MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021176	T	6	6	4701783	4701788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_021176	TCT	2	6	4701794	4701799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_021176	T	7	7	4701805	4701811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_021176	TAA	2	6	4701817	4701822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_021176	CAA	2	6	4701831	4701836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_021176	TGG	2	6	4701851	4701856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_021176	TCA	2	6	4701863	4701868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_021176	AT	3	6	4701936	4701941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_021176	TTG	2	6	4701964	4701969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_021176	CCT	2	6	4702008	4702013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16011	NC_021176	GAA	2	6	4703919	4703924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_021176	ATC	2	6	4703933	4703938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_021176	AC	3	6	4703956	4703961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16014	NC_021176	GAT	2	6	4704034	4704039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_021176	GTTGA	2	10	4704066	4704075	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_021176	T	7	7	4704298	4704304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_021176	A	6	6	4704389	4704394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_021176	ACG	2	6	4705054	4705059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_021176	AAG	2	6	4705071	4705076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_021176	TGA	2	6	4705173	4705178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_021176	CAG	2	6	4705180	4705185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_021176	TTATCT	2	12	4705211	4705222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16023	NC_021176	TAAA	2	8	4705229	4705236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_021176	A	6	6	4705255	4705260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_021176	AAG	2	6	4705262	4705267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_021176	T	6	6	4705343	4705348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_021176	GGA	2	6	4705366	4705371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_021176	TCAG	2	8	4706308	4706315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16029	NC_021176	ATC	2	6	4706321	4706326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_021176	T	6	6	4706355	4706360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_021176	T	7	7	4706374	4706380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_021176	TGA	2	6	4706383	4706388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_021176	AAT	2	6	4706401	4706406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_021176	ATC	2	6	4706444	4706449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_021176	GA	4	8	4706483	4706490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_021176	T	6	6	4706514	4706519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_021176	CGG	2	6	4706522	4706527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_021176	TAA	2	6	4706546	4706551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_021176	GGA	2	6	4706568	4706573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_021176	AG	3	6	4707656	4707661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_021176	GTT	2	6	4707698	4707703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_021176	TGT	2	6	4707773	4707778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_021176	CCTTT	2	10	4707833	4707842	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16044	NC_021176	ATT	2	6	4707872	4707877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_021176	GTTG	2	8	4707883	4707890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16047	NC_021176	CGG	2	6	4709837	4709842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_021176	GCC	2	6	4709869	4709874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16049	NC_021176	CCA	2	6	4709888	4709893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16051	NC_021176	TGC	2	6	4710055	4710060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_021176	TTA	2	6	4710106	4710111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_021176	GC	3	6	4710125	4710130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16054	NC_021176	AT	3	6	4710145	4710150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_021176	GTT	2	6	4710180	4710185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_021176	A	6	6	4710205	4710210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_021176	TGATAT	2	12	4710292	4710303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_021176	T	6	6	4710307	4710312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_021176	TTG	2	6	4710408	4710413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_021176	TTG	2	6	4710519	4710524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_021176	G	6	6	4710570	4710575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_021176	TGA	2	6	4711096	4711101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_021176	TAA	2	6	4711183	4711188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_021176	T	6	6	4711196	4711201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_021176	GT	3	6	4711222	4711227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_021176	GGC	2	6	4712958	4712963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16070	NC_021176	GTAT	2	8	4715446	4715453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16073	NC_021176	A	6	6	4715546	4715551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_021176	AAAT	2	8	4715603	4715610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16079	NC_021176	AATT	2	8	4715728	4715735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16085	NC_021176	AAT	2	6	4715810	4715815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_021176	GGC	2	6	4715830	4715835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16089	NC_021176	ATGG	2	8	4715907	4715914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_021176	TA	3	6	4715962	4715967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_021176	ATA	2	6	4715970	4715975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_021176	ATA	2	6	4717379	4717384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_021176	AAGAA	2	10	4717413	4717422	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_021176	ATTAA	2	10	4717477	4717486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_021176	A	6	6	4718852	4718857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_021176	GAT	2	6	4718863	4718868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_021176	A	6	6	4720145	4720150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_021176	ATG	2	6	4720174	4720179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_021176	CAGG	2	8	4720213	4720220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16100	NC_021176	ACAG	2	8	4720285	4720292	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16101	NC_021176	TAA	2	6	4720440	4720445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_021176	GC	3	6	4720459	4720464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16103	NC_021176	TCG	2	6	4720530	4720535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16106	NC_021176	CTA	2	6	4721701	4721706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_021176	AAT	2	6	4721796	4721801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_021176	GA	3	6	4721896	4721901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_021176	GCTG	2	8	4721930	4721937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16110	NC_021176	GAA	2	6	4721958	4721963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_021176	GCCA	2	8	4721976	4721983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16112	NC_021176	TCGC	2	8	4722040	4722047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16113	NC_021176	TAT	2	6	4722048	4722053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_021176	CAT	2	6	4722123	4722128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_021176	TCA	2	6	4722139	4722144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_021176	GC	3	6	4722292	4722297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_021176	TCC	2	6	4722327	4722332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16118	NC_021176	ATC	2	6	4722348	4722353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_021176	CG	3	6	4722361	4722366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16120	NC_021176	GCG	2	6	4722375	4722380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_021176	GGC	2	6	4722413	4722418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16123	NC_021176	A	6	6	4722438	4722443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_021176	TCG	2	6	4722475	4722480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_021176	CGG	2	6	4722559	4722564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_021176	GAAGGT	2	12	4722632	4722643	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_021176	GTC	2	6	4722683	4722688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_021176	GGC	2	6	4722759	4722764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16130	NC_021176	TTC	2	6	4722849	4722854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16388	NC_021176	CTC	2	6	4789294	4789299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16389	NC_021176	GAT	2	6	4789355	4789360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16390	NC_021176	TCA	2	6	4789397	4789402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16391	NC_021176	AGC	2	6	4789558	4789563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16392	NC_021176	TGA	2	6	4789573	4789578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16393	NC_021176	AGC	2	6	4789605	4789610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16394	NC_021176	T	6	6	4789621	4789626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16395	NC_021176	CAA	2	6	4789677	4789682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16396	NC_021176	AGG	2	6	4789798	4789803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16397	NC_021176	CCTG	2	8	4790667	4790674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16398	NC_021176	CAA	2	6	4790755	4790760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16399	NC_021176	CAT	2	6	4790761	4790766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16400	NC_021176	TAA	2	6	4790872	4790877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16401	NC_021176	AT	3	6	4790895	4790900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16402	NC_021176	TGA	2	6	4790929	4790934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16403	NC_021176	ATC	2	6	4790936	4790941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16404	NC_021176	TCA	2	6	4790960	4790965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16405	NC_021176	TAA	2	6	4791003	4791008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16406	NC_021176	TAAAT	2	10	4791040	4791049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16407	NC_021176	TAAA	2	8	4791055	4791062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16408	NC_021176	CAG	2	6	4791063	4791068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16409	NC_021176	ATA	2	6	4791953	4791958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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