MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 6021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021213	CTC	2	6	1321078	1321083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_021213	CAC	2	6	1321122	1321127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_021213	TCA	2	6	1321320	1321325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_021213	ACC	2	6	1321348	1321353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_021213	ATC	2	6	1321857	1321862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_021213	AC	3	6	1323559	1323564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_021213	TAT	2	6	1323634	1323639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021213	T	6	6	1323643	1323648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021213	A	6	6	1323662	1323667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021213	ACC	2	6	1323732	1323737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_021213	CAA	2	6	1324123	1324128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021213	TTGG	2	8	1324746	1324753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021213	CA	3	6	1324769	1324774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_021213	AAC	2	6	1324787	1324792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_021213	TAA	2	6	1324796	1324801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021213	TTC	2	6	1324825	1324830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_021213	AAT	2	6	1324846	1324851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021213	ACA	2	6	1326503	1326508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021213	TAA	2	6	1327524	1327529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021213	A	6	6	1327650	1327655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021213	TCC	2	6	1327713	1327718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_021213	ATCTC	2	10	1327722	1327731	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4023	NC_021213	TGAT	2	8	1327797	1327804	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021213	AAGT	2	8	1327820	1327827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021213	TGG	2	6	1327892	1327897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021213	ACG	2	6	1327915	1327920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021213	CAC	2	6	1327982	1327987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_021213	TAC	2	6	1328011	1328016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021213	TTC	2	6	1328017	1328022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_021213	GAT	2	6	1328031	1328036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021213	CATC	2	8	1328044	1328051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_021213	CTT	2	6	1328153	1328158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_021213	TTTC	2	8	1328175	1328182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_021213	AAC	2	6	1329635	1329640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_021213	ATT	2	6	1332357	1332362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021213	A	6	6	1332381	1332386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021213	TAA	2	6	1332389	1332394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021213	AAT	2	6	1332439	1332444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021213	CTT	2	6	1332463	1332468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_021213	T	8	8	1332559	1332566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021213	ATCA	2	8	1337440	1337447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_021213	CTAT	2	8	1337472	1337479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_021213	ATTG	2	8	1338571	1338578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021213	CAAA	2	8	1338579	1338586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_021213	GAA	2	6	1338614	1338619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021213	TTTTCA	2	12	1338825	1338836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4047	NC_021213	AG	3	6	1339501	1339506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021213	ATTT	2	8	1339732	1339739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021213	T	6	6	1339737	1339742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021213	ATA	2	6	1339752	1339757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021213	ACAA	2	8	1339828	1339835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_021213	GTA	2	6	1339854	1339859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4054	NC_021213	CAG	2	6	1339884	1339889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4056	NC_021213	A	6	6	1339945	1339950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021213	CTC	2	6	1339962	1339967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_021213	TAT	2	6	1340205	1340210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021213	A	6	6	1340214	1340219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021213	AT	3	6	1340287	1340292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_021213	TCT	2	6	1340374	1340379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_021213	CT	3	6	1340378	1340383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_021213	TCGC	2	8	1341244	1341251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4067	NC_021213	TCC	2	6	1341598	1341603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_021213	TA	3	6	1341620	1341625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021213	ATT	2	6	1341726	1341731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021213	TCT	2	6	1341789	1341794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021213	GCT	2	6	1341796	1341801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4073	NC_021213	TCA	2	6	1341995	1342000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4076	NC_021213	ATCT	2	8	1342060	1342067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4078	NC_021213	TAT	2	6	1342108	1342113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021213	CAT	2	6	1342624	1342629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4081	NC_021213	CAT	3	9	1342689	1342697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_021213	AAT	2	6	1342699	1342704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021213	T	7	7	1342729	1342735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_021213	TAA	2	6	1342818	1342823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021213	TTC	2	6	1342913	1342918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_021213	TGA	2	6	1343419	1343424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021213	T	6	6	1343425	1343430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021213	TATT	2	8	1343478	1343485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021213	CAT	2	6	1343532	1343537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4093	NC_021213	TTA	2	6	1344243	1344248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021213	AT	3	6	1344265	1344270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021213	CCT	2	6	1344296	1344301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_021213	TAT	2	6	1344304	1344309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021213	TAT	2	6	1344317	1344322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021213	ATA	2	6	1344329	1344334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021213	TAC	2	6	1344348	1344353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_021213	CAA	2	6	1344362	1344367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_021213	TTGT	2	8	1344401	1344408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021213	T	7	7	1344434	1344440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021213	TAC	2	6	1344654	1344659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4107	NC_021213	CCT	2	6	1346703	1346708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_021213	TAC	2	6	1346760	1346765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_021213	TGATA	2	10	1346780	1346789	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021213	GCCTT	2	10	1347563	1347572	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4111	NC_021213	TTGGT	2	10	1347609	1347618	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021213	T	6	6	1347633	1347638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021213	TAA	2	6	1347649	1347654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021213	TAA	2	6	1347703	1347708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021213	ACC	2	6	1347709	1347714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_021213	TGTT	2	8	1347734	1347741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_021213	T	6	6	1348021	1348026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021213	A	8	8	1348028	1348035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_021213	GATA	2	8	1348070	1348077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021213	AGATTA	2	12	1348110	1348121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_021213	T	6	6	1351758	1351763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021213	AGT	2	6	1353341	1353346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021213	GTC	2	6	1353350	1353355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_021213	CATT	2	8	1353793	1353800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_021213	CTTT	2	8	1353810	1353817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4142	NC_021213	GTAT	2	8	1355125	1355132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_021213	TAT	2	6	1355140	1355145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4147	NC_021213	A	6	6	1360401	1360406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_021213	A	6	6	1362595	1362600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_021213	A	6	6	1362645	1362650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4173	NC_021213	TATT	2	8	1367742	1367749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4233	NC_021213	CTG	2	6	1385799	1385804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_021213	TAG	2	6	1396167	1396172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_021213	GATA	2	8	1396217	1396224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_021213	TC	3	6	1397147	1397152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_021213	TTTTC	2	10	1397179	1397188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4261	NC_021213	T	6	6	1397210	1397215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_021213	GAG	2	6	1398891	1398896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_021213	GTT	2	6	1399013	1399018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4271	NC_021213	ATT	2	6	1399167	1399172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_021213	A	6	6	1457179	1457184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_021213	TAT	2	6	1457334	1457339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4422	NC_021213	CTT	2	6	1469718	1469723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4432	NC_021213	A	6	6	1472091	1472096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4442	NC_021213	TAC	2	6	1475921	1475926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4444	NC_021213	GTTT	2	8	1475978	1475985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_021213	TATTC	2	10	1475991	1476000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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