MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021176	AGC	3	9	3772148	3772156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_021176	AAC	2	6	3772235	3772240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_021176	CAT	2	6	3772299	3772304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_021176	CGG	2	6	3772314	3772319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_021176	GCC	2	6	3772356	3772361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_021176	GTG	2	6	3772363	3772368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_021176	TGC	2	6	3772442	3772447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_021176	GCA	2	6	3772554	3772559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_021176	CAG	2	6	3772588	3772593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_021176	CCT	2	6	3772731	3772736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_021176	GCC	2	6	3772764	3772769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13012	NC_021176	AAC	2	6	3772778	3772783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_021176	GAT	2	6	3772935	3772940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_021176	T	6	6	3773746	3773751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_021176	TTAAA	2	10	3773764	3773773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021176	CTGGT	2	10	3775184	3775193	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13017	NC_021176	T	6	6	3775210	3775215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_021176	TCA	2	6	3775226	3775231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_021176	TCA	2	6	3775259	3775264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_021176	AAC	2	6	3775297	3775302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_021176	CGT	2	6	3776473	3776478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_021176	ATT	2	6	3778394	3778399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_021176	GCGCT	2	10	3779978	3779987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13024	NC_021176	A	7	7	3780799	3780805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021176	CA	3	6	3780810	3780815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_021176	CCT	2	6	3780862	3780867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_021176	G	6	6	3782245	3782250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_021176	TAAC	2	8	3782259	3782266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_021176	T	6	6	3782843	3782848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_021176	ACA	2	6	3785948	3785953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_021176	TGC	2	6	3785977	3785982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_021176	GGC	2	6	3785988	3785993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_021176	TTG	2	6	3787441	3787446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_021176	A	7	7	3787451	3787457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_021176	GC	3	6	3787521	3787526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_021176	TTA	2	6	3789811	3789816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021176	ACG	3	9	3789850	3789858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_021176	GAC	2	6	3789870	3789875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_021176	TAG	2	6	3789882	3789887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021176	TAA	2	6	3790060	3790065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_021176	AGC	2	6	3790137	3790142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_021176	T	6	6	3790267	3790272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_021176	GC	3	6	3790279	3790284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13044	NC_021176	GAA	2	6	3790355	3790360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_021176	AGA	2	6	3790373	3790378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021176	CAA	2	6	3790554	3790559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_021176	TTC	2	6	3793523	3793528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_021176	TTTAC	2	10	3793681	3793690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13049	NC_021176	CGG	2	6	3793695	3793700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_021176	AGA	2	6	3793711	3793716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_021176	TTC	2	6	3793756	3793761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_021176	CGC	2	6	3793803	3793808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_021176	GGCG	2	8	3793889	3793896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13054	NC_021176	CAG	2	6	3793939	3793944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_021176	AGAC	2	8	3793997	3794004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_021176	GC	3	6	3794102	3794107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_021176	CG	3	6	3794126	3794131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_021176	GTT	2	6	3794142	3794147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_021176	GCGG	2	8	3794195	3794202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13060	NC_021176	GAT	2	6	3794221	3794226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021176	CTG	2	6	3794260	3794265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_021176	CTGC	2	8	3797836	3797843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_021176	GCAG	2	8	3797847	3797854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13064	NC_021176	AATTA	2	10	3800349	3800358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021176	CAT	2	6	3800360	3800365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_021176	TAA	2	6	3800462	3800467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_021176	T	6	6	3800566	3800571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_021176	CAA	2	6	3801493	3801498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_021176	T	6	6	3801517	3801522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_021176	CGA	2	6	3801564	3801569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_021176	CTC	2	6	3801584	3801589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_021176	CGG	2	6	3801599	3801604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_021176	TCA	2	6	3801628	3801633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_021176	CGT	2	6	3804999	3805004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_021176	GCC	2	6	3807789	3807794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_021176	TTG	2	6	3807818	3807823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_021176	TGG	2	6	3807825	3807830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021176	TG	3	6	3808891	3808896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_021176	CAG	2	6	3808899	3808904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_021176	CGG	2	6	3808975	3808980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_021176	GCA	2	6	3808994	3808999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_021176	GCA	2	6	3809012	3809017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_021176	CAG	3	9	3809043	3809051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_021176	CG	4	8	3809061	3809068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_021176	TCA	2	6	3809108	3809113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_021176	GCG	2	6	3809162	3809167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_021176	GGGC	2	8	3809170	3809177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13088	NC_021176	GTC	2	6	3809250	3809255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_021176	CGA	2	6	3809273	3809278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_021176	AAT	2	6	3809313	3809318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_021176	CAG	2	6	3809388	3809393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_021176	ATG	2	6	3809419	3809424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_021176	CGC	2	6	3809440	3809445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_021176	CCT	2	6	3809470	3809475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_021176	CAA	2	6	3809521	3809526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_021176	ATGTG	2	10	3809532	3809541	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_021176	GC	3	6	3809549	3809554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_021176	AT	3	6	3809580	3809585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_021176	AAAT	2	8	3814047	3814054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_021176	ATT	2	6	3814102	3814107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_021176	CAAT	2	8	3814113	3814120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13102	NC_021176	ATG	2	6	3814125	3814130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021176	A	7	7	3814164	3814170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_021176	TAAT	2	8	3814178	3814185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_021176	ACG	2	6	3816905	3816910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_021176	AGG	2	6	3816928	3816933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_021176	GAC	2	6	3816940	3816945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_021176	GTGGC	2	10	3821907	3821916	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13109	NC_021176	ATG	2	6	3821978	3821983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_021176	T	6	6	3823563	3823568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_021176	ATC	2	6	3823569	3823574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_021176	TCAT	2	8	3823577	3823584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13113	NC_021176	GTTG	2	8	3823587	3823594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021176	ATG	2	6	3823606	3823611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_021176	A	8	8	3823727	3823734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021176	ATG	2	6	3823837	3823842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_021176	CTT	2	6	3824384	3824389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_021176	CCTTG	2	10	3824841	3824850	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13119	NC_021176	T	6	6	3824872	3824877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021176	TA	3	6	3824957	3824962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_021176	GAAGA	2	10	3825014	3825023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_021176	T	6	6	3826841	3826846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_021176	GTC	2	6	3827126	3827131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_021176	GGC	2	6	3827230	3827235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_021176	ATG	2	6	3831200	3831205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_021176	T	6	6	3831288	3831293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_021176	T	7	7	3831301	3831307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021176	TTA	2	6	3832271	3832276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13131	NC_021176	GTC	2	6	3832396	3832401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13249	NC_021176	A	6	6	3872872	3872877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_021176	T	6	6	3872893	3872898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13500	NC_021176	TAGC	2	8	3918085	3918092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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