MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 6021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021213	AAAT	2	8	281587	281594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021213	ATAA	2	8	281616	281623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021213	AGT	2	6	281684	281689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021213	TAA	2	6	281695	281700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021213	TAG	2	6	281755	281760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021213	GGT	2	6	281768	281773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021213	TAT	2	6	282185	282190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021213	GCA	2	6	282201	282206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021213	GATT	2	8	282277	282284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021213	AGG	2	6	282332	282337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021213	TTG	2	6	282450	282455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021213	A	6	6	282897	282902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021213	TAT	2	6	282937	282942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021213	TAT	2	6	284517	284522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021213	T	7	7	284566	284572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021213	GATT	2	8	284590	284597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021213	CAAC	2	8	284601	284608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_021213	AAG	2	6	284613	284618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021213	CCA	2	6	284635	284640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_021213	CTA	2	6	285390	285395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021213	TAT	2	6	285443	285448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021213	GTT	2	6	285462	285467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021213	A	8	8	285472	285479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021213	TCG	2	6	286372	286377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021213	TCTGC	2	10	286420	286429	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_021213	A	6	6	286464	286469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021213	GGGA	2	8	288032	288039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021213	T	7	7	288049	288055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021213	TAGT	2	8	288113	288120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021213	GGA	2	6	288759	288764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021213	AAG	2	6	289016	289021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021213	ATC	2	6	291590	291595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021213	TTTAG	2	10	291684	291693	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021213	AAT	2	6	291716	291721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021213	GAA	2	6	291747	291752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021213	T	6	6	291816	291821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021213	T	6	6	291836	291841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021213	A	6	6	291865	291870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021213	A	6	6	291888	291893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021213	TATC	2	8	293813	293820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_021213	A	6	6	294196	294201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021213	TGT	2	6	294236	294241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021213	TAT	2	6	294406	294411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021213	T	6	6	294684	294689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021213	GTAAA	2	10	294690	294699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021213	T	6	6	294713	294718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021213	A	6	6	294720	294725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021213	A	6	6	294778	294783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021213	A	6	6	294787	294792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021213	CA	4	8	294803	294810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_021213	TA	5	10	294811	294820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021213	ATT	2	6	294842	294847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021213	TAA	2	6	294848	294853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021213	TCTGC	2	10	295611	295620	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_021213	A	6	6	295628	295633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021213	ATAAA	2	10	295646	295655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021213	T	6	6	296982	296987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021213	A	7	7	297000	297006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021213	CTT	2	6	297025	297030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021213	GAAT	2	8	297043	297050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021213	GTT	2	6	298129	298134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021213	AAG	2	6	298183	298188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021213	AATG	2	8	298194	298201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021213	TAC	2	6	298226	298231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021213	A	7	7	298241	298247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021213	AGAA	2	8	298298	298305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021213	T	6	6	298337	298342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021213	CAAA	2	8	298346	298353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_021213	A	6	6	298418	298423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021213	A	6	6	298428	298433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021213	AAATA	2	10	298452	298461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021213	A	6	6	298461	298466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021213	TAG	2	6	298467	298472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021213	GGA	2	6	298517	298522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021213	TCG	2	6	301197	301202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021213	A	6	6	301267	301272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021213	TAGG	2	8	301276	301283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021213	TTGT	2	8	301381	301388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021213	TGG	2	6	301399	301404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021213	TCTA	2	8	301466	301473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_021213	TAGAA	2	10	301502	301511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021213	A	6	6	301510	301515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021213	T	6	6	301520	301525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021213	GTTT	2	8	303061	303068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021213	TGC	2	6	303075	303080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021213	TTAAA	2	10	303081	303090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021213	TA	3	6	303120	303125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021213	TAG	2	6	310525	310530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021213	TA	3	6	310532	310537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021213	GTTT	2	8	310695	310702	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021213	GT	3	6	310820	310825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021213	TAG	2	6	310852	310857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021213	GTA	2	6	310885	310890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021213	CAA	2	6	315050	315055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_021213	A	6	6	315067	315072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021213	AAAG	2	8	318615	318622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021213	CCA	2	6	318638	318643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_021213	ATA	2	6	318648	318653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021213	TAGAAA	2	12	318686	318697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021213	TAGCCG	2	12	318725	318736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_021213	ATAAA	2	10	318819	318828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021213	AGA	2	6	318838	318843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021213	T	6	6	320500	320505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021213	GGA	2	6	321254	321259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021213	T	7	7	321268	321274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021213	AT	3	6	321283	321288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021213	TA	3	6	321306	321311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021213	ACA	2	6	321352	321357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021213	T	6	6	321688	321693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021213	TCAG	2	8	321704	321711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_021213	CAA	2	6	321739	321744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021213	T	6	6	322205	322210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021213	T	6	6	322233	322238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021213	TA	3	6	322255	322260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021213	TG	3	6	322329	322334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021213	GAT	2	6	322423	322428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021213	AGA	2	6	323476	323481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021213	C	6	6	323997	324002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1119	NC_021213	A	7	7	324003	324009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021213	AGT	2	6	324032	324037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021213	A	6	6	324139	324144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021213	ATGA	2	8	324169	324176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021213	AC	3	6	324203	324208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_021213	TTC	2	6	326045	326050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021213	CTC	2	6	326068	326073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_021213	GCCTA	2	10	326104	326113	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1127	NC_021213	T	6	6	326155	326160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021213	TCT	2	6	326191	326196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_021213	CTT	2	6	326250	326255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021213	TAG	2	6	326262	326267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021213	CCT	2	6	326463	326468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_021213	GT	3	6	326470	326475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021213	AC	3	6	326479	326484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_021213	ACT	2	6	327711	327716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021213	CTTT	2	8	327856	327863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_021213	A	7	7	327869	327875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021213	TCA	2	6	330017	330022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_021213	TCG	2	6	330023	330028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_021213	TAAAAC	2	12	330056	330067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1273	NC_021213	AAGAC	2	10	369961	369970	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1279	NC_021213	GTGA	2	8	370505	370512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_021213	TGT	2	6	370538	370543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1282	NC_021213	AGA	2	6	370559	370564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1286	NC_021213	GGA	2	6	370811	370816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_021213	ATA	2	6	383903	383908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_021213	AGG	2	6	390692	390697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021213	GTGGGA	2	12	393379	393390	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_021213	CAA	2	6	393419	393424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_021213	GTT	2	6	393438	393443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_021213	C	6	6	393482	393487	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1419	NC_021213	AAC	2	6	393585	393590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_021213	AGGG	2	8	393632	393639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_021213	TCC	2	6	393653	393658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1430	NC_021213	TAA	2	6	396952	396957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_021213	TAT	2	6	402577	402582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_021213	CTT	2	6	402601	402606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_021213	GAG	2	6	404725	404730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_021213	TAT	2	6	405499	405504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1454	NC_021213	ATA	2	6	405525	405530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_021213	A	6	6	413159	413164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1468	NC_021213	T	7	7	415617	415623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1473	NC_021213	ATT	2	6	419563	419568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1474	NC_021213	TA	3	6	419583	419588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1475	NC_021213	TA	3	6	419654	419659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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