MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021176	TAA	2	6	4073251	4073256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_021176	TG	3	6	4073267	4073272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_021176	ATTA	2	8	4073277	4073284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_021176	ACA	2	6	4073344	4073349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_021176	TTA	2	6	4073431	4073436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_021176	T	6	6	4073474	4073479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_021176	T	6	6	4073562	4073567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_021176	CAG	2	6	4073631	4073636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_021176	TGA	3	9	4073674	4073682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_021176	TAC	2	6	4073689	4073694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_021176	CTTC	2	8	4073722	4073729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14012	NC_021176	GCG	2	6	4073730	4073735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_021176	CG	3	6	4073734	4073739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_021176	CGCT	2	8	4073749	4073756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_021176	CTT	2	6	4073779	4073784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_021176	CGG	2	6	4073818	4073823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_021176	CGG	2	6	4073859	4073864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_021176	AC	3	6	4079359	4079364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14019	NC_021176	CCG	2	6	4079367	4079372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_021176	GAA	2	6	4079993	4079998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_021176	GAG	2	6	4079999	4080004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_021176	TTG	2	6	4081083	4081088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_021176	T	7	7	4081091	4081097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_021176	ACT	2	6	4081139	4081144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_021176	CG	3	6	4081154	4081159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14026	NC_021176	AGAAA	2	10	4081167	4081176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_021176	TGT	2	6	4081180	4081185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_021176	CTT	2	6	4082986	4082991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_021176	TTG	2	6	4083733	4083738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_021176	CCG	2	6	4083766	4083771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_021176	ATA	2	6	4083773	4083778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_021176	AAAT	2	8	4085913	4085920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_021176	AAT	2	6	4085933	4085938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_021176	AAAG	2	8	4085945	4085952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_021176	GCC	2	6	4085980	4085985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14036	NC_021176	TCC	2	6	4088202	4088207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14037	NC_021176	TGA	2	6	4088211	4088216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_021176	GGA	2	6	4088234	4088239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_021176	TAT	2	6	4088272	4088277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_021176	T	6	6	4088926	4088931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_021176	TAT	2	6	4088955	4088960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_021176	ACA	2	6	4088989	4088994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_021176	GCA	2	6	4089429	4089434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_021176	TTAAG	2	10	4090345	4090354	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_021176	TCA	2	6	4090367	4090372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_021176	T	7	7	4090373	4090379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_021176	TA	3	6	4090390	4090395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_021176	TGT	2	6	4093673	4093678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_021176	TG	3	6	4093712	4093717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_021176	GAT	2	6	4093778	4093783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_021176	GTT	2	6	4093812	4093817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_021176	GTTTT	2	10	4094757	4094766	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_021176	T	6	6	4094763	4094768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_021176	GCT	2	6	4094791	4094796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_021176	TCGCT	2	10	4094821	4094830	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14056	NC_021176	ATA	2	6	4094906	4094911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_021176	TGC	2	6	4094938	4094943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_021176	TAGC	2	8	4094955	4094962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14059	NC_021176	AAT	2	6	4094964	4094969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_021176	AC	3	6	4095000	4095005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14061	NC_021176	AAC	2	6	4095008	4095013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_021176	AAT	2	6	4095017	4095022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_021176	CGG	2	6	4095484	4095489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_021176	AGC	2	6	4095544	4095549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_021176	GC	4	8	4095567	4095574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_021176	ACTT	2	8	4096196	4096203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14067	NC_021176	GCC	2	6	4096232	4096237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_021176	GGT	2	6	4096271	4096276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_021176	CAGG	2	8	4096764	4096771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14070	NC_021176	T	6	6	4096786	4096791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_021176	TTA	2	6	4096807	4096812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_021176	T	6	6	4096814	4096819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_021176	AAC	2	6	4096820	4096825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_021176	GCA	2	6	4096864	4096869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14076	NC_021176	T	8	8	4096935	4096942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_021176	ATATT	2	10	4096966	4096975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_021176	TTA	2	6	4097009	4097014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_021176	TGC	2	6	4097024	4097029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14082	NC_021176	CCGC	2	8	4098272	4098279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14083	NC_021176	CGGG	2	8	4098284	4098291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14084	NC_021176	ACC	2	6	4102131	4102136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_021176	GAA	2	6	4102137	4102142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_021176	GAT	2	6	4102151	4102156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14088	NC_021176	GCCA	2	8	4102439	4102446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14089	NC_021176	CTTTT	2	10	4102498	4102507	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14090	NC_021176	TC	3	6	4102531	4102536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14091	NC_021176	T	7	7	4102552	4102558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_021176	TAA	2	6	4102560	4102565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_021176	A	6	6	4102564	4102569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_021176	CATGT	2	10	4102591	4102600	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14095	NC_021176	AG	3	6	4102649	4102654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_021176	GCGCT	2	10	4103997	4104006	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14097	NC_021176	GTC	2	6	4107992	4107997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14099	NC_021176	ATG	3	9	4108041	4108049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_021176	T	6	6	4108051	4108056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_021176	AAC	2	6	4108109	4108114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_021176	GAG	2	6	4113983	4113988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_021176	TTG	2	6	4113993	4113998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_021176	TGT	2	6	4114165	4114170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_021176	GAAA	2	8	4114747	4114754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_021176	T	7	7	4114770	4114776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_021176	AAG	2	6	4114782	4114787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_021176	GAATGA	2	12	4114799	4114810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_021176	TTA	2	6	4114811	4114816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_021176	T	9	9	4114910	4114918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_021176	GTGCTC	2	12	4114963	4114974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_021176	GC	3	6	4115005	4115010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14113	NC_021176	ATC	2	6	4115147	4115152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_021176	CTC	2	6	4116218	4116223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14115	NC_021176	T	6	6	4116238	4116243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_021176	CGGA	2	8	4116278	4116285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14117	NC_021176	TTA	2	6	4117065	4117070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_021176	CCAT	2	8	4117077	4117084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_021176	AGC	2	6	4117112	4117117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_021176	GTT	2	6	4117228	4117233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_021176	CGC	2	6	4117266	4117271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14122	NC_021176	ATA	2	6	4117306	4117311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_021176	CACG	2	8	4117338	4117345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14124	NC_021176	CGT	2	6	4118444	4118449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_021176	CAC	2	6	4118548	4118553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_021176	TTG	2	6	4120401	4120406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_021176	T	7	7	4120488	4120494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_021176	GCT	2	6	4120740	4120745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14130	NC_021176	A	6	6	4120810	4120815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14263	NC_021176	GGT	2	6	4194561	4194566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14391	NC_021176	TGC	2	6	4243187	4243192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14392	NC_021176	GTC	2	6	4243199	4243204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14393	NC_021176	TTG	2	6	4243260	4243265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14394	NC_021176	CCGG	2	8	4243274	4243281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14395	NC_021176	GGA	2	6	4243312	4243317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14400	NC_021176	GTAG	2	8	4243573	4243580	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14477	NC_021176	TTTTGA	2	12	4249273	4249284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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14486	NC_021176	GCGCT	2	10	4255178	4255187	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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