MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1

Total Repeats: 11137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021313	CGG	2	6	2938881	2938886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_021313	TTC	2	6	2939240	2939245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_021313	CGC	2	6	2939309	2939314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_021313	CGC	2	6	2939409	2939414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_021313	CGC	2	6	2939490	2939495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_021313	ACTC	2	8	2939604	2939611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_021313	TGC	2	6	2939655	2939660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_021313	CAT	2	6	2939746	2939751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_021313	TAATA	2	10	2939777	2939786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_021313	TTA	2	6	2939787	2939792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021313	AATT	2	8	2939908	2939915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021313	T	6	6	2939931	2939936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021313	CAG	2	6	2939944	2939949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_021313	CGGA	2	8	2949368	2949375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_021313	TG	3	6	2950604	2950609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021313	TTCG	2	8	2950634	2950641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10017	NC_021313	CGAT	2	8	2950663	2950670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10018	NC_021313	TCGT	2	8	2951439	2951446	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_021313	GTC	2	6	2951465	2951470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_021313	CCA	2	6	2951473	2951478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_021313	CGC	2	6	2951524	2951529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_021313	GTC	2	6	2951536	2951541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_021313	TGC	2	6	2951578	2951583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_021313	GGTC	2	8	2951587	2951594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_021313	GAA	2	6	2952460	2952465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_021313	GTC	2	6	2952470	2952475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_021313	GAT	2	6	2955143	2955148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_021313	GCG	2	6	2955179	2955184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_021313	GTG	2	6	2955198	2955203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021313	CGTG	2	8	2955245	2955252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_021313	CGG	2	6	2955279	2955284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_021313	GC	3	6	2955420	2955425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_021313	C	6	6	2955528	2955533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10034	NC_021313	CCG	2	6	2955563	2955568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_021313	GTC	2	6	2955601	2955606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_021313	CTT	2	6	2955623	2955628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_021313	GGAG	2	8	2955669	2955676	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_021313	GCC	2	6	2955707	2955712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_021313	TGC	2	6	2955779	2955784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_021313	GGC	2	6	2955840	2955845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_021313	GGTC	2	8	2955980	2955987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_021313	GAT	2	6	2955990	2955995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_021313	GGA	2	6	2956002	2956007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021313	CTG	2	6	2956011	2956016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_021313	ACG	2	6	2956069	2956074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_021313	GTC	3	9	2956075	2956083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_021313	CA	3	6	2956093	2956098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_021313	TAG	2	6	2956112	2956117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_021313	TCG	2	6	2956422	2956427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_021313	CTG	2	6	2956461	2956466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_021313	GCCG	2	8	2956480	2956487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_021313	GTGCG	2	10	2956504	2956513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10053	NC_021313	CGG	2	6	2956555	2956560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_021313	CGA	2	6	2956573	2956578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_021313	AAC	2	6	2958730	2958735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_021313	ATAA	2	8	2958757	2958764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021313	TAT	2	6	2958774	2958779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021313	TAC	2	6	2958823	2958828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_021313	AT	3	6	2958835	2958840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_021313	CAG	2	6	2958988	2958993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_021313	GCT	2	6	2959040	2959045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_021313	TGAGT	2	10	2959443	2959452	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_021313	CTT	2	6	2959457	2959462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_021313	TC	3	6	2959467	2959472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_021313	AAT	2	6	2959474	2959479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_021313	TGT	2	6	2959609	2959614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_021313	CCA	2	6	2959648	2959653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_021313	GTA	2	6	2959655	2959660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021313	TCA	2	6	2959676	2959681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_021313	CTT	2	6	2959749	2959754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_021313	CCT	2	6	2959783	2959788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_021313	GAA	2	6	2959852	2959857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_021313	AAT	2	6	2959893	2959898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_021313	TG	3	6	2959919	2959924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021313	TAG	2	6	2959928	2959933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_021313	ATT	2	6	2959949	2959954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_021313	ACC	2	6	2960002	2960007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_021313	GAT	2	6	2960021	2960026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021313	TTCA	2	8	2960093	2960100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10080	NC_021313	TA	4	8	2960135	2960142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021313	CCA	2	6	2960247	2960252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_021313	GC	3	6	2961019	2961024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10083	NC_021313	TCG	2	6	2961025	2961030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_021313	CTG	2	6	2961578	2961583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_021313	GGT	2	6	2961643	2961648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10089	NC_021313	CAA	2	6	2965585	2965590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_021313	TCC	2	6	2965595	2965600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_021313	ATT	2	6	2965602	2965607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_021313	TAT	2	6	2965613	2965618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_021313	TGC	2	6	2965703	2965708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_021313	GTT	2	6	2965717	2965722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_021313	TGCAAC	2	12	2965733	2965744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_021313	TAG	2	6	2965751	2965756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_021313	ATG	2	6	2965764	2965769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_021313	ACA	3	9	2965794	2965802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_021313	CAGCA	2	10	2965805	2965814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10100	NC_021313	TGC	2	6	2965871	2965876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_021313	TAAA	2	8	2965895	2965902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_021313	ACCG	2	8	2965939	2965946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_021313	GGT	2	6	2965956	2965961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_021313	CGCA	2	8	2966058	2966065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_021313	GGAG	2	8	2966080	2966087	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_021313	GCG	2	6	2966118	2966123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_021313	TTC	2	6	2966197	2966202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_021313	GT	3	6	2966243	2966248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_021313	ACGA	2	8	2966250	2966257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_021313	AGT	2	6	2966316	2966321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_021313	CAA	2	6	2966351	2966356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_021313	TGAC	2	8	2966444	2966451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_021313	AT	3	6	2966459	2966464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_021313	TAC	2	6	2966490	2966495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_021313	TCC	2	6	2966500	2966505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_021313	AT	3	6	2966596	2966601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021313	TGGCGA	2	12	2966658	2966669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10118	NC_021313	CATC	2	8	2966671	2966678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_021313	TCAGG	2	10	2966691	2966700	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10120	NC_021313	ATCT	2	8	2966778	2966785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_021313	TTA	2	6	2966857	2966862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021313	TA	3	6	2966882	2966887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_021313	TCG	2	6	2966929	2966934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_021313	TCT	2	6	2966943	2966948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_021313	AAT	2	6	2967070	2967075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_021313	TAT	2	6	2967104	2967109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_021313	ATT	2	6	2967193	2967198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_021313	AAC	2	6	2967264	2967269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_021313	CCG	2	6	2967505	2967510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10130	NC_021313	TCG	2	6	2967530	2967535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_021313	CCA	2	6	2967596	2967601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_021313	GTC	2	6	2967646	2967651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_021313	GCT	2	6	2967692	2967697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10136	NC_021313	CG	3	6	2969153	2969158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10137	NC_021313	CCG	2	6	2969180	2969185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10144	NC_021313	AAC	2	6	2971182	2971187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10152	NC_021313	GATT	2	8	2971390	2971397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10159	NC_021313	CTCG	2	8	2974700	2974707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10204	NC_021313	CGTC	2	8	2986865	2986872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10209	NC_021313	TC	3	6	2987490	2987495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10240	NC_021313	CGACT	2	10	2998895	2998904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10241	NC_021313	GCAC	2	8	2998926	2998933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10242	NC_021313	GGA	2	6	2998957	2998962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_021313	GAA	2	6	2998966	2998971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_021313	GGCCA	2	10	3000240	3000249	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10245	NC_021313	CA	3	6	3000248	3000253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10246	NC_021313	GCAC	2	8	3000254	3000261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10247	NC_021313	CAG	2	6	3000268	3000273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_021313	GTCGA	2	10	3002593	3002602	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10249	NC_021313	CTG	2	6	3002661	3002666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_021313	GTCC	2	8	3002703	3002710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10251	NC_021313	ACC	2	6	3002715	3002720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10252	NC_021313	TCG	2	6	3004961	3004966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_021313	ATC	2	6	3005026	3005031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_021313	TCGA	2	8	3006436	3006443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10255	NC_021313	GC	3	6	3006532	3006537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10256	NC_021313	CCG	2	6	3007235	3007240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10257	NC_021313	CGGA	2	8	3007757	3007764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10258	NC_021313	CCGG	2	8	3007786	3007793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10259	NC_021313	TCGGA	2	10	3008710	3008719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10260	NC_021313	AGA	2	6	3008732	3008737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10270	NC_021313	TCGA	2	8	3012491	3012498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10282	NC_021313	GGTTC	2	10	3021093	3021102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10290	NC_021313	CGA	2	6	3021496	3021501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10341	NC_021313	GTGC	2	8	3038453	3038460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10359	NC_021313	CGG	2	6	3044428	3044433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10362	NC_021313	ATCCG	2	10	3044844	3044853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10366	NC_021313	CGGG	2	8	3048236	3048243	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10367	NC_021313	CA	3	6	3048277	3048282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10368	NC_021313	GGT	2	6	3049277	3049282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10369	NC_021313	CGT	2	6	3049283	3049288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10372	NC_021313	GAAC	2	8	3053144	3053151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10373	NC_021313	TCG	2	6	3053187	3053192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10374	NC_021313	TGC	2	6	3053450	3053455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10376	NC_021313	GAC	2	6	3055181	3055186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10377	NC_021313	GCG	2	6	3055224	3055229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10379	NC_021313	CGC	2	6	3055274	3055279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10380	NC_021313	CAC	2	6	3055280	3055285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10381	NC_021313	CCGT	2	8	3057479	3057486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10382	NC_021313	CCG	2	6	3057504	3057509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10384	NC_021313	CGAT	2	8	3058683	3058690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10387	NC_021313	GTCT	2	8	3058850	3058857	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10485	NC_021313	ATTT	2	8	3083937	3083944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_021313	AGTA	2	8	3083953	3083960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10488	NC_021313	AATG	2	8	3084015	3084022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10493	NC_021313	CGC	2	6	3085012	3085017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10497	NC_021313	CTCGAC	2	12	3085124	3085135	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10498	NC_021313	GAG	2	6	3085151	3085156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_021313	GAC	2	6	3085169	3085174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_021313	CGA	2	6	3085180	3085185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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