MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021176	CGT	2	6	3665122	3665127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_021176	GTC	2	6	3665143	3665148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_021176	TAC	2	6	3665222	3665227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_021176	GAG	2	6	3665251	3665256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_021176	CCG	2	6	3665273	3665278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_021176	GC	3	6	3665315	3665320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_021176	GAA	2	6	3665373	3665378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_021176	CTG	2	6	3665422	3665427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_021176	ACA	2	6	3665475	3665480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_021176	CGCC	2	8	3665526	3665533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12511	NC_021176	TTA	2	6	3665550	3665555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_021176	CAG	2	6	3665632	3665637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_021176	TCG	2	6	3665642	3665647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_021176	GCC	2	6	3665650	3665655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_021176	TCGA	2	8	3665665	3665672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12516	NC_021176	GGC	2	6	3665718	3665723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_021176	A	6	6	3665761	3665766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_021176	ACG	2	6	3665795	3665800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_021176	AAAC	2	8	3665808	3665815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12520	NC_021176	A	6	6	3665853	3665858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_021176	TAATC	2	10	3665860	3665869	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12522	NC_021176	CG	3	6	3667754	3667759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_021176	ATA	2	6	3667760	3667765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_021176	TCA	2	6	3667778	3667783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_021176	A	7	7	3667790	3667796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_021176	AATA	2	8	3667827	3667834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_021176	ATTTA	2	10	3668534	3668543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_021176	GTT	2	6	3668554	3668559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12530	NC_021176	CAA	2	6	3668710	3668715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_021176	TTATAT	2	12	3668735	3668746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_021176	AT	3	6	3668773	3668778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_021176	AAC	2	6	3668800	3668805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_021176	AAT	2	6	3668808	3668813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_021176	ATG	2	6	3668922	3668927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_021176	T	6	6	3668998	3669003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_021176	CGG	2	6	3669057	3669062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_021176	A	6	6	3669132	3669137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_021176	GCA	2	6	3671035	3671040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12541	NC_021176	GCC	2	6	3671118	3671123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12542	NC_021176	CGA	2	6	3671160	3671165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_021176	TCC	2	6	3672030	3672035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_021176	GC	3	6	3672101	3672106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_021176	T	7	7	3672117	3672123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_021176	GAC	2	6	3672155	3672160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12549	NC_021176	AGGT	2	8	3672251	3672258	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_021176	T	6	6	3672269	3672274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_021176	AAG	2	6	3672295	3672300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_021176	TGG	2	6	3675179	3675184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_021176	GCT	2	6	3675281	3675286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_021176	TTC	2	6	3675324	3675329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12556	NC_021176	CCAC	2	8	3675484	3675491	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12557	NC_021176	ACA	2	6	3675559	3675564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_021176	GCA	2	6	3675595	3675600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_021176	TGG	2	6	3675610	3675615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_021176	TGAA	2	8	3675753	3675760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_021176	GATA	2	8	3675772	3675779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_021176	CG	3	6	3675846	3675851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12563	NC_021176	T	7	7	3676026	3676032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_021176	T	6	6	3677549	3677554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_021176	CGC	2	6	3677576	3677581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12567	NC_021176	TTCG	2	8	3678220	3678227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_021176	CGC	2	6	3679177	3679182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12569	NC_021176	GTG	2	6	3679187	3679192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_021176	TTA	2	6	3679199	3679204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_021176	ATTA	2	8	3679217	3679224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_021176	TGA	2	6	3679262	3679267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12574	NC_021176	A	6	6	3679477	3679482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12577	NC_021176	T	7	7	3680793	3680799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_021176	ATT	2	6	3680830	3680835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_021176	T	6	6	3681970	3681975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_021176	AG	3	6	3682100	3682105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_021176	AT	4	8	3682123	3682130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12583	NC_021176	CTTT	2	8	3682993	3683000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12584	NC_021176	AC	5	10	3683014	3683023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12586	NC_021176	GGA	2	6	3683060	3683065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12589	NC_021176	GGCA	2	8	3683235	3683242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12590	NC_021176	CGG	3	9	3683246	3683254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12593	NC_021176	GC	3	6	3683453	3683458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12594	NC_021176	TGG	2	6	3683480	3683485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_021176	GCC	2	6	3683504	3683509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12596	NC_021176	CG	3	6	3683527	3683532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12597	NC_021176	GAA	2	6	3683566	3683571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_021176	TGA	2	6	3683594	3683599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_021176	CAC	2	6	3683664	3683669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12600	NC_021176	CG	3	6	3683731	3683736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_021176	ACCA	2	8	3683827	3683834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12602	NC_021176	TCG	2	6	3683861	3683866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12607	NC_021176	CGTG	2	8	3684120	3684127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12608	NC_021176	GAT	2	6	3684142	3684147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_021176	CGT	2	6	3684398	3684403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_021176	GCTGG	2	10	3684414	3684423	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12611	NC_021176	GCA	2	6	3684426	3684431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_021176	GC	3	6	3684440	3684445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_021176	GAT	2	6	3684465	3684470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_021176	GGCG	2	8	3684498	3684505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12615	NC_021176	GCG	3	9	3684503	3684511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_021176	CTG	2	6	3684562	3684567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_021176	GACC	2	8	3684612	3684619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12618	NC_021176	TTG	2	6	3684655	3684660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12623	NC_021176	GAT	2	6	3684813	3684818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12625	NC_021176	GTCGC	2	10	3684895	3684904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12626	NC_021176	GCTG	2	8	3685079	3685086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12627	NC_021176	TCT	2	6	3685154	3685159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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