MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 11958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021554	ATGTC	2	10	888715	888724	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4002	NC_021554	CAT	2	6	888744	888749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_021554	ACGC	2	8	888763	888770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_021554	AT	3	6	888779	888784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021554	GTT	2	6	890212	890217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021554	T	6	6	890296	890301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021554	GATA	2	8	890323	890330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021554	TTAT	2	8	890341	890348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021554	T	6	6	890359	890364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021554	A	6	6	890374	890379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021554	TGG	2	6	890387	890392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021554	ACA	2	6	890404	890409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_021554	ACA	2	6	890415	890420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_021554	ATTAA	2	10	890449	890458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021554	T	6	6	890478	890483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021554	GAT	2	6	890487	890492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021554	ATA	2	6	890496	890501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021554	TAAG	2	8	890523	890530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021554	CTT	2	6	890853	890858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_021554	TTG	2	6	890931	890936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021554	ATT	2	6	890958	890963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021554	TTG	2	6	890986	890991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021554	CAT	2	6	891041	891046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_021554	AATG	2	8	891053	891060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021554	ATTA	2	8	891090	891097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021554	ATT	2	6	891100	891105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021554	TAT	2	6	891111	891116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021554	AT	3	6	891115	891120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_021554	TTA	2	6	891138	891143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021554	AAGCAC	2	12	893349	893360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_021554	ATGATT	2	12	893455	893466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021554	TAA	2	6	893591	893596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021554	ATG	2	6	893609	893614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021554	CGA	2	6	894483	894488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_021554	AGG	2	6	895331	895336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021554	ATT	2	6	896673	896678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021554	AGG	2	6	896730	896735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021554	TGT	2	6	896741	896746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021554	TAA	2	6	897677	897682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021554	AACG	2	8	897707	897714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_021554	ATT	2	6	897731	897736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021554	ATAG	2	8	897778	897785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021554	GAA	2	6	897788	897793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021554	AGT	2	6	898545	898550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021554	ATA	2	6	898593	898598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021554	TA	3	6	898597	898602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021554	T	6	6	900839	900844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021554	AAGCA	2	10	900860	900869	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_021554	TA	3	6	900903	900908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021554	TGA	2	6	900916	900921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021554	TGA	2	6	900957	900962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021554	TA	3	6	900981	900986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021554	TA	3	6	900997	901002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_021554	ATGA	2	8	901038	901045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021554	CAA	2	6	901052	901057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_021554	AAT	2	6	901072	901077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021554	TGA	2	6	901082	901087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021554	TAAAAT	2	12	901112	901123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021554	A	6	6	901159	901164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021554	TTGA	2	8	905530	905537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021554	ATAGA	2	10	905569	905578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021554	TAA	2	6	905608	905613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021554	AAT	2	6	905614	905619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_021554	A	6	6	905672	905677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021554	TAA	2	6	905684	905689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021554	AAT	2	6	905699	905704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021554	TGT	2	6	905721	905726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021554	ATA	2	6	905732	905737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021554	GA	3	6	906024	906029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021554	TTA	2	6	906045	906050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021554	TAT	2	6	906054	906059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021554	ATAG	2	8	906061	906068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021554	ATA	2	6	906438	906443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021554	AT	3	6	907617	907622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021554	TCA	2	6	907661	907666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021554	A	6	6	907676	907681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021554	TTA	2	6	907702	907707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021554	TA	3	6	907706	907711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021554	T	7	7	907712	907718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021554	AAAT	2	8	907731	907738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021554	GTT	2	6	907787	907792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021554	CAT	2	6	907805	907810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_021554	AAG	2	6	907858	907863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021554	TC	3	6	907894	907899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_021554	TTA	2	6	908588	908593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021554	TTA	2	6	908600	908605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021554	A	6	6	908684	908689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021554	TTAA	2	8	908690	908697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021554	T	6	6	908698	908703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021554	CTGA	2	8	908710	908717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_021554	CTTG	2	8	908720	908727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_021554	T	6	6	908775	908780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021554	ATG	2	6	908828	908833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021554	GTT	2	6	908873	908878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021554	A	7	7	908903	908909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021554	ATT	2	6	910179	910184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021554	TTG	2	6	910222	910227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021554	AGG	2	6	910260	910265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021554	TTG	2	6	911842	911847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021554	TTCA	2	8	911926	911933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_021554	ACT	2	6	911941	911946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_021554	TTTAA	2	10	912002	912011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021554	ATT	2	6	912023	912028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021554	AAGA	2	8	912031	912038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021554	A	6	6	912048	912053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021554	ATT	2	6	912059	912064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021554	CT	4	8	915086	915093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_021554	ATT	3	9	915122	915130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021554	ATA	2	6	915134	915139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021554	AATTA	2	10	915158	915167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021554	AAG	2	6	915203	915208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021554	ACTAA	2	10	915214	915223	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4113	NC_021554	CAG	2	6	915260	915265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021554	ATC	2	6	915287	915292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_021554	CTG	2	6	915296	915301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_021554	TGT	2	6	915304	915309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021554	TA	3	6	915332	915337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021554	TGT	2	6	921107	921112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021554	CCT	2	6	921113	921118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_021554	A	6	6	921121	921126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021554	ATGA	2	8	921148	921155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021554	AC	3	6	921174	921179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_021554	TTG	2	6	921183	921188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021554	AAG	2	6	921215	921220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021554	TCC	2	6	921626	921631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_021554	AT	4	8	921647	921654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021554	ATG	2	6	922371	922376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021554	AT	3	6	922387	922392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021554	ATA	2	6	922436	922441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021554	TAA	2	6	922490	922495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021554	TTG	2	6	922541	922546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021554	GTA	2	6	922573	922578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021554	ATA	2	6	922597	922602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021554	CCA	2	6	922630	922635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_021554	ATA	2	6	922653	922658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_021554	TTA	2	6	922683	922688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_021554	TGAAA	2	10	923108	923117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4414	NC_021554	TTA	2	6	1004673	1004678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_021554	AAT	2	6	1004696	1004701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4441	NC_021554	TAA	2	6	1007752	1007757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4442	NC_021554	TAG	2	6	1007772	1007777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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