2475207	2475212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_021814	ACA	2	6	2475335	2475340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_021814	CTT	2	6	2475353	2475358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_021814	TA	3	6	2477330	2477335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021814	CCTAA	2	10	2477354	2477363	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7013	NC_021814	AAG	2	6	2477368	2477373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_021814	GA	3	6	2477396	2477401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021814	GGC	2	6	2477421	2477426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_021814	CGC	2	6	2477430	2477435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_021814	TTG	2	6	2477460	2477465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_021814	GGC	2	6	2477474	2477479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_021814	GGCT	2	8	2484831	2484838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7020	NC_021814	TCC	2	6	2484917	2484922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_021814	A	6	6	2484934	2484939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_021814	TAA	2	6	2486633	2486638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_021814	CGT	2	6	2486643	2486648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_021814	GAA	2	6	2486680	2486685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_021814	GCC	2	6	2486721	2486726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_021814	TGA	2	6	2486729	2486734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_021814	TCC	2	6	2487742	2487747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_021814	TCA	2	6	2489039	2489044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7030	NC_021814	TTG	2	6	2491804	2491809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_021814	T	6	6	2494175	2494180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021814	GCA	2	6	2494199	2494204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_021814	A	6	6	2494204	2494209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021814	A	6	6	2494268	2494273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_021814	T	6	6	2494289	2494294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_021814	TCC	2	6	2494607	2494612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_021814	GATT	2	8	2494646	2494653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_021814	GGC	2	6	2494657	2494662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_021814	GCC	2	6	2494667	2494672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7040	NC_021814	GTT	2	6	2496486	2496491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_021814	TAC	2	6	2496526	2496531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_021814	CGC	2	6	2497266	2497271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_021814	AAT	2	6	2497345	2497350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_021814	TAT	2	6	2498184	2498189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_021814	A	6	6	2498190	2498195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021814	ATC	2	6	2498216	2498221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_021814	GC	3	6	2498272	2498277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_021814	AGA	2	6	2498299	2498304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_021814	A	6	6	2499604	2499609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_021814	A	6	6	2499646	2499651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_021814	CAC	2	6	2500756	2500761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7052	NC_021814	CCTG	2	8	2500774	2500781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_021814	CGC	2	6	2500839	2500844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_021814	GAG	2	6	2500862	2500867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_021814	CA	3	6	2500884	2500889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_021814	CCG	2	6	2501682	2501687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_021814	GC	3	6	2501732	2501737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_021814	TATT	2	8	2503599	2503606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_021814	TAA	2	6	2503628	2503633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_021814	GTT	2	6	2503649	2503654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021814	ATTAA	2	10	2503658	2503667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_021814	TTG	2	6	2503691	2503696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_021814	ATTA	2	8	2503707	2503714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021814	GCA	2	6	2503720	2503725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_021814	GGA	2	6	2503726	2503731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7067	NC_021814	ATTT	2	8	2503769	2503776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_021814	TTA	2	6	2503777	2503782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021814	TCG	2	6	2503897	2503902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_021814	TAA	2	6	2503909	2503914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021814	AG	4	8	2503915	2503922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021814	TAAA	2	8	2504810	2504817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_021814	A	6	6	2504815	2504820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_021814	AAG	2	6	2504828	2504833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7077	NC_021814	T	6	6	2508216	2508221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_021814	ATT	2	6	2508366	2508371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_021814	CAA	2	6	2508385	2508390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_021814	A	6	6	2508409	2508414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_021814	T	6	6	2508646	2508651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_021814	CTG	3	9	2509693	2509701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7085	NC_021814	ATTTT	2	10	2511360	2511369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7089	NC_021814	AT	3	6	2512746	2512751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_021814	TTA	2	6	2512781	2512786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7095	NC_021814	TA	3	6	2516958	2516963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021814	AT	3	6	2516990	2516995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021814	TAGGG	2	10	2517057	2517066	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_021814	ATT	2	6	2517067	2517072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_021814	A	7	7	2517093	2517099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_021814	AAT	2	6	2518451	2518456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_021814	TGA	2	6	2518476	2518481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021814	TGA	2	6	2518498	2518503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7105	NC_021814	CAA	2	6	2518559	2518564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_021814	TCA	3	9	2518626	2518634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_021814	CAT	2	6	2518653	2518658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_021814	AGA	2	6	2520734	2520739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_021814	TTG	2	6	2520752	2520757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_021814	TC	3	6	2525490	2525495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_021814	TTCC	2	8	2525500	2525507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_021814	CCTG	2	8	2525513	2525520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_021814	GC	3	6	2525588	2525593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_021814	CATG	2	8	2525706	2525713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7115	NC_021814	GCA	2	6	2525719	2525724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_021814	CATA	2	8	2525725	2525732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7117	NC_021814	T	6	6	2525739	2525744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_021814	CAG	2	6	2525768	2525773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7120	NC_021814	AG	3	6	2525827	2525832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_021814	TTAA	2	8	2525874	2525881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_021814	TGA	2	6	2525888	2525893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_021814	T	7	7	2525963	2525969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021814	CAA	2	6	2526008	2526013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7128	NC_021814	TAT	2	6	2530600	2530605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_021814	T	6	6	2531361	2531366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_021814	TGC	2	6	2531383	2531388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_021814	GTA	2	6	2531494	2531499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_021814	GT	3	6	2531531	2531536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_021814	AAG	2	6	2531599	2531604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_021814	GGC	2	6	2531898	2531903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7135	NC_021814	T	6	6	2531930	2531935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7136	NC_021814	TGA	2	6	2531949	2531954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7137	NC_021814	GAG	2	6	2532975	2532980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7138	NC_021814	TAG	2	6	2534646	2534651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7140	NC_021814	GCA	2	6	2534678	2534683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7141	NC_021814	GT	3	6	2534732	2534737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7142	NC_021814	C	7	7	2534765	2534771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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7144	NC_021814	T	8	8	2534814	2534821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7150	NC_021814	GCC	2	6	2535406	2535411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7153	NC_021814	GCG	2	6	2536264	2536269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7156	NC_021814	C	6	6	2536335	2536340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7157	NC_021814	AAGA	2	8	2536355	2536362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7158	NC_021814	T	7	7	2536383	2536389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7164	NC_021814	TTG	2	6	2537078	2537083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7169	NC_021814	GATA	2	8	2539963	2539970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7173	NC_021814	TA	3	6	2540171	2540176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7256	NC_021814	TAA	2	6	2584067	2584072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7257	NC_021814	ACG	2	6	2584080	2584085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7264	NC_021814	AGT	2	6	2585142	2585147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7399	NC_021814	GA	3	6	2628766	2628771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7400	NC_021814	TGT	2	6	2629075	2629080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7401	NC_021814	TGTT	2	8	2629149	2629156	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7402	NC_021814	CGTC	2	8	2629170	2629177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7434	NC_021814	GTC	2	6	2653343	2653348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7439	NC_021814	T	8	8	2653523	2653530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7442	NC_021814	TTC	2	6	2653584	2653589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7497	NC_021814	TTA	2	6	2685810	2685815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7500	NC_021814	TTTA	2	8	2685856	2685863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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